RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330334.7

HDDC3-201, Transcript of HD domain containing 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HDDC3, Length 1,047 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3-201ENST00000330334 RIMS2Q9UQ26 1411 aa26.89■■□□□ 1.89
HDDC3-201ENST00000330334 DISP3Q9P2K9 1392 aa26.88■■□□□ 1.89
HDDC3-201ENST00000330334 ALKQ9UM73 1620 aa26.88■■□□□ 1.89
HDDC3-201ENST00000330334 NAIPQ13075 1403 aa26.88■■□□□ 1.89
HDDC3-201ENST00000330334 HSPA1LP34931 641 aa26.87■■□□□ 1.89
HDDC3-201ENST00000330334 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
HDDC3-201ENST00000330334 CHGAP10645 457 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
HDDC3-201ENST00000330334 BCANQ96GW7 911 aa26.85■■□□□ 1.89
HDDC3-201ENST00000330334 TBX22Q9Y458 520 aa26.84■■□□□ 1.89
HDDC3-201ENST00000330334 HFM1A2PYH4 1435 aa26.82■■□□□ 1.88
HDDC3-201ENST00000330334 MYO5BQ9ULV0 1848 aa26.8■■□□□ 1.88
HDDC3-201ENST00000330334 TMEM94Q12767 1356 aa26.8■■□□□ 1.88
HDDC3-201ENST00000330334 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
HDDC3-201ENST00000330334 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
HDDC3-201ENST00000330334 NWD1Q149M9 1564 aa26.77■■□□□ 1.88
HDDC3-201ENST00000330334 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
HDDC3-201ENST00000330334 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa26.73■■□□□ 1.87
HDDC3-201ENST00000330334 PIK3R4Q99570 1358 aa26.73■■□□□ 1.87
HDDC3-201ENST00000330334 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa26.72■■□□□ 1.87
HDDC3-201ENST00000330334 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
HDDC3-201ENST00000330334 FAM135BQ49AJ0 1406 aa26.71■■□□□ 1.87
HDDC3-201ENST00000330334 ILDR2Q71H61 639 aa26.7■■□□□ 1.86
HDDC3-201ENST00000330334 DIP2AQ14689 1571 aa26.7■■□□□ 1.86
HDDC3-201ENST00000330334 TRIM52Q96A61 297 aa26.69■■□□□ 1.86
HDDC3-201ENST00000330334 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
HDDC3-201ENST00000330334 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa26.69■■□□□ 1.86
HDDC3-201ENST00000330334 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
HDDC3-201ENST00000330334 TRPM2O94759 1503 aa26.68■■□□□ 1.86
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HDDC3-201ENST00000330334 MSH6P52701 1360 aa26.66■■□□□ 1.86
HDDC3-201ENST00000330334 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
HDDC3-201ENST00000330334 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
HDDC3-201ENST00000330334 CLTCL1P53675 1640 aa26.61■■□□□ 1.85
HDDC3-201ENST00000330334 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa26.6■■□□□ 1.85
HDDC3-201ENST00000330334 SLAIN2Q9P270 581 aa26.6■■□□□ 1.85
HDDC3-201ENST00000330334 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa26.59■■□□□ 1.85
HDDC3-201ENST00000330334 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
HDDC3-201ENST00000330334 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
HDDC3-201ENST00000330334 C19orf44Q9H6X5 657 aa26.57■■□□□ 1.84
HDDC3-201ENST00000330334 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa26.56■■□□□ 1.84
HDDC3-201ENST00000330334 PTPRUQ92729 1446 aa26.56■■□□□ 1.84
HDDC3-201ENST00000330334 SOCS7O14512 581 aa26.55■■□□□ 1.84
HDDC3-201ENST00000330334 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa26.55■■□□□ 1.84
HDDC3-201ENST00000330334 VGFO15240 615 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
HDDC3-201ENST00000330334 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa26.54■■□□□ 1.84
HDDC3-201ENST00000330334 CADPS2Q86UW7 1296 aa26.53■■□□□ 1.84
HDDC3-201ENST00000330334 KIF1BO60333 1816 aa26.52■■□□□ 1.84
HDDC3-201ENST00000330334 C14orf37Q86TY3 774 aa26.52■■□□□ 1.84
