RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293778.10

CXCL16-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 16, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXCL16, Length 2,222 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CXCL16-201ENST00000293778 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa26.7■■□□□ 1.86
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CXCL16-201ENST00000293778 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.54■■□□□ 1.84
CXCL16-201ENST00000293778 IDI1Q13907 227 aa26.51■■□□□ 1.84
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CXCL16-201ENST00000293778 DIP2BQ9P265 1576 aa26.5■■□□□ 1.83
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CXCL16-201ENST00000293778 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa26.43■■□□□ 1.82
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CXCL16-201ENST00000293778 REREQ9P2R6 1566 aa26.36■■□□□ 1.81
CXCL16-201ENST00000293778 USP32Q8NFA0 1604 aa26.36■■□□□ 1.81
CXCL16-201ENST00000293778 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
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CXCL16-201ENST00000293778 PLIN1O60240 522 aa26.33■■□□□ 1.8
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