RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP37.47■■■■□ 3.59
CAPNS1-201ENST00000246533 ARHGAP23Q9P227 1491 aa37.46■■■■□ 3.59
CAPNS1-201ENST00000246533 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP37.46■■■■□ 3.59
CAPNS1-201ENST00000246533 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP37.46■■■■□ 3.59
CAPNS1-201ENST00000246533 TXNDC2Q86VQ3 553 aa37.45■■■■□ 3.59
CAPNS1-201ENST00000246533 NEURL4Q96JN8 1562 aa37.45■■■■□ 3.59
CAPNS1-201ENST00000246533 SLIT1O75093 1534 aa37.45■■■■□ 3.58
CAPNS1-201ENST00000246533 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP37.42■■■■□ 3.58
CAPNS1-201ENST00000246533 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa37.4■■■■□ 3.58
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC144AA2RUR9 1427 aa37.39■■■■□ 3.58
CAPNS1-201ENST00000246533 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP37.37■■■■□ 3.57
CAPNS1-201ENST00000246533 KIF1BO60333 1816 aa37.37■■■■□ 3.57
CAPNS1-201ENST00000246533 ZFYVE9O95405 1425 aa37.36■■■■□ 3.57
CAPNS1-201ENST00000246533 RIMS2Q9UQ26 1411 aa37.36■■■■□ 3.57
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP37.36■■■■□ 3.57
CAPNS1-201ENST00000246533 EID1Q9Y6B2 187 aa37.35■■■■□ 3.57
CAPNS1-201ENST00000246533 DMRT2Q9Y5R5 561 aa37.34■■■■□ 3.57
CAPNS1-201ENST00000246533 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP37.32■■■■□ 3.56
CAPNS1-201ENST00000246533 RGL3Q3MIN7 710 aa37.31■■■■□ 3.56
CAPNS1-201ENST00000246533 MED14O60244 1454 aa37.31■■■■□ 3.56
CAPNS1-201ENST00000246533 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa37.26■■■■□ 3.55
CAPNS1-201ENST00000246533 IQGAP1P46940 1657 aa37.25■■■■□ 3.55
CAPNS1-201ENST00000246533 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP37.24■■■■□ 3.55
CAPNS1-201ENST00000246533 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa37.22■■■■□ 3.55
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC26A8Q96RN1 970 aa37.22■■■■□ 3.55
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP37.21■■■■□ 3.55
CAPNS1-201ENST00000246533 BCANQ96GW7 911 aa37.19■■■■□ 3.54
CAPNS1-201ENST00000246533 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP37.18■■■■□ 3.54
CAPNS1-201ENST00000246533 HDGFP51858 240 aaKnown RBP37.16■■■■□ 3.54
CAPNS1-201ENST00000246533 SIN3AQ96ST3 1273 aa37.16■■■■□ 3.54
CAPNS1-201ENST00000246533 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa37.14■■■■□ 3.54
CAPNS1-201ENST00000246533 PPLO60437 1756 aa37.1■■■■□ 3.53
CAPNS1-201ENST00000246533 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa37.08■■■■□ 3.53
CAPNS1-201ENST00000246533 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa37.07■■■■□ 3.53
CAPNS1-201ENST00000246533 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa37.07■■■■□ 3.52
CAPNS1-201ENST00000246533 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa37.05■■■■□ 3.52
CAPNS1-201ENST00000246533 LTBP4Q8N2S1 1624 aa37.04■■■■□ 3.52
CAPNS1-201ENST00000246533 VGFO15240 615 aaPredicted RBP37.04■■■■□ 3.52
CAPNS1-201ENST00000246533 IFT172Q9UG01 1749 aa37.03■■■■□ 3.52
CAPNS1-201ENST00000246533 STRCP1A6NGW2 1772 aa37.03■■■■□ 3.52
CAPNS1-201ENST00000246533 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa36.98■■■■□ 3.51
CAPNS1-201ENST00000246533 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa36.97■■■■□ 3.51
CAPNS1-201ENST00000246533 TBX22Q9Y458 520 aa36.97■■■■□ 3.51
CAPNS1-201ENST00000246533 DCAF11Q8TEB1 546 aa36.97■■■■□ 3.51
CAPNS1-201ENST00000246533 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa36.96■■■■□ 3.51
CAPNS1-201ENST00000246533 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP36.96■■■■□ 3.51
CAPNS1-201ENST00000246533 METP08581 1390 aa36.92■■■■□ 3.5
CAPNS1-201ENST00000246533 CERKQ8TCT0 537 aa36.89■■■■□ 3.5
CAPNS1-201ENST00000246533 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP36.89■■■■□ 3.5