HDDC3-201ENST00000330334 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa26.5■■□□□ 1.83
HDDC3-201ENST00000330334 METP08581 1390 aa26.5■■□□□ 1.83
HDDC3-201ENST00000330334 MPHOSPH9Q99550 1183 aa26.5■■□□□ 1.83
HDDC3-201ENST00000330334 ATF3P18847 181 aa26.49■■□□□ 1.83
HDDC3-201ENST00000330334 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.83
HDDC3-201ENST00000330334 FOXD1Q16676 465 aa26.45■■□□□ 1.82
HDDC3-201ENST00000330334 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
HDDC3-201ENST00000330334 DCCP43146 1447 aa26.44■■□□□ 1.82
HDDC3-201ENST00000330334 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.43■■□□□ 1.82
HDDC3-201ENST00000330334 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
HDDC3-201ENST00000330334 CCDC144AA2RUR9 1427 aa26.42■■□□□ 1.82
HDDC3-201ENST00000330334 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa26.37■■□□□ 1.81
HDDC3-201ENST00000330334 PRAG1Q86YV5 1406 aa26.36■■□□□ 1.81
HDDC3-201ENST00000330334 JCADQ9P266 1359 aa26.35■■□□□ 1.81
HDDC3-201ENST00000330334 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa26.34■■□□□ 1.81
HDDC3-201ENST00000330334 PTCH1Q13635 1447 aa26.34■■□□□ 1.81
HDDC3-201ENST00000330334 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa26.34■■□□□ 1.81
HDDC3-201ENST00000330334 PPLO60437 1756 aa26.33■■□□□ 1.81
HDDC3-201ENST00000330334 BRINP3Q76B58 766 aa26.33■■□□□ 1.81
HDDC3-201ENST00000330334 PHLPP1O60346 1717 aa26.32■■□□□ 1.8
HDDC3-201ENST00000330334 RGL3Q3MIN7 710 aa26.32■■□□□ 1.8
HDDC3-201ENST00000330334 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
HDDC3-201ENST00000330334 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
HDDC3-201ENST00000330334 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa26.31■■□□□ 1.8
HDDC3-201ENST00000330334 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
HDDC3-201ENST00000330334 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa26.3■■□□□ 1.8
HDDC3-201ENST00000330334 MST1RQ04912 1400 aa26.3■■□□□ 1.8
HDDC3-201ENST00000330334 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
HDDC3-201ENST00000330334 HRCP23327 699 aa26.29■■□□□ 1.8
HDDC3-201ENST00000330334 ROBO2Q9HCK4 1378 aa26.29■■□□□ 1.8
HDDC3-201ENST00000330334 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa26.26■■□□□ 1.79
HDDC3-201ENST00000330334 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa26.23■■□□□ 1.79
HDDC3-201ENST00000330334 PIK3C2GO75747 1445 aa26.21■■□□□ 1.79
HDDC3-201ENST00000330334 NALCNQ8IZF0 1738 aa26.2■■□□□ 1.79
HDDC3-201ENST00000330334 TECPR2O15040 1411 aa26.19■■□□□ 1.78
HDDC3-201ENST00000330334 IFT172Q9UG01 1749 aa26.19■■□□□ 1.78
HDDC3-201ENST00000330334 ABCC11Q96J66 1382 aa26.19■■□□□ 1.78
HDDC3-201ENST00000330334 C1orf167Q5SNV9 1468 aa26.18■■□□□ 1.78
HDDC3-201ENST00000330334 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
HDDC3-201ENST00000330334 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
HDDC3-201ENST00000330334 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
HDDC3-201ENST00000330334 POTEAQ6S8J7 498 aa26.15■■□□□ 1.78
HDDC3-201ENST00000330334 SIRT1Q96EB6 747 aa26.15■■□□□ 1.78
HDDC3-201ENST00000330334 SHPRHQ149N8 1683 aa26.15■■□□□ 1.78
HDDC3-201ENST00000330334 NRXN1Q9ULB1 1477 aa26.14■■□□□ 1.78
HDDC3-201ENST00000330334 NHSL1Q5SYE7 1610 aa26.14■■□□□ 1.77
HDDC3-201ENST00000330334 TMEM132EQ6IEE7 984 aa26.13■■□□□ 1.77
HDDC3-201ENST00000330334 MYOM2P54296 1465 aa26.12■■□□□ 1.77
HDDC3-201ENST00000330334 STK26Q9P289 416 aa26.12■■□□□ 1.77
HDDC3-201ENST00000330334 LRP6O75581 1613 aa26.1■■□□□ 1.77
HDDC3-201ENST00000330334 ORAI2Q96SN7 254 aa26.1■■□□□ 1.77
HDDC3-201ENST00000330334 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
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