RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255198.2

ZBED3-201, Transcript of zinc finger BED-type containing 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED3, Length 6,172 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3-201ENST00000255198 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
ZBED3-201ENST00000255198 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa25.02■■□□□ 1.6
ZBED3-201ENST00000255198 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
ZBED3-201ENST00000255198 COG6Q9Y2V7 657 aa25.02■■□□□ 1.6
ZBED3-201ENST00000255198 FYB1O15117 783 aa25.01■■□□□ 1.59
ZBED3-201ENST00000255198 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
ZBED3-201ENST00000255198 BICD2Q8TD16 824 aa25.01■■□□□ 1.59
ZBED3-201ENST00000255198 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
ZBED3-201ENST00000255198 CHMP4CQ96CF2 233 aa25■■□□□ 1.59
ZBED3-201ENST00000255198 CRBNQ96SW2 442 aa25■■□□□ 1.59
ZBED3-201ENST00000255198 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP25■■□□□ 1.59
ZBED3-201ENST00000255198 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
ZBED3-201ENST00000255198 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
ZBED3-201ENST00000255198 PDE3BQ13370 1112 aa25■■□□□ 1.59
ZBED3-201ENST00000255198 HOMER1Q86YM7 354 aa25■■□□□ 1.59
ZBED3-201ENST00000255198 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa24.99■■□□□ 1.59
ZBED3-201ENST00000255198 RUFY2Q8WXA3 655 aa24.99■■□□□ 1.59
ZBED3-201ENST00000255198 KDM4AO75164 1064 aa24.99■■□□□ 1.59
ZBED3-201ENST00000255198 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
ZBED3-201ENST00000255198 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
ZBED3-201ENST00000255198 FAM161AQ3B820 660 aa24.98■■□□□ 1.59
ZBED3-201ENST00000255198 KIF15Q9NS87 1388 aa24.98■■□□□ 1.59
ZBED3-201ENST00000255198 TRDNQ13061 729 aa24.97■■□□□ 1.59
ZBED3-201ENST00000255198 EXOC6Q8TAG9 804 aa24.97■■□□□ 1.59
ZBED3-201ENST00000255198 MTMR7Q9Y216 660 aa24.97■■□□□ 1.59
ZBED3-201ENST00000255198 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
ZBED3-201ENST00000255198 ERICH2A1L162 156 aa24.96■■□□□ 1.59
ZBED3-201ENST00000255198 PDE4AP27815 886 aa24.95■■□□□ 1.58
ZBED3-201ENST00000255198 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
ZBED3-201ENST00000255198 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
ZBED3-201ENST00000255198 FMN1Q68DA7 1419 aa24.94■■□□□ 1.58
ZBED3-201ENST00000255198 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa24.94■■□□□ 1.58
ZBED3-201ENST00000255198 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
ZBED3-201ENST00000255198 CGNL1Q0VF96 1302 aa24.93■■□□□ 1.58
ZBED3-201ENST00000255198 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.93■■□□□ 1.58
ZBED3-201ENST00000255198 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
ZBED3-201ENST00000255198 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP24.92■■□□□ 1.58
ZBED3-201ENST00000255198 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.92■■□□□ 1.58
ZBED3-201ENST00000255198 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
ZBED3-201ENST00000255198 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
ZBED3-201ENST00000255198 E9PSI1 815 aa24.91■■□□□ 1.58
ZBED3-201ENST00000255198 CCDC27Q2M243 656 aa24.9■■□□□ 1.58
ZBED3-201ENST00000255198 PSME1Q06323 249 aa24.9■■□□□ 1.58
ZBED3-201ENST00000255198 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
ZBED3-201ENST00000255198 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
ZBED3-201ENST00000255198 ODF2Q5BJF6 829 aa24.89■■□□□ 1.58
ZBED3-201ENST00000255198 EVC2Q86UK5 1308 aa24.89■■□□□ 1.58
ZBED3-201ENST00000255198 REC8O95072 547 aa24.88■■□□□ 1.57
