RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289388.3

CATIP-201, Transcript of ciliogenesis associated TTC17 interacting protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CATIP, Length 1,323 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATIP-201ENST00000289388 RIMS2Q9UQ26 1411 aa40.95■■■■■ 4.15
CATIP-201ENST00000289388 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP40.94■■■■■ 4.15
CATIP-201ENST00000289388 IQGAP1P46940 1657 aa40.93■■■■■ 4.14
CATIP-201ENST00000289388 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa40.91■■■■■ 4.14
CATIP-201ENST00000289388 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP40.85■■■■■ 4.13
CATIP-201ENST00000289388 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa40.83■■■■■ 4.13
CATIP-201ENST00000289388 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa40.81■■■■■ 4.12
CATIP-201ENST00000289388 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa40.8■■■■■ 4.12
CATIP-201ENST00000289388 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP40.8■■■■■ 4.12
CATIP-201ENST00000289388 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa40.78■■■■■ 4.12
CATIP-201ENST00000289388 PCGF6Q9BYE7 350 aa40.71■■■■■ 4.11
CATIP-201ENST00000289388 VGFO15240 615 aaPredicted RBP40.69■■■■■ 4.11
CATIP-201ENST00000289388 PPLO60437 1756 aa40.68■■■■■ 4.1
CATIP-201ENST00000289388 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP40.68■■■■■ 4.1
CATIP-201ENST00000289388 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP40.67■■■■■ 4.1
CATIP-201ENST00000289388 LTBP4Q8N2S1 1624 aa40.66■■■■■ 4.1
CATIP-201ENST00000289388 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP40.66■■■■■ 4.1
CATIP-201ENST00000289388 BCANQ96GW7 911 aa40.66■■■■■ 4.1
CATIP-201ENST00000289388 RGL3Q3MIN7 710 aa40.65■■■■■ 4.1
CATIP-201ENST00000289388 TBX22Q9Y458 520 aa40.64■■■■■ 4.1
CATIP-201ENST00000289388 DIP2AQ14689 1571 aa40.63■■■■■ 4.09
CATIP-201ENST00000289388 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa40.62■■■■■ 4.09
CATIP-201ENST00000289388 IFT172Q9UG01 1749 aa40.62■■■■■ 4.09
CATIP-201ENST00000289388 SLC26A8Q96RN1 970 aa40.61■■■■■ 4.09
CATIP-201ENST00000289388 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa40.59■■■■■ 4.09
CATIP-201ENST00000289388 CPS1P31327 1500 aa40.58■■■■■ 4.09
CATIP-201ENST00000289388 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa40.55■■■■■ 4.08
CATIP-201ENST00000289388 PIK3R4Q99570 1358 aa40.54■■■■■ 4.08
CATIP-201ENST00000289388 CERKQ8TCT0 537 aa40.53■■■■■ 4.08
CATIP-201ENST00000289388 STAC3Q96MF2 364 aa40.52■■■■■ 4.08
CATIP-201ENST00000289388 KCNA6P17658 529 aa40.5■■■■■ 4.07
CATIP-201ENST00000289388 STRCP1A6NGW2 1772 aa40.49■■■■■ 4.07
CATIP-201ENST00000289388 IQSEC2Q5JU85 1478 aa40.48■■■■■ 4.07
CATIP-201ENST00000289388 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP40.48■■■■■ 4.07
CATIP-201ENST00000289388 MYOM2P54296 1465 aa40.47■■■■■ 4.07
CATIP-201ENST00000289388 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP40.45■■■■■ 4.07
CATIP-201ENST00000289388 NWD1Q149M9 1564 aa40.45■■■■■ 4.07
CATIP-201ENST00000289388 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa40.45■■■■■ 4.07
CATIP-201ENST00000289388 NRXN1Q9ULB1 1477 aa40.42■■■■■ 4.06
CATIP-201ENST00000289388 ALKQ9UM73 1620 aa40.4■■■■■ 4.06
CATIP-201ENST00000289388 PIK3C2GO75747 1445 aa40.4■■■■■ 4.06
CATIP-201ENST00000289388 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP40.39■■■■■ 4.06
CATIP-201ENST00000289388 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP40.38■■■■■ 4.05
CATIP-201ENST00000289388 DCAF11Q8TEB1 546 aa40.36■■■■■ 4.05
CATIP-201ENST00000289388 LRRC7Q96NW7 1537 aa40.35■■■■■ 4.05
CATIP-201ENST00000289388 SIN3AQ96ST3 1273 aa40.35■■■■■ 4.05
CATIP-201ENST00000289388 METP08581 1390 aa40.34■■■■■ 4.05
CATIP-201ENST00000289388 PTPRUQ92729 1446 aa40.3■■■■■ 4.04
