RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309576.10

PPARG-202, Transcript of peroxisome proliferator activated receptor gamma, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC

Gene PPARG, Length 1,870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARG-202ENST00000309576 IFT172Q9UG01 1749 aa28.54■■■□□ 2.16
PPARG-202ENST00000309576 MYOM2P54296 1465 aa28.54■■■□□ 2.16
PPARG-202ENST00000309576 PRAG1Q86YV5 1406 aa28.53■■■□□ 2.16
PPARG-202ENST00000309576 ZFYVE9O95405 1425 aa28.52■■■□□ 2.16
PPARG-202ENST00000309576 TMEM2Q9UHN6 1383 aa28.52■■■□□ 2.16
PPARG-202ENST00000309576 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa28.52■■■□□ 2.16
PPARG-202ENST00000309576 PPLO60437 1756 aa28.52■■■□□ 2.16
PPARG-202ENST00000309576 NRXN1Q9ULB1 1477 aa28.51■■■□□ 2.15
PPARG-202ENST00000309576 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
PPARG-202ENST00000309576 RIMS2Q9UQ26 1411 aa28.49■■■□□ 2.15
PPARG-202ENST00000309576 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
PPARG-202ENST00000309576 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
PPARG-202ENST00000309576 VGFO15240 615 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
PPARG-202ENST00000309576 ARHGAP23Q9P227 1491 aa28.47■■■□□ 2.15
PPARG-202ENST00000309576 SLIT1O75093 1534 aa28.47■■■□□ 2.15
PPARG-202ENST00000309576 PIK3C2GO75747 1445 aa28.44■■■□□ 2.14
PPARG-202ENST00000309576 LTKP29376 864 aa28.42■■■□□ 2.14
PPARG-202ENST00000309576 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP28.42■■■□□ 2.14
PPARG-202ENST00000309576 RALGAPBQ86X10 1494 aa28.39■■■□□ 2.14
PPARG-202ENST00000309576 HDGFP51858 240 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
PPARG-202ENST00000309576 TXNDC2Q86VQ3 553 aa28.37■■■□□ 2.13
PPARG-202ENST00000309576 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa28.36■■■□□ 2.13
PPARG-202ENST00000309576 NBPF1Q3BBV0 1214 aa28.36■■■□□ 2.13
PPARG-202ENST00000309576 CFAP70Q5T0N1 1121 aa28.36■■■□□ 2.13
PPARG-202ENST00000309576 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
PPARG-202ENST00000309576 LMTK3Q96Q04 1460 aa28.34■■■□□ 2.13
PPARG-202ENST00000309576 EID1Q9Y6B2 187 aa28.34■■■□□ 2.13
PPARG-202ENST00000309576 GPRASP1Q5JY77 1395 aa28.33■■■□□ 2.13
PPARG-202ENST00000309576 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
PPARG-202ENST00000309576 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa28.31■■■□□ 2.12
PPARG-202ENST00000309576 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
PPARG-202ENST00000309576 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
PPARG-202ENST00000309576 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa28.3■■■□□ 2.12
PPARG-202ENST00000309576 ANKLE2Q86XL3 938 aa28.29■■■□□ 2.12
PPARG-202ENST00000309576 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa28.28■■■□□ 2.12
PPARG-202ENST00000309576 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa28.28■■■□□ 2.12
PPARG-202ENST00000309576 CARD11Q9BXL7 1154 aa28.26■■■□□ 2.11
PPARG-202ENST00000309576 ALKQ9UM73 1620 aa28.26■■■□□ 2.11
PPARG-202ENST00000309576 HSPA2P54652 639 aa28.25■■■□□ 2.11
PPARG-202ENST00000309576 ADGRB1O14514 1584 aa28.25■■■□□ 2.11
PPARG-202ENST00000309576 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa28.25■■■□□ 2.11
PPARG-202ENST00000309576 MED14O60244 1454 aa28.23■■■□□ 2.11
PPARG-202ENST00000309576 LAMC1P11047 1609 aa28.22■■■□□ 2.11
PPARG-202ENST00000309576 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa28.22■■■□□ 2.11
PPARG-202ENST00000309576 TMEM132EQ6IEE7 984 aa28.21■■■□□ 2.11
PPARG-202ENST00000309576 IQGAP1P46940 1657 aa28.21■■■□□ 2.11
PPARG-202ENST00000309576 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
PPARG-202ENST00000309576 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa28.2■■■□□ 2.1
