RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000322060.9

PUS1-201, Transcript of pseudouridylate synthase 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene PUS1, Length 1,206 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS1-201ENST00000322060 ZFYVE9O95405 1425 aa28.7■■■□□ 2.19
PUS1-201ENST00000322060 ROCK1Q13464 1354 aa28.7■■■□□ 2.18
PUS1-201ENST00000322060 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa28.69■■■□□ 2.18
PUS1-201ENST00000322060 NWD1Q149M9 1564 aa28.69■■■□□ 2.18
PUS1-201ENST00000322060 BCANQ96GW7 911 aa28.67■■■□□ 2.18
PUS1-201ENST00000322060 RIMS2Q9UQ26 1411 aa28.65■■■□□ 2.18
PUS1-201ENST00000322060 UNC13BO14795 1591 aa28.65■■■□□ 2.18
PUS1-201ENST00000322060 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP28.64■■■□□ 2.18
PUS1-201ENST00000322060 TBX22Q9Y458 520 aa28.64■■■□□ 2.18
PUS1-201ENST00000322060 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa28.64■■■□□ 2.18
PUS1-201ENST00000322060 GCC2Q8IWJ2 1684 aa28.64■■■□□ 2.17
PUS1-201ENST00000322060 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
PUS1-201ENST00000322060 MSH6P52701 1360 aa28.62■■■□□ 2.17
PUS1-201ENST00000322060 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
PUS1-201ENST00000322060 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
PUS1-201ENST00000322060 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa28.59■■■□□ 2.17
PUS1-201ENST00000322060 SLAIN2Q9P270 581 aa28.58■■■□□ 2.17
PUS1-201ENST00000322060 MYO5BQ9ULV0 1848 aa28.57■■■□□ 2.16
PUS1-201ENST00000322060 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa28.57■■■□□ 2.16
PUS1-201ENST00000322060 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
PUS1-201ENST00000322060 E9PCH4 1651 aa28.55■■■□□ 2.16
PUS1-201ENST00000322060 CHGAP10645 457 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
PUS1-201ENST00000322060 IQGAP3Q86VI3 1631 aa28.54■■■□□ 2.16
PUS1-201ENST00000322060 NUP155O75694 1391 aa28.53■■■□□ 2.16
PUS1-201ENST00000322060 PIK3R4Q99570 1358 aa28.53■■■□□ 2.16
PUS1-201ENST00000322060 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa28.52■■■□□ 2.16
PUS1-201ENST00000322060 DIP2AQ14689 1571 aa28.49■■■□□ 2.15
PUS1-201ENST00000322060 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP28.45■■■□□ 2.14
PUS1-201ENST00000322060 C19orf44Q9H6X5 657 aa28.45■■■□□ 2.14
PUS1-201ENST00000322060 ITGAEP38570 1179 aa28.44■■■□□ 2.14
PUS1-201ENST00000322060 JCADQ9P266 1359 aa28.43■■■□□ 2.14
PUS1-201ENST00000322060 CADPS2Q86UW7 1296 aa28.43■■■□□ 2.14
PUS1-201ENST00000322060 POTEAQ6S8J7 498 aa28.42■■■□□ 2.14
PUS1-201ENST00000322060 C14orf37Q86TY3 774 aa28.4■■■□□ 2.14
PUS1-201ENST00000322060 PHLPP1O60346 1717 aa28.4■■■□□ 2.14
PUS1-201ENST00000322060 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa28.39■■■□□ 2.14
PUS1-201ENST00000322060 TRPM2O94759 1503 aa28.38■■■□□ 2.13
PUS1-201ENST00000322060 ATF3P18847 181 aa28.38■■■□□ 2.13
PUS1-201ENST00000322060 PTPRUQ92729 1446 aa28.35■■■□□ 2.13
PUS1-201ENST00000322060 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
PUS1-201ENST00000322060 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
PUS1-201ENST00000322060 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
PUS1-201ENST00000322060 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa28.32■■■□□ 2.12
PUS1-201ENST00000322060 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa28.31■■■□□ 2.12
PUS1-201ENST00000322060 DCCP43146 1447 aa28.3■■■□□ 2.12
PUS1-201ENST00000322060 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa28.29■■■□□ 2.12
PUS1-201ENST00000322060 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
PUS1-201ENST00000322060 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
