RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 TPM2P07951 284 aa29.55■■■□□ 2.32
GNPTAB-201ENST00000299314 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
GNPTAB-201ENST00000299314 EVC2Q86UK5 1308 aa29.55■■■□□ 2.32
GNPTAB-201ENST00000299314 ANO2Q9NQ90 1003 aa29.55■■■□□ 2.32
GNPTAB-201ENST00000299314 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC70Q6NSX1 233 aa29.53■■■□□ 2.32
GNPTAB-201ENST00000299314 G3V3G9 751 aa29.52■■■□□ 2.32
GNPTAB-201ENST00000299314 DCAF8Q5TAQ9 597 aa29.52■■■□□ 2.32
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM13BQ9NYF5 915 aa29.52■■■□□ 2.32
GNPTAB-201ENST00000299314 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP29.51■■■□□ 2.31
GNPTAB-201ENST00000299314 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa29.5■■■□□ 2.31
GNPTAB-201ENST00000299314 C1orf141Q5JVX7 400 aa29.49■■■□□ 2.31
GNPTAB-201ENST00000299314 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
GNPTAB-201ENST00000299314 WIZO95785 1651 aa29.48■■■□□ 2.31
GNPTAB-201ENST00000299314 PRM3Q9NNZ6 103 aa29.48■■■□□ 2.31
GNPTAB-201ENST00000299314 NGEFQ8N5V2 710 aa29.47■■■□□ 2.31
GNPTAB-201ENST00000299314 BICD2Q8TD16 824 aa29.47■■■□□ 2.31
GNPTAB-201ENST00000299314 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM43AQ8N2R8 423 aa29.46■■■□□ 2.31
GNPTAB-201ENST00000299314 TRIM29Q14134 588 aa29.46■■■□□ 2.31
GNPTAB-201ENST00000299314 NUCB2P80303 420 aa29.46■■■□□ 2.31
GNPTAB-201ENST00000299314 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.31
GNPTAB-201ENST00000299314 RIPK4P57078 832 aa29.45■■■□□ 2.31
GNPTAB-201ENST00000299314 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.31
GNPTAB-201ENST00000299314 ROCK1Q13464 1354 aa29.45■■■□□ 2.31
GNPTAB-201ENST00000299314 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.3
GNPTAB-201ENST00000299314 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.3
GNPTAB-201ENST00000299314 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.3
GNPTAB-201ENST00000299314 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP29.44■■■□□ 2.3
GNPTAB-201ENST00000299314 C22orf23Q9BZE7 217 aa29.43■■■□□ 2.3
GNPTAB-201ENST00000299314 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
GNPTAB-201ENST00000299314 NFKBIBQ15653 356 aa29.43■■■□□ 2.3
GNPTAB-201ENST00000299314 HOMER1Q86YM7 354 aa29.43■■■□□ 2.3
GNPTAB-201ENST00000299314 NEXNQ0ZGT2 675 aa29.42■■■□□ 2.3
GNPTAB-201ENST00000299314 TEFQ10587 303 aa29.42■■■□□ 2.3
GNPTAB-201ENST00000299314 VGFO15240 615 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
GNPTAB-201ENST00000299314 TEX35Q5T0J7 233 aa29.41■■■□□ 2.3
GNPTAB-201ENST00000299314 RUNDC1Q96C34 613 aa29.41■■■□□ 2.3
GNPTAB-201ENST00000299314 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP29.4■■■□□ 2.3
GNPTAB-201ENST00000299314 SMC3Q9UQE7 1217 aa29.4■■■□□ 2.3
GNPTAB-201ENST00000299314 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP29.4■■■□□ 2.3
GNPTAB-201ENST00000299314 RNF20Q5VTR2 975 aa29.4■■■□□ 2.3
GNPTAB-201ENST00000299314 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.3
GNPTAB-201ENST00000299314 CPLX1O14810 134 aa29.39■■■□□ 2.3
GNPTAB-201ENST00000299314 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.29
GNPTAB-201ENST00000299314 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
GNPTAB-201ENST00000299314 SASS6Q6UVJ0 657 aa29.38■■■□□ 2.29
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC7Q96M83 1385 aa29.38■■■□□ 2.29
GNPTAB-201ENST00000299314 NECTIN2Q92692 538 aa29.38■■■□□ 2.29
GNPTAB-201ENST00000299314 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa29.37■■■□□ 2.29