CAPNS1-201ENST00000246533 PTPRUQ92729 1446 aa36.88■■■■□ 3.49
CAPNS1-201ENST00000246533 ALKQ9UM73 1620 aa36.87■■■■□ 3.49
CAPNS1-201ENST00000246533 KCNA6P17658 529 aa36.87■■■■□ 3.49
CAPNS1-201ENST00000246533 L3MBTL2Q969R5 705 aa36.86■■■■□ 3.49
CAPNS1-201ENST00000246533 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP36.86■■■■□ 3.49
CAPNS1-201ENST00000246533 PIK3C2GO75747 1445 aa36.85■■■■□ 3.49
CAPNS1-201ENST00000246533 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP36.85■■■■□ 3.49
CAPNS1-201ENST00000246533 DIP2AQ14689 1571 aa36.84■■■■□ 3.49
CAPNS1-201ENST00000246533 MYOM2P54296 1465 aa36.84■■■■□ 3.49
CAPNS1-201ENST00000246533 NRXN1Q9ULB1 1477 aa36.83■■■■□ 3.49
CAPNS1-201ENST00000246533 CFAP70Q5T0N1 1121 aa36.82■■■■□ 3.48
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM132EQ6IEE7 984 aa36.81■■■■□ 3.48
CAPNS1-201ENST00000246533 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa36.81■■■■□ 3.48
CAPNS1-201ENST00000246533 LRRC7Q96NW7 1537 aa36.79■■■■□ 3.48
CAPNS1-201ENST00000246533 CPS1P31327 1500 aa36.78■■■■□ 3.48
CAPNS1-201ENST00000246533 NWD1Q149M9 1564 aa36.77■■■■□ 3.48
CAPNS1-201ENST00000246533 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP36.75■■■■□ 3.47
CAPNS1-201ENST00000246533 PIK3R4Q99570 1358 aa36.75■■■■□ 3.47
CAPNS1-201ENST00000246533 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP36.74■■■■□ 3.47
CAPNS1-201ENST00000246533 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa36.73■■■■□ 3.47
CAPNS1-201ENST00000246533 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP36.71■■■■□ 3.47
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM94Q12767 1356 aa36.7■■■■□ 3.47
CAPNS1-201ENST00000246533 STK26Q9P289 416 aa36.69■■■■□ 3.46
CAPNS1-201ENST00000246533 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP36.68■■■■□ 3.46
CAPNS1-201ENST00000246533 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP36.66■■■■□ 3.46
CAPNS1-201ENST00000246533 STAC3Q96MF2 364 aa36.65■■■■□ 3.46
CAPNS1-201ENST00000246533 PRAG1Q86YV5 1406 aa36.64■■■■□ 3.46
CAPNS1-201ENST00000246533 TONSLQ96HA7 1378 aa36.63■■■■□ 3.45
CAPNS1-201ENST00000246533 ROBO2Q9HCK4 1378 aa36.62■■■■□ 3.45
CAPNS1-201ENST00000246533 NBPF1Q3BBV0 1214 aa36.6■■■■□ 3.45
CAPNS1-201ENST00000246533 NBPF8Q3BBV2 869 aa36.59■■■■□ 3.45
CAPNS1-201ENST00000246533 ADGRB1O14514 1584 aa36.57■■■■□ 3.45
CAPNS1-201ENST00000246533 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP36.57■■■■□ 3.44
CAPNS1-201ENST00000246533 LAMC1P11047 1609 aa36.56■■■■□ 3.44
CAPNS1-201ENST00000246533 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP36.55■■■■□ 3.44
CAPNS1-201ENST00000246533 WAPLQ7Z5K2 1190 aa36.55■■■■□ 3.44
CAPNS1-201ENST00000246533 IQSEC2Q5JU85 1478 aa36.54■■■■□ 3.44
CAPNS1-201ENST00000246533 UBAP1LF5GYI3 381 aa36.53■■■■□ 3.44
CAPNS1-201ENST00000246533 CCER2I3L3R5 266 aa36.52■■■■□ 3.44
CAPNS1-201ENST00000246533 C14orf37Q86TY3 774 aa36.51■■■■□ 3.43
CAPNS1-201ENST00000246533 ABCC11Q96J66 1382 aa36.51■■■■□ 3.43
CAPNS1-201ENST00000246533 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa36.51■■■■□ 3.43
CAPNS1-201ENST00000246533 TRAK1Q9UPV9 953 aa36.49■■■■□ 3.43
CAPNS1-201ENST00000246533 PTCH1Q13635 1447 aa36.49■■■■□ 3.43
CAPNS1-201ENST00000246533 TECPR2O15040 1411 aa36.46■■■■□ 3.43
CAPNS1-201ENST00000246533 FBXO41Q8TF61 875 aa36.46■■■■□ 3.43
CAPNS1-201ENST00000246533 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa36.44■■■■□ 3.42
CAPNS1-201ENST00000246533 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP36.44■■■■□ 3.42
CAPNS1-201ENST00000246533 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa36.43■■■■□ 3.42
CAPNS1-201ENST00000246533 KNDC1Q76NI1 1749 aa36.42■■■■□ 3.42
CAPNS1-201ENST00000246533 PIP4K2BP78356 416 aa36.42■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.7 ms