ZBED3-201ENST00000255198 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa24.88■■□□□ 1.57
ZBED3-201ENST00000255198 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
ZBED3-201ENST00000255198 DDX58O95786 925 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
ZBED3-201ENST00000255198 NEUROD6Q96NK8 337 aa24.87■■□□□ 1.57
ZBED3-201ENST00000255198 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
ZBED3-201ENST00000255198 RRP1P56182 461 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
ZBED3-201ENST00000255198 GSE1Q14687 1217 aa24.86■■□□□ 1.57
ZBED3-201ENST00000255198 RNF20Q5VTR2 975 aa24.86■■□□□ 1.57
ZBED3-201ENST00000255198 RIPK4P57078 832 aa24.86■■□□□ 1.57
ZBED3-201ENST00000255198 SASS6Q6UVJ0 657 aa24.86■■□□□ 1.57
ZBED3-201ENST00000255198 RUFY1Q96T51 708 aa24.86■■□□□ 1.57
ZBED3-201ENST00000255198 APAF1O14727 1248 aa24.85■■□□□ 1.57
ZBED3-201ENST00000255198 SMC3Q9UQE7 1217 aa24.85■■□□□ 1.57
ZBED3-201ENST00000255198 WASHC4Q2M389 1173 aa24.85■■□□□ 1.57
ZBED3-201ENST00000255198 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
ZBED3-201ENST00000255198 CCDC144AA2RUR9 1427 aa24.83■■□□□ 1.57
ZBED3-201ENST00000255198 EPS15P42566 896 aa24.82■■□□□ 1.56
ZBED3-201ENST00000255198 VSIG10Q8N0Z9 540 aa24.82■■□□□ 1.56
ZBED3-201ENST00000255198 FAM13BQ9NYF5 915 aa24.82■■□□□ 1.56
ZBED3-201ENST00000255198 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP24.81■■□□□ 1.56
ZBED3-201ENST00000255198 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa24.81■■□□□ 1.56
ZBED3-201ENST00000255198 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
ZBED3-201ENST00000255198 IKQ13123 557 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
ZBED3-201ENST00000255198 TEX35Q5T0J7 233 aa24.81■■□□□ 1.56
ZBED3-201ENST00000255198 DDX19BQ9UMR2 479 aa24.81■■□□□ 1.56
ZBED3-201ENST00000255198 TTLL5Q6EMB2 1281 aa24.8■■□□□ 1.56
ZBED3-201ENST00000255198 PDILTQ8N807 584 aa24.8■■□□□ 1.56
ZBED3-201ENST00000255198 ABCC8Q09428 1581 aa24.8■■□□□ 1.56
ZBED3-201ENST00000255198 RSPH6AQ9H0K4 717 aa24.8■■□□□ 1.56
ZBED3-201ENST00000255198 TSPYL4Q9UJ04 414 aa24.8■■□□□ 1.56
ZBED3-201ENST00000255198 RIC3Q7Z5B4 369 aa24.8■■□□□ 1.56
ZBED3-201ENST00000255198 IFT57Q9NWB7 429 aa24.79■■□□□ 1.56
ZBED3-201ENST00000255198 SKIDA1Q1XH10 827 aa24.79■■□□□ 1.56
ZBED3-201ENST00000255198 FAM177BA6PVY3 158 aa24.79■■□□□ 1.56
ZBED3-201ENST00000255198 NUTM2GQ5VZR2 741 aa24.79■■□□□ 1.56
ZBED3-201ENST00000255198 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP24.79■■□□□ 1.56
ZBED3-201ENST00000255198 AK7Q96M32 723 aa24.79■■□□□ 1.56
ZBED3-201ENST00000255198 VGFO15240 615 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
ZBED3-201ENST00000255198 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
ZBED3-201ENST00000255198 HMOX1P09601 288 aa24.78■■□□□ 1.56
ZBED3-201ENST00000255198 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.78■■□□□ 1.56
ZBED3-201ENST00000255198 TMEM132AQ24JP5 1023 aa24.77■■□□□ 1.56
ZBED3-201ENST00000255198 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
ZBED3-201ENST00000255198 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa24.77■■□□□ 1.56
ZBED3-201ENST00000255198 MNS1Q8NEH6 495 aa24.76■■□□□ 1.55
ZBED3-201ENST00000255198 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
ZBED3-201ENST00000255198 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
ZBED3-201ENST00000255198 OFD1O75665 1012 aa24.74■■□□□ 1.55
ZBED3-201ENST00000255198 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
ZBED3-201ENST00000255198 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
ZBED3-201ENST00000255198 UACAQ9BZF9 1416 aa24.74■■□□□ 1.55
ZBED3-201ENST00000255198 LNPKQ9C0E8 428 aa24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14 ms