CATIP-201ENST00000289388 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa40.29■■■■■ 4.04
CATIP-201ENST00000289388 LAMC1P11047 1609 aa40.28■■■■■ 4.04
CATIP-201ENST00000289388 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP40.27■■■■■ 4.04
CATIP-201ENST00000289388 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP40.27■■■■■ 4.04
CATIP-201ENST00000289388 NEUROD1Q13562 356 aa40.26■■■■■ 4.04
CATIP-201ENST00000289388 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa40.26■■■■■ 4.04
CATIP-201ENST00000289388 CLSPNQ9HAW4 1339 aa40.26■■■■■ 4.04
CATIP-201ENST00000289388 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP40.25■■■■■ 4.03
CATIP-201ENST00000289388 PRAG1Q86YV5 1406 aa40.22■■■■■ 4.03
CATIP-201ENST00000289388 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa40.22■■■■■ 4.03
CATIP-201ENST00000289388 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP40.21■■■■■ 4.03
CATIP-201ENST00000289388 TMEM94Q12767 1356 aa40.2■■■■■ 4.03
CATIP-201ENST00000289388 L3MBTL2Q969R5 705 aa40.19■■■■■ 4.02
CATIP-201ENST00000289388 FBXO41Q8TF61 875 aa40.17■■■■■ 4.02
CATIP-201ENST00000289388 CFAP70Q5T0N1 1121 aa40.16■■■■■ 4.02
CATIP-201ENST00000289388 PTCH1Q13635 1447 aa40.13■■■■■ 4.01
CATIP-201ENST00000289388 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa40.13■■■■■ 4.01
CATIP-201ENST00000289388 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP40.12■■■■■ 4.01
CATIP-201ENST00000289388 ABCC11Q96J66 1382 aa40.1■■■■■ 4.01
CATIP-201ENST00000289388 TECPR2O15040 1411 aa40.1■■■■■ 4.01
CATIP-201ENST00000289388 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa40.09■■■■■ 4.01
CATIP-201ENST00000289388 TMEM132EQ6IEE7 984 aa40.08■■■■■ 4.01
CATIP-201ENST00000289388 TONSLQ96HA7 1378 aa40.07■■■■■ 4.01
CATIP-201ENST00000289388 KNDC1Q76NI1 1749 aa40.07■■■■■ 4.01
CATIP-201ENST00000289388 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP40.07■■■■■ 4.01
CATIP-201ENST00000289388 TOM1O60784 492 aa40.06■■■■■ 4
CATIP-201ENST00000289388 ADGRB1O14514 1584 aa40.05■■■■■ 4
CATIP-201ENST00000289388 MSH6P52701 1360 aa40.04■■■■■ 4
CATIP-201ENST00000289388 UBAP1LF5GYI3 381 aa40.03■■■■■ 4
CATIP-201ENST00000289388 SIRT1Q96EB6 747 aa40.03■■■■■ 4
CATIP-201ENST00000289388 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP40.02■■■■■ 4
CATIP-201ENST00000289388 ROBO2Q9HCK4 1378 aa40.02■■■■■ 4
CATIP-201ENST00000289388 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP40.01■■■■■ 4
CATIP-201ENST00000289388 C19orf44Q9H6X5 657 aa39.99■■■■□ 3.99
CATIP-201ENST00000289388 STK26Q9P289 416 aa39.98■■■■□ 3.99
CATIP-201ENST00000289388 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa39.97■■■■□ 3.99
CATIP-201ENST00000289388 C14orf37Q86TY3 774 aa39.96■■■■□ 3.99
CATIP-201ENST00000289388 FAM135BQ49AJ0 1406 aa39.96■■■■□ 3.99
CATIP-201ENST00000289388 DLC1Q96QB1 1528 aa39.94■■■■□ 3.98
CATIP-201ENST00000289388 DCCP43146 1447 aa39.94■■■■□ 3.98
CATIP-201ENST00000289388 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa39.93■■■■□ 3.98
CATIP-201ENST00000289388 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP39.92■■■■□ 3.98
CATIP-201ENST00000289388 CADPS2Q86UW7 1296 aa39.9■■■■□ 3.98
CATIP-201ENST00000289388 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP39.88■■■■□ 3.97
CATIP-201ENST00000289388 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa39.87■■■■□ 3.97
CATIP-201ENST00000289388 NALCNQ8IZF0 1738 aa39.86■■■■□ 3.97
CATIP-201ENST00000289388 ATF3P18847 181 aa39.86■■■■□ 3.97
CATIP-201ENST00000289388 NBPF1Q3BBV0 1214 aa39.84■■■■□ 3.97
CATIP-201ENST00000289388 WAPLQ7Z5K2 1190 aa39.83■■■■□ 3.97
CATIP-201ENST00000289388 NBPF8Q3BBV2 869 aa39.82■■■■□ 3.96
CATIP-201ENST00000289388 TRAK1Q9UPV9 953 aa39.82■■■■□ 3.96
CATIP-201ENST00000289388 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa39.79■■■■□ 3.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms