RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000254301.13

LGALS3-201, Transcript of galectin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LGALS3, Length 1,146 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGALS3-201ENST00000254301 BCANQ96GW7 911 aa41.01■■■■■ 4.16
LGALS3-201ENST00000254301 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP40.98■■■■■ 4.15
LGALS3-201ENST00000254301 SLC26A8Q96RN1 970 aa40.98■■■■■ 4.15
LGALS3-201ENST00000254301 MYO5BQ9ULV0 1848 aa40.97■■■■■ 4.15
LGALS3-201ENST00000254301 TRPM2O94759 1503 aa40.95■■■■■ 4.15
LGALS3-201ENST00000254301 MPHOSPH9Q99550 1183 aa40.95■■■■■ 4.15
LGALS3-201ENST00000254301 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP40.94■■■■■ 4.14
LGALS3-201ENST00000254301 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP40.94■■■■■ 4.14
LGALS3-201ENST00000254301 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa40.94■■■■■ 4.14
LGALS3-201ENST00000254301 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP40.91■■■■■ 4.14
LGALS3-201ENST00000254301 FOXD1Q16676 465 aa40.9■■■■■ 4.14
LGALS3-201ENST00000254301 UBAP1LF5GYI3 381 aa40.89■■■■■ 4.14
LGALS3-201ENST00000254301 CLTCL1P53675 1640 aa40.87■■■■■ 4.13
LGALS3-201ENST00000254301 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa40.86■■■■■ 4.13
LGALS3-201ENST00000254301 KCNA6P17658 529 aa40.84■■■■■ 4.13
LGALS3-201ENST00000254301 STRCP1A6NGW2 1772 aa40.84■■■■■ 4.13
LGALS3-201ENST00000254301 LRRC7Q96NW7 1537 aa40.83■■■■■ 4.13
LGALS3-201ENST00000254301 TBX22Q9Y458 520 aa40.8■■■■■ 4.12
LGALS3-201ENST00000254301 TOM1O60784 492 aa40.77■■■■■ 4.12
LGALS3-201ENST00000254301 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa40.72■■■■■ 4.11
LGALS3-201ENST00000254301 KIF1BO60333 1816 aa40.7■■■■■ 4.11
LGALS3-201ENST00000254301 HRCP23327 699 aa40.7■■■■■ 4.11
LGALS3-201ENST00000254301 CCDC144AA2RUR9 1427 aa40.69■■■■■ 4.1
LGALS3-201ENST00000254301 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP40.68■■■■■ 4.1
LGALS3-201ENST00000254301 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa40.65■■■■■ 4.1
LGALS3-201ENST00000254301 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa40.65■■■■■ 4.1
LGALS3-201ENST00000254301 PIP4K2BP78356 416 aa40.64■■■■■ 4.1
LGALS3-201ENST00000254301 TMEM94Q12767 1356 aa40.63■■■■■ 4.1
LGALS3-201ENST00000254301 DIP2AQ14689 1571 aa40.63■■■■■ 4.09
LGALS3-201ENST00000254301 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP40.63■■■■■ 4.09
LGALS3-201ENST00000254301 NWD1Q149M9 1564 aa40.62■■■■■ 4.09
LGALS3-201ENST00000254301 VGFO15240 615 aaPredicted RBP40.62■■■■■ 4.09
LGALS3-201ENST00000254301 PIK3R4Q99570 1358 aa40.61■■■■■ 4.09
LGALS3-201ENST00000254301 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP40.61■■■■■ 4.09
LGALS3-201ENST00000254301 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP40.6■■■■■ 4.09
LGALS3-201ENST00000254301 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa40.57■■■■■ 4.09
LGALS3-201ENST00000254301 RGL3Q3MIN7 710 aa40.55■■■■■ 4.08
LGALS3-201ENST00000254301 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP40.54■■■■■ 4.08
LGALS3-201ENST00000254301 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa40.53■■■■■ 4.08
LGALS3-201ENST00000254301 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa40.52■■■■■ 4.08
LGALS3-201ENST00000254301 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa40.5■■■■■ 4.07
LGALS3-201ENST00000254301 ALKQ9UM73 1620 aa40.5■■■■■ 4.07
LGALS3-201ENST00000254301 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP40.49■■■■■ 4.07
LGALS3-201ENST00000254301 PTPRUQ92729 1446 aa40.48■■■■■ 4.07
LGALS3-201ENST00000254301 METP08581 1390 aa40.47■■■■■ 4.07
LGALS3-201ENST00000254301 MSH6P52701 1360 aa40.42■■■■■ 4.06
LGALS3-201ENST00000254301 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa40.42■■■■■ 4.06