PUS1-201ENST00000322060 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.12
PUS1-201ENST00000322060 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa28.26■■■□□ 2.11
PUS1-201ENST00000322060 BRINP3Q76B58 766 aa28.25■■■□□ 2.11
PUS1-201ENST00000322060 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
PUS1-201ENST00000322060 METP08581 1390 aa28.24■■■□□ 2.11
PUS1-201ENST00000322060 NAIPQ13075 1403 aa28.22■■■□□ 2.11
PUS1-201ENST00000322060 LRP6O75581 1613 aa28.2■■■□□ 2.1
PUS1-201ENST00000322060 SHPRHQ149N8 1683 aa28.19■■■□□ 2.1
PUS1-201ENST00000322060 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
PUS1-201ENST00000322060 CLTCL1P53675 1640 aa28.18■■■□□ 2.1
PUS1-201ENST00000322060 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa28.18■■■□□ 2.1
PUS1-201ENST00000322060 MST1RQ04912 1400 aa28.17■■■□□ 2.1
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PUS1-201ENST00000322060 SETD5Q9C0A6 1442 aa28.15■■■□□ 2.1
PUS1-201ENST00000322060 VGFO15240 615 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
PUS1-201ENST00000322060 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa28.13■■■□□ 2.09
PUS1-201ENST00000322060 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa28.13■■■□□ 2.09
PUS1-201ENST00000322060 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
PUS1-201ENST00000322060 KIF1BO60333 1816 aa28.1■■■□□ 2.09
PUS1-201ENST00000322060 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa28.1■■■□□ 2.09
PUS1-201ENST00000322060 HFM1A2PYH4 1435 aa28.09■■■□□ 2.09
PUS1-201ENST00000322060 TRIM52Q96A61 297 aa28.07■■■□□ 2.08
PUS1-201ENST00000322060 NHSL1Q5SYE7 1610 aa28.07■■■□□ 2.08
PUS1-201ENST00000322060 PTCH1Q13635 1447 aa28.05■■■□□ 2.08
PUS1-201ENST00000322060 PRAG1Q86YV5 1406 aa28.04■■■□□ 2.08
PUS1-201ENST00000322060 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
PUS1-201ENST00000322060 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
PUS1-201ENST00000322060 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
PUS1-201ENST00000322060 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
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PUS1-201ENST00000322060 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
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PUS1-201ENST00000322060 C1orf167Q5SNV9 1468 aa28■■■□□ 2.07
PUS1-201ENST00000322060 ROBO2Q9HCK4 1378 aa27.99■■■□□ 2.07
PUS1-201ENST00000322060 PNPLA6Q8IY17 1366 aa27.99■■■□□ 2.07
PUS1-201ENST00000322060 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
PUS1-201ENST00000322060 AFF2P51816 1311 aa27.97■■■□□ 2.07
PUS1-201ENST00000322060 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
PUS1-201ENST00000322060 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP27.96■■■□□ 2.07
PUS1-201ENST00000322060 LAMC1P11047 1609 aa27.94■■■□□ 2.06
PUS1-201ENST00000322060 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP27.93■■■□□ 2.06
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PUS1-201ENST00000322060 PPLO60437 1756 aa27.91■■■□□ 2.06
PUS1-201ENST00000322060 C8orf37Q96NL8 207 aa27.9■■■□□ 2.06
PUS1-201ENST00000322060 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
PUS1-201ENST00000322060 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
PUS1-201ENST00000322060 FOXD1Q16676 465 aa27.85■■■□□ 2.05
PUS1-201ENST00000322060 CCDC144AA2RUR9 1427 aa27.84■■■□□ 2.05
PUS1-201ENST00000322060 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa27.84■■■□□ 2.05
PUS1-201ENST00000322060 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa27.84■■■□□ 2.05
PUS1-201ENST00000322060 NGLY1Q96IV0 654 aa27.83■■■□□ 2.05
PUS1-201ENST00000322060 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa27.83■■■□□ 2.05
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