RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317058.7

SGF29-201, Transcript of SAGA complex associated factor 29, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SGF29, Length 1,153 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29-201ENST00000317058 LTKP29376 864 aa25.18■■□□□ 1.62
SGF29-201ENST00000317058 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
SGF29-201ENST00000317058 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP25.18■■□□□ 1.62
SGF29-201ENST00000317058 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
SGF29-201ENST00000317058 ZFYVE9O95405 1425 aa25.17■■□□□ 1.62
SGF29-201ENST00000317058 IQGAP1P46940 1657 aa25.17■■□□□ 1.62
SGF29-201ENST00000317058 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
SGF29-201ENST00000317058 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
SGF29-201ENST00000317058 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa25.11■■□□□ 1.61
SGF29-201ENST00000317058 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa25.1■■□□□ 1.61
SGF29-201ENST00000317058 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa25.09■■□□□ 1.61
SGF29-201ENST00000317058 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa25.08■■□□□ 1.61
SGF29-201ENST00000317058 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
SGF29-201ENST00000317058 BCANQ96GW7 911 aa25.07■■□□□ 1.6
SGF29-201ENST00000317058 PPLO60437 1756 aa25.06■■□□□ 1.6
SGF29-201ENST00000317058 RGL3Q3MIN7 710 aa25.06■■□□□ 1.6
SGF29-201ENST00000317058 VGFO15240 615 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
SGF29-201ENST00000317058 IFT172Q9UG01 1749 aa25.02■■□□□ 1.6
SGF29-201ENST00000317058 SLC26A8Q96RN1 970 aa24.98■■□□□ 1.59
SGF29-201ENST00000317058 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
SGF29-201ENST00000317058 DIP2AQ14689 1571 aa24.97■■□□□ 1.59
SGF29-201ENST00000317058 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa24.97■■□□□ 1.59
SGF29-201ENST00000317058 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
SGF29-201ENST00000317058 TBX22Q9Y458 520 aa24.95■■□□□ 1.58
SGF29-201ENST00000317058 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa24.94■■□□□ 1.58
SGF29-201ENST00000317058 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa24.94■■□□□ 1.58
SGF29-201ENST00000317058 LTBP4Q8N2S1 1624 aa24.92■■□□□ 1.58
SGF29-201ENST00000317058 MYOM2P54296 1465 aa24.91■■□□□ 1.58
SGF29-201ENST00000317058 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.91■■□□□ 1.58
SGF29-201ENST00000317058 STAC3Q96MF2 364 aa24.9■■□□□ 1.58
SGF29-201ENST00000317058 CPS1P31327 1500 aa24.9■■□□□ 1.58
SGF29-201ENST00000317058 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa24.89■■□□□ 1.58
SGF29-201ENST00000317058 NEUROD1Q13562 356 aa24.89■■□□□ 1.58
SGF29-201ENST00000317058 DCAF11Q8TEB1 546 aa24.88■■□□□ 1.57
SGF29-201ENST00000317058 PIK3R4Q99570 1358 aa24.88■■□□□ 1.57
SGF29-201ENST00000317058 STRCP1A6NGW2 1772 aa24.88■■□□□ 1.57
SGF29-201ENST00000317058 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
SGF29-201ENST00000317058 ALKQ9UM73 1620 aa24.86■■□□□ 1.57
SGF29-201ENST00000317058 KCNA6P17658 529 aa24.86■■□□□ 1.57
SGF29-201ENST00000317058 PIK3C2GO75747 1445 aa24.86■■□□□ 1.57
SGF29-201ENST00000317058 NWD1Q149M9 1564 aa24.85■■□□□ 1.57
SGF29-201ENST00000317058 NRXN1Q9ULB1 1477 aa24.85■■□□□ 1.57
SGF29-201ENST00000317058 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa24.85■■□□□ 1.57
SGF29-201ENST00000317058 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
SGF29-201ENST00000317058 CERKQ8TCT0 537 aa24.83■■□□□ 1.57
SGF29-201ENST00000317058 CLSPNQ9HAW4 1339 aa24.83■■□□□ 1.56
SGF29-201ENST00000317058 LAMC1P11047 1609 aa24.82■■□□□ 1.56
