RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000254190.3

CHSY1-201, Transcript of chondroitin sulfate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CHSY1, Length 4,550 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHSY1-201ENST00000254190 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa29.71■■■□□ 2.35
CHSY1-201ENST00000254190 AFAP1Q8N556 730 aa29.71■■■□□ 2.35
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CHSY1-201ENST00000254190 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP29.69■■■□□ 2.34
CHSY1-201ENST00000254190 CHMP4AQ9BY43 222 aa29.69■■■□□ 2.34
CHSY1-201ENST00000254190 CHMP3Q9Y3E7 222 aa29.69■■■□□ 2.34
CHSY1-201ENST00000254190 BACH2Q9BYV9 841 aa29.69■■■□□ 2.34
CHSY1-201ENST00000254190 TOP2BQ02880 1626 aa29.69■■■□□ 2.34
CHSY1-201ENST00000254190 NPHP1O15259 732 aa29.69■■■□□ 2.34
CHSY1-201ENST00000254190 BCAR3O75815 825 aa29.68■■■□□ 2.34
CHSY1-201ENST00000254190 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.67■■■□□ 2.34
CHSY1-201ENST00000254190 HMOX1P09601 288 aa29.67■■■□□ 2.34
CHSY1-201ENST00000254190 GPATCH3Q96I76 525 aa29.66■■■□□ 2.34
CHSY1-201ENST00000254190 NAIPQ13075 1403 aa29.66■■■□□ 2.34
CHSY1-201ENST00000254190 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP29.66■■■□□ 2.34
CHSY1-201ENST00000254190 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP29.65■■■□□ 2.34
CHSY1-201ENST00000254190 RSPH6AQ9H0K4 717 aa29.65■■■□□ 2.34
CHSY1-201ENST00000254190 STAC3Q96MF2 364 aa29.64■■■□□ 2.34
CHSY1-201ENST00000254190 CABP2Q9NPB3 220 aa29.64■■■□□ 2.34
CHSY1-201ENST00000254190 PRDM2Q13029 1718 aa29.64■■■□□ 2.34
CHSY1-201ENST00000254190 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa29.64■■■□□ 2.33
CHSY1-201ENST00000254190 NECTIN2Q92692 538 aa29.63■■■□□ 2.33
CHSY1-201ENST00000254190 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP29.62■■■□□ 2.33
CHSY1-201ENST00000254190 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP29.62■■■□□ 2.33
CHSY1-201ENST00000254190 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP29.62■■■□□ 2.33
CHSY1-201ENST00000254190 HDAC5Q9UQL6 1122 aa29.62■■■□□ 2.33
CHSY1-201ENST00000254190 KIF16BQ96L93 1317 aa29.61■■■□□ 2.33
CHSY1-201ENST00000254190 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP29.61■■■□□ 2.33
CHSY1-201ENST00000254190 EID1Q9Y6B2 187 aa29.61■■■□□ 2.33
CHSY1-201ENST00000254190 GORABQ5T7V8 394 aa29.61■■■□□ 2.33
CHSY1-201ENST00000254190 MSH5O43196 834 aa29.6■■■□□ 2.33
CHSY1-201ENST00000254190 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
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CHSY1-201ENST00000254190 REC8O95072 547 aa29.58■■■□□ 2.33
CHSY1-201ENST00000254190 BRPF3Q9ULD4 1205 aa29.58■■■□□ 2.33
CHSY1-201ENST00000254190 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa29.57■■■□□ 2.32
CHSY1-201ENST00000254190 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa29.57■■■□□ 2.32
CHSY1-201ENST00000254190 NESP48681 1621 aa29.57■■■□□ 2.32
CHSY1-201ENST00000254190 PHF14O94880 888 aa29.55■■■□□ 2.32
CHSY1-201ENST00000254190 IL27Q8NEV9 243 aa29.54■■■□□ 2.32
CHSY1-201ENST00000254190 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
CHSY1-201ENST00000254190 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa29.54■■■□□ 2.32
CHSY1-201ENST00000254190 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
CHSY1-201ENST00000254190 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
CHSY1-201ENST00000254190 ANO2Q9NQ90 1003 aa29.53■■■□□ 2.32
CHSY1-201ENST00000254190 EFCAB5A4FU69 1503 aa29.52■■■□□ 2.32
CHSY1-201ENST00000254190 GNAI1P63096 354 aa29.52■■■□□ 2.32
