RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293889.10

CCDC78-201, Transcript of coiled-coil domain containing 78, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC78, Length 1,611 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78-201ENST00000293889 ARHGAP23Q9P227 1491 aa25.56■■□□□ 1.68
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CCDC78-201ENST00000293889 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
CCDC78-201ENST00000293889 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa25.54■■□□□ 1.68
CCDC78-201ENST00000293889 TMEM2Q9UHN6 1383 aa25.54■■□□□ 1.68
CCDC78-201ENST00000293889 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa25.52■■□□□ 1.68
CCDC78-201ENST00000293889 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa25.5■■□□□ 1.67
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CCDC78-201ENST00000293889 ANKLE2Q86XL3 938 aa25.48■■□□□ 1.67
CCDC78-201ENST00000293889 ZFYVE9O95405 1425 aa25.48■■□□□ 1.67
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CCDC78-201ENST00000293889 IFT172Q9UG01 1749 aa25.46■■□□□ 1.67
CCDC78-201ENST00000293889 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa25.46■■□□□ 1.67
CCDC78-201ENST00000293889 TXNDC2Q86VQ3 553 aa25.45■■□□□ 1.67
CCDC78-201ENST00000293889 MED14O60244 1454 aa25.45■■□□□ 1.66
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CCDC78-201ENST00000293889 IQGAP1P46940 1657 aa25.44■■□□□ 1.66
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CCDC78-201ENST00000293889 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa25.41■■□□□ 1.66
CCDC78-201ENST00000293889 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
CCDC78-201ENST00000293889 PRAG1Q86YV5 1406 aa25.41■■□□□ 1.66
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CCDC78-201ENST00000293889 PIK3C2GO75747 1445 aa25.32■■□□□ 1.64
CCDC78-201ENST00000293889 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa25.31■■□□□ 1.64
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CCDC78-201ENST00000293889 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa25.27■■□□□ 1.64
CCDC78-201ENST00000293889 CFAP70Q5T0N1 1121 aa25.27■■□□□ 1.64
CCDC78-201ENST00000293889 NBPF1Q3BBV0 1214 aa25.26■■□□□ 1.63
CCDC78-201ENST00000293889 SLC26A8Q96RN1 970 aa25.26■■□□□ 1.63
CCDC78-201ENST00000293889 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa25.26■■□□□ 1.63
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CCDC78-201ENST00000293889 STRCP1A6NGW2 1772 aa25.24■■□□□ 1.63
CCDC78-201ENST00000293889 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
CCDC78-201ENST00000293889 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
CCDC78-201ENST00000293889 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa25.23■■□□□ 1.63
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CCDC78-201ENST00000293889 LTBP4Q8N2S1 1624 aa25.2■■□□□ 1.63
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CCDC78-201ENST00000293889 CPS1P31327 1500 aa25.09■■□□□ 1.61
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CCDC78-201ENST00000293889 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
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CCDC78-201ENST00000293889 TRAK1Q9UPV9 953 aa25.04■■□□□ 1.6
CCDC78-201ENST00000293889 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
CCDC78-201ENST00000293889 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
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CCDC78-201ENST00000293889 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa25.01■■□□□ 1.59
CCDC78-201ENST00000293889 ABCC11Q96J66 1382 aa24.99■■□□□ 1.59
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CCDC78-201ENST00000293889 IQSEC2Q5JU85 1478 aa24.94■■□□□ 1.58
CCDC78-201ENST00000293889 DLC1Q96QB1 1528 aa24.93■■□□□ 1.58
CCDC78-201ENST00000293889 ROBO2Q9HCK4 1378 aa24.93■■□□□ 1.58
CCDC78-201ENST00000293889 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
CCDC78-201ENST00000293889 PTCH1Q13635 1447 aa24.92■■□□□ 1.58
CCDC78-201ENST00000293889 PRAM1Q96QH2 718 aa24.92■■□□□ 1.58
CCDC78-201ENST00000293889 TESK2Q96S53 571 aa24.92■■□□□ 1.58
CCDC78-201ENST00000293889 WAPLQ7Z5K2 1190 aa24.9■■□□□ 1.58
CCDC78-201ENST00000293889 SIRT1Q96EB6 747 aa24.9■■□□□ 1.58
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