SGF29-201ENST00000317058 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
SGF29-201ENST00000317058 METP08581 1390 aa24.8■■□□□ 1.56
SGF29-201ENST00000317058 IQSEC2Q5JU85 1478 aa24.78■■□□□ 1.56
SGF29-201ENST00000317058 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
SGF29-201ENST00000317058 L3MBTL2Q969R5 705 aa24.78■■□□□ 1.56
SGF29-201ENST00000317058 LRRC7Q96NW7 1537 aa24.77■■□□□ 1.56
SGF29-201ENST00000317058 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa24.77■■□□□ 1.56
SGF29-201ENST00000317058 TONSLQ96HA7 1378 aa24.77■■□□□ 1.56
SGF29-201ENST00000317058 PTPRUQ92729 1446 aa24.77■■□□□ 1.56
SGF29-201ENST00000317058 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
SGF29-201ENST00000317058 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
SGF29-201ENST00000317058 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
SGF29-201ENST00000317058 CFAP70Q5T0N1 1121 aa24.73■■□□□ 1.55
SGF29-201ENST00000317058 PRAG1Q86YV5 1406 aa24.7■■□□□ 1.55
SGF29-201ENST00000317058 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.55
SGF29-201ENST00000317058 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa24.7■■□□□ 1.54
SGF29-201ENST00000317058 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa24.7■■□□□ 1.54
SGF29-201ENST00000317058 TMEM94Q12767 1356 aa24.69■■□□□ 1.54
SGF29-201ENST00000317058 TMEM132EQ6IEE7 984 aa24.68■■□□□ 1.54
SGF29-201ENST00000317058 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
SGF29-201ENST00000317058 KNDC1Q76NI1 1749 aa24.66■■□□□ 1.54
SGF29-201ENST00000317058 PTCH1Q13635 1447 aa24.66■■□□□ 1.54
SGF29-201ENST00000317058 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
SGF29-201ENST00000317058 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa24.66■■□□□ 1.54
SGF29-201ENST00000317058 STK26Q9P289 416 aa24.65■■□□□ 1.54
SGF29-201ENST00000317058 ADGRB1O14514 1584 aa24.64■■□□□ 1.54
SGF29-201ENST00000317058 ABCC11Q96J66 1382 aa24.64■■□□□ 1.53
SGF29-201ENST00000317058 TECPR2O15040 1411 aa24.63■■□□□ 1.53
SGF29-201ENST00000317058 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
SGF29-201ENST00000317058 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa24.63■■□□□ 1.53
SGF29-201ENST00000317058 C14orf37Q86TY3 774 aa24.62■■□□□ 1.53
SGF29-201ENST00000317058 ROBO2Q9HCK4 1378 aa24.61■■□□□ 1.53
SGF29-201ENST00000317058 MSH6P52701 1360 aa24.6■■□□□ 1.53
SGF29-201ENST00000317058 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa24.6■■□□□ 1.53
SGF29-201ENST00000317058 UBAP1LF5GYI3 381 aa24.58■■□□□ 1.53
SGF29-201ENST00000317058 TOM1O60784 492 aa24.58■■□□□ 1.53
SGF29-201ENST00000317058 DLC1Q96QB1 1528 aa24.57■■□□□ 1.52
SGF29-201ENST00000317058 FBXO41Q8TF61 875 aa24.57■■□□□ 1.52
SGF29-201ENST00000317058 SIRT1Q96EB6 747 aa24.57■■□□□ 1.52
SGF29-201ENST00000317058 FAM135BQ49AJ0 1406 aa24.56■■□□□ 1.52
SGF29-201ENST00000317058 NBPF1Q3BBV0 1214 aa24.55■■□□□ 1.52
SGF29-201ENST00000317058 NBPF8Q3BBV2 869 aa24.55■■□□□ 1.52
SGF29-201ENST00000317058 C19orf44Q9H6X5 657 aa24.55■■□□□ 1.52
SGF29-201ENST00000317058 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
SGF29-201ENST00000317058 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa24.54■■□□□ 1.52
SGF29-201ENST00000317058 TRAK1Q9UPV9 953 aa24.54■■□□□ 1.52
SGF29-201ENST00000317058 NALCNQ8IZF0 1738 aa24.54■■□□□ 1.52
SGF29-201ENST00000317058 WAPLQ7Z5K2 1190 aa24.52■■□□□ 1.52
SGF29-201ENST00000317058 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
SGF29-201ENST00000317058 DCCP43146 1447 aa24.52■■□□□ 1.52
SGF29-201ENST00000317058 ATF3P18847 181 aa24.51■■□□□ 1.51
SGF29-201ENST00000317058 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
SGF29-201ENST00000317058 CADPS2Q86UW7 1296 aa24.5■■□□□ 1.51
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