LGALS3-201ENST00000254301 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa40.41■■■■■ 4.06
LGALS3-201ENST00000254301 PPLO60437 1756 aa40.39■■■■■ 4.06
LGALS3-201ENST00000254301 HSPA1LP34931 641 aa40.39■■■■■ 4.06
LGALS3-201ENST00000254301 C14orf37Q86TY3 774 aa40.39■■■■■ 4.06
LGALS3-201ENST00000254301 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa40.38■■■■■ 4.05
LGALS3-201ENST00000254301 C19orf44Q9H6X5 657 aa40.3■■■■■ 4.04
LGALS3-201ENST00000254301 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP40.29■■■■■ 4.04
LGALS3-201ENST00000254301 FAM135BQ49AJ0 1406 aa40.26■■■■■ 4.04
LGALS3-201ENST00000254301 SLAIN2Q9P270 581 aa40.26■■■■■ 4.04
LGALS3-201ENST00000254301 ATF3P18847 181 aa40.23■■■■■ 4.03
LGALS3-201ENST00000254301 IFT172Q9UG01 1749 aa40.22■■■■■ 4.03
LGALS3-201ENST00000254301 CADPS2Q86UW7 1296 aa40.22■■■■■ 4.03
LGALS3-201ENST00000254301 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP40.21■■■■■ 4.03
LGALS3-201ENST00000254301 PIK3C2GO75747 1445 aa40.19■■■■■ 4.02
LGALS3-201ENST00000254301 PTCH1Q13635 1447 aa40.15■■■■■ 4.02
LGALS3-201ENST00000254301 MYOM2P54296 1465 aa40.14■■■■■ 4.02
LGALS3-201ENST00000254301 ROBO2Q9HCK4 1378 aa40.13■■■■■ 4.02
LGALS3-201ENST00000254301 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP40.13■■■■■ 4.01
LGALS3-201ENST00000254301 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP40.13■■■■■ 4.01
LGALS3-201ENST00000254301 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP40.12■■■■■ 4.01
LGALS3-201ENST00000254301 PRAG1Q86YV5 1406 aa40.11■■■■■ 4.01
LGALS3-201ENST00000254301 TMEM132EQ6IEE7 984 aa40.11■■■■■ 4.01
LGALS3-201ENST00000254301 NRXN1Q9ULB1 1477 aa40.11■■■■■ 4.01
LGALS3-201ENST00000254301 DCAF11Q8TEB1 546 aa40.1■■■■■ 4.01
LGALS3-201ENST00000254301 DCCP43146 1447 aa40.09■■■■■ 4.01
LGALS3-201ENST00000254301 STK26Q9P289 416 aa40.09■■■■■ 4.01
LGALS3-201ENST00000254301 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa40.09■■■■■ 4.01
LGALS3-201ENST00000254301 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa40.08■■■■■ 4.01
LGALS3-201ENST00000254301 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa40.08■■■■■ 4.01
LGALS3-201ENST00000254301 CFAP70Q5T0N1 1121 aa40.07■■■■■ 4.01
LGALS3-201ENST00000254301 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP40.06■■■■■ 4
LGALS3-201ENST00000254301 STAC3Q96MF2 364 aa40.05■■■■■ 4
LGALS3-201ENST00000254301 DISP3Q9P2K9 1392 aa40.02■■■■■ 4
LGALS3-201ENST00000254301 ABCC11Q96J66 1382 aa40.01■■■■■ 4
LGALS3-201ENST00000254301 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP40■■■■□ 3.99
LGALS3-201ENST00000254301 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa40■■■■□ 3.99
LGALS3-201ENST00000254301 TECPR2O15040 1411 aa39.98■■■■□ 3.99
LGALS3-201ENST00000254301 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP39.98■■■■□ 3.99
LGALS3-201ENST00000254301 MST1RQ04912 1400 aa39.95■■■■□ 3.99
LGALS3-201ENST00000254301 WAPLQ7Z5K2 1190 aa39.95■■■■□ 3.99
LGALS3-201ENST00000254301 NALCNQ8IZF0 1738 aa39.94■■■■□ 3.98
LGALS3-201ENST00000254301 BRINP3Q76B58 766 aa39.94■■■■□ 3.98
LGALS3-201ENST00000254301 LAMC1P11047 1609 aa39.92■■■■□ 3.98
LGALS3-201ENST00000254301 SIRT1Q96EB6 747 aa39.91■■■■□ 3.98
LGALS3-201ENST00000254301 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa39.86■■■■□ 3.97
LGALS3-201ENST00000254301 KNDC1Q76NI1 1749 aa39.84■■■■□ 3.97
LGALS3-201ENST00000254301 SIN3AQ96ST3 1273 aa39.83■■■■□ 3.97
LGALS3-201ENST00000254301 PHLPP1O60346 1717 aa39.82■■■■□ 3.97
LGALS3-201ENST00000254301 C1orf167Q5SNV9 1468 aa39.82■■■■□ 3.97
LGALS3-201ENST00000254301 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP39.81■■■■□ 3.96
LGALS3-201ENST00000254301 ADGRB1O14514 1584 aa39.79■■■■□ 3.96
LGALS3-201ENST00000254301 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP39.78■■■■□ 3.96
LGALS3-201ENST00000254301 PRAM1Q96QH2 718 aa39.78■■■■□ 3.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.8 ms