PPARG-202ENST00000309576 METP08581 1390 aa28.17■■■□□ 2.1
PPARG-202ENST00000309576 BCANQ96GW7 911 aa28.17■■■□□ 2.1
PPARG-202ENST00000309576 USP47Q96K76 1375 aa28.17■■■□□ 2.1
PPARG-202ENST00000309576 SLC26A8Q96RN1 970 aa28.17■■■□□ 2.1
PPARG-202ENST00000309576 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP28.16■■■□□ 2.1
PPARG-202ENST00000309576 TBX22Q9Y458 520 aa28.16■■■□□ 2.1
PPARG-202ENST00000309576 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
PPARG-202ENST00000309576 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
PPARG-202ENST00000309576 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.09
PPARG-202ENST00000309576 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
PPARG-202ENST00000309576 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
PPARG-202ENST00000309576 DIP2AQ14689 1571 aa28.1■■■□□ 2.09
PPARG-202ENST00000309576 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
PPARG-202ENST00000309576 TRAK1Q9UPV9 953 aa28.08■■■□□ 2.09
PPARG-202ENST00000309576 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa28.07■■■□□ 2.08
PPARG-202ENST00000309576 STRCQ7RTU9 1775 aa28.06■■■□□ 2.08
PPARG-202ENST00000309576 ABCC11Q96J66 1382 aa28.06■■■□□ 2.08
PPARG-202ENST00000309576 PTPRUQ92729 1446 aa28.05■■■□□ 2.08
PPARG-202ENST00000309576 STK26Q9P289 416 aa28.05■■■□□ 2.08
PPARG-202ENST00000309576 PIK3R4Q99570 1358 aa28.03■■■□□ 2.08
PPARG-202ENST00000309576 TECPR2O15040 1411 aa28.02■■■□□ 2.08
PPARG-202ENST00000309576 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
PPARG-202ENST00000309576 TESK2Q96S53 571 aa28.01■■■□□ 2.07
PPARG-202ENST00000309576 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
PPARG-202ENST00000309576 DLC1Q96QB1 1528 aa27.99■■■□□ 2.07
PPARG-202ENST00000309576 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa27.98■■■□□ 2.07
PPARG-202ENST00000309576 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
PPARG-202ENST00000309576 SIRT1Q96EB6 747 aa27.96■■■□□ 2.07
PPARG-202ENST00000309576 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.07
PPARG-202ENST00000309576 ROBO2Q9HCK4 1378 aa27.95■■■□□ 2.07
PPARG-202ENST00000309576 CPS1P31327 1500 aa27.94■■■□□ 2.06
PPARG-202ENST00000309576 PRAM1Q96QH2 718 aa27.94■■■□□ 2.06
PPARG-202ENST00000309576 KNDC1Q76NI1 1749 aa27.94■■■□□ 2.06
PPARG-202ENST00000309576 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP27.93■■■□□ 2.06
PPARG-202ENST00000309576 FAM135BQ49AJ0 1406 aa27.93■■■□□ 2.06
PPARG-202ENST00000309576 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
PPARG-202ENST00000309576 KCNA6P17658 529 aa27.92■■■□□ 2.06
PPARG-202ENST00000309576 WAPLQ7Z5K2 1190 aa27.92■■■□□ 2.06
PPARG-202ENST00000309576 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa27.92■■■□□ 2.06
PPARG-202ENST00000309576 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa27.92■■■□□ 2.06
PPARG-202ENST00000309576 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
PPARG-202ENST00000309576 PTCH1Q13635 1447 aa27.91■■■□□ 2.06
PPARG-202ENST00000309576 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
PPARG-202ENST00000309576 POGKQ9P215 609 aa27.88■■■□□ 2.05
PPARG-202ENST00000309576 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP27.87■■■□□ 2.05
PPARG-202ENST00000309576 NWD1Q149M9 1564 aa27.87■■■□□ 2.05
PPARG-202ENST00000309576 DMRT2Q9Y5R5 561 aa27.86■■■□□ 2.05
PPARG-202ENST00000309576 WASHC2AQ641Q2 1341 aa27.86■■■□□ 2.05
PPARG-202ENST00000309576 DISP3Q9P2K9 1392 aa27.85■■■□□ 2.05
PPARG-202ENST00000309576 QRICH2Q9H0J4 1663 aa27.85■■■□□ 2.05
PPARG-202ENST00000309576 KIF7Q2M1P5 1343 aa27.82■■■□□ 2.04
PPARG-202ENST00000309576 TMF1P82094 1093 aa27.82■■■□□ 2.04
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