GNPTAB-201ENST00000299314 LNPKQ9C0E8 428 aa29.37■■■□□ 2.29
GNPTAB-201ENST00000299314 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
GNPTAB-201ENST00000299314 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
GNPTAB-201ENST00000299314 CNTLNQ9NXG0 1405 aa29.35■■■□□ 2.29
GNPTAB-201ENST00000299314 KIF7Q2M1P5 1343 aa29.34■■■□□ 2.29
GNPTAB-201ENST00000299314 TTC5Q8N0Z6 440 aa29.33■■■□□ 2.29
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
GNPTAB-201ENST00000299314 IFT57Q9NWB7 429 aa29.33■■■□□ 2.29
GNPTAB-201ENST00000299314 MRE11P49959 708 aa29.32■■■□□ 2.28
GNPTAB-201ENST00000299314 FBXW7Q969H0 707 aa29.32■■■□□ 2.28
GNPTAB-201ENST00000299314 APPP05067 770 aa29.32■■■□□ 2.28
GNPTAB-201ENST00000299314 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP29.32■■■□□ 2.28
GNPTAB-201ENST00000299314 PANK1Q8TE04 598 aa29.32■■■□□ 2.28
GNPTAB-201ENST00000299314 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.31■■■□□ 2.28
GNPTAB-201ENST00000299314 AAMPQ13685 434 aa29.31■■■□□ 2.28
GNPTAB-201ENST00000299314 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP29.31■■■□□ 2.28
GNPTAB-201ENST00000299314 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
GNPTAB-201ENST00000299314 JPH4Q96JJ6 628 aa29.3■■■□□ 2.28
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC39Q9UFE4 941 aa29.29■■■□□ 2.28
GNPTAB-201ENST00000299314 CDC45O75419 566 aa29.29■■■□□ 2.28
GNPTAB-201ENST00000299314 NASPP49321 788 aaPredicted RBP29.28■■■□□ 2.28
GNPTAB-201ENST00000299314 TRDNQ13061 729 aa29.28■■■□□ 2.28
GNPTAB-201ENST00000299314 GNAI1P63096 354 aa29.27■■■□□ 2.28
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa29.27■■■□□ 2.28
GNPTAB-201ENST00000299314 AMOTL1Q8IY63 956 aa29.27■■■□□ 2.28
GNPTAB-201ENST00000299314 DDX58O95786 925 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.28
GNPTAB-201ENST00000299314 FOSBP53539 338 aa29.26■■■□□ 2.28
GNPTAB-201ENST00000299314 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP29.26■■■□□ 2.27
GNPTAB-201ENST00000299314 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.27
GNPTAB-201ENST00000299314 NFXL1Q6ZNB6 911 aa29.26■■■□□ 2.27
GNPTAB-201ENST00000299314 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP29.26■■■□□ 2.27
GNPTAB-201ENST00000299314 MNS1Q8NEH6 495 aa29.25■■■□□ 2.27
GNPTAB-201ENST00000299314 ERC2O15083 957 aa29.25■■■□□ 2.27
GNPTAB-201ENST00000299314 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.24■■■□□ 2.27
GNPTAB-201ENST00000299314 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa29.24■■■□□ 2.27
GNPTAB-201ENST00000299314 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
GNPTAB-201ENST00000299314 TSPYL4Q9UJ04 414 aa29.21■■■□□ 2.27
GNPTAB-201ENST00000299314 TRAK2O60296 914 aa29.2■■■□□ 2.26
GNPTAB-201ENST00000299314 ERICH2A1L162 156 aa29.19■■■□□ 2.26
GNPTAB-201ENST00000299314 RAD21O60216 631 aa29.19■■■□□ 2.26
GNPTAB-201ENST00000299314 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
GNPTAB-201ENST00000299314 RNF214Q8ND24 703 aa29.17■■■□□ 2.26
GNPTAB-201ENST00000299314 RUFY1Q96T51 708 aa29.17■■■□□ 2.26
GNPTAB-201ENST00000299314 ACBD3Q9H3P7 528 aa29.17■■■□□ 2.26
GNPTAB-201ENST00000299314 AK7Q96M32 723 aa29.17■■■□□ 2.26
GNPTAB-201ENST00000299314 HMOX1P09601 288 aa29.17■■■□□ 2.26
GNPTAB-201ENST00000299314 WWC1Q8IX03 1113 aa29.17■■■□□ 2.26
GNPTAB-201ENST00000299314 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
GNPTAB-201ENST00000299314 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
GNPTAB-201ENST00000299314 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.7 ms