CHSY1-201ENST00000254190 PDE3AQ14432 1141 aa29.52■■■□□ 2.32
CHSY1-201ENST00000254190 SKAP1Q86WV1 359 aa29.52■■■□□ 2.32
CHSY1-201ENST00000254190 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP29.51■■■□□ 2.324e-7■■■■■ 39.7
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CHSY1-201ENST00000254190 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
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CHSY1-201ENST00000254190 C9orf84Q5VXU9 1444 aa29.49■■■□□ 2.31
CHSY1-201ENST00000254190 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa29.48■■■□□ 2.31
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CHSY1-201ENST00000254190 TEFQ10587 303 aa29.47■■■□□ 2.31
CHSY1-201ENST00000254190 TAF7LQ5H9L4 462 aa29.47■■■□□ 2.31
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CHSY1-201ENST00000254190 MCTP1Q6DN14 999 aa29.44■■■□□ 2.3
CHSY1-201ENST00000254190 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
CHSY1-201ENST00000254190 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
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CHSY1-201ENST00000254190 TRAK2O60296 914 aa29.43■■■□□ 2.3
CHSY1-201ENST00000254190 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
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CHSY1-201ENST00000254190 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP29.41■■■□□ 2.3
CHSY1-201ENST00000254190 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
CHSY1-201ENST00000254190 PRKAR2BP31323 418 aa29.41■■■□□ 2.3
CHSY1-201ENST00000254190 C1orf115Q9H7X2 142 aa29.41■■■□□ 2.3
CHSY1-201ENST00000254190 NUCB2P80303 420 aa29.4■■■□□ 2.3
CHSY1-201ENST00000254190 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.4■■■□□ 2.3
CHSY1-201ENST00000254190 TSPYL4Q9UJ04 414 aa29.39■■■□□ 2.3
CHSY1-201ENST00000254190 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa29.39■■■□□ 2.3
CHSY1-201ENST00000254190 VSIG10Q8N0Z9 540 aa29.38■■■□□ 2.29
CHSY1-201ENST00000254190 C20orf194Q5TEA3 1177 aa29.38■■■□□ 2.29
CHSY1-201ENST00000254190 H3BQV1 296 aa29.38■■■□□ 2.29
CHSY1-201ENST00000254190 IFFO2Q5TF58 517 aa29.38■■■□□ 2.29
CHSY1-201ENST00000254190 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP29.38■■■□□ 2.29
CHSY1-201ENST00000254190 ARHGAP5Q13017 1502 aa29.37■■■□□ 2.29
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CHSY1-201ENST00000254190 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
CHSY1-201ENST00000254190 FAM184AQ8NB25 1140 aa29.36■■■□□ 2.29
CHSY1-201ENST00000254190 MRE11P49959 708 aa29.35■■■□□ 2.29
CHSY1-201ENST00000254190 TPM4P67936 248 aa29.35■■■□□ 2.29
CHSY1-201ENST00000254190 FAM43AQ8N2R8 423 aa29.35■■■□□ 2.29
CHSY1-201ENST00000254190 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
CHSY1-201ENST00000254190 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
CHSY1-201ENST00000254190 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
CHSY1-201ENST00000254190 KIF3AQ9Y496 699 aa29.34■■■□□ 2.29
CHSY1-201ENST00000254190 ERBINQ96RT1 1412 aa29.34■■■□□ 2.29
CHSY1-201ENST00000254190 TOMM22Q9NS69 142 aa29.34■■■□□ 2.29
CHSY1-201ENST00000254190 C1orf141Q5JVX7 400 aa29.33■■■□□ 2.29
CHSY1-201ENST00000254190 RUFY2Q8WXA3 655 aa29.33■■■□□ 2.29
CHSY1-201ENST00000254190 ROCK1Q13464 1354 aa29.33■■■□□ 2.29
CHSY1-201ENST00000254190 FAM13BQ9NYF5 915 aa29.31■■■□□ 2.28
CHSY1-201ENST00000254190 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP29.31■■■□□ 2.28
CHSY1-201ENST00000254190 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
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