RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246024.6

TMX4-201, Transcript of thioredoxin related transmembrane protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMX4, Length 6,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX4-201ENST00000246024 AFAP1Q8N556 730 aa16.61■□□□□ 0.25
TMX4-201ENST00000246024 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
TMX4-201ENST00000246024 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
TMX4-201ENST00000246024 HMOX1P09601 288 aa16.6■□□□□ 0.25
TMX4-201ENST00000246024 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
TMX4-201ENST00000246024 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa16.6■□□□□ 0.25
TMX4-201ENST00000246024 PLIN1O60240 522 aa16.6■□□□□ 0.25
TMX4-201ENST00000246024 STRN4Q9NRL3 753 aa16.6■□□□□ 0.25
TMX4-201ENST00000246024 CABP2Q9NPB3 220 aa16.59■□□□□ 0.25
TMX4-201ENST00000246024 RALBP1Q15311 655 aa16.59■□□□□ 0.25
TMX4-201ENST00000246024 NLRP2Q9NX02 1062 aa16.59■□□□□ 0.25
TMX4-201ENST00000246024 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa16.58■□□□□ 0.25
TMX4-201ENST00000246024 MCTP1Q6DN14 999 aa16.58■□□□□ 0.25
TMX4-201ENST00000246024 RSPH4AQ5TD94 716 aa16.58■□□□□ 0.24
TMX4-201ENST00000246024 GAPVD1Q14C86 1478 aa16.58■□□□□ 0.24
TMX4-201ENST00000246024 EVC2Q86UK5 1308 aa16.57■□□□□ 0.24
TMX4-201ENST00000246024 FGD5Q6ZNL6 1462 aa16.57■□□□□ 0.24
TMX4-201ENST00000246024 VPS37DQ86XT2 251 aa16.57■□□□□ 0.24
TMX4-201ENST00000246024 LMOD3Q0VAK6 560 aa16.57■□□□□ 0.24
TMX4-201ENST00000246024 ESCO1Q5FWF5 840 aa16.57■□□□□ 0.24
TMX4-201ENST00000246024 ST18O60284 1047 aa16.57■□□□□ 0.24
TMX4-201ENST00000246024 SMARCA4P51532 1647 aa16.57■□□□□ 0.24
TMX4-201ENST00000246024 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
TMX4-201ENST00000246024 APPP05067 770 aa16.56■□□□□ 0.24
TMX4-201ENST00000246024 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
TMX4-201ENST00000246024 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
TMX4-201ENST00000246024 TPM1P09493 284 aa16.56■□□□□ 0.24
TMX4-201ENST00000246024 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP16.56■□□□□ 0.24
TMX4-201ENST00000246024 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
TMX4-201ENST00000246024 PHF14O94880 888 aa16.54■□□□□ 0.24
TMX4-201ENST00000246024 GGNBP2Q9H3C7 697 aa16.54■□□□□ 0.24
TMX4-201ENST00000246024 DCAF8L1A6NGE4 600 aa16.54■□□□□ 0.24
TMX4-201ENST00000246024 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa16.53■□□□□ 0.24
TMX4-201ENST00000246024 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
TMX4-201ENST00000246024 BECN2A8MW95 431 aa16.53■□□□□ 0.24
TMX4-201ENST00000246024 NESP48681 1621 aa16.53■□□□□ 0.24
TMX4-201ENST00000246024 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
TMX4-201ENST00000246024 SETQ01105 290 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.23
TMX4-201ENST00000246024 TRIM29Q14134 588 aa16.52■□□□□ 0.23
TMX4-201ENST00000246024 CGNL1Q0VF96 1302 aa16.51■□□□□ 0.23
TMX4-201ENST00000246024 CCDC70Q6NSX1 233 aa16.51■□□□□ 0.23
TMX4-201ENST00000246024 TXNDC2Q86VQ3 553 aa16.51■□□□□ 0.23
TMX4-201ENST00000246024 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
TMX4-201ENST00000246024 RAPGEF3O95398 923 aa16.5■□□□□ 0.23
TMX4-201ENST00000246024 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
TMX4-201ENST00000246024 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
TMX4-201ENST00000246024 NLRP6P59044 892 aa16.49■□□□□ 0.23
TMX4-201ENST00000246024 NEXNQ0ZGT2 675 aa16.49■□□□□ 0.23
TMX4-201ENST00000246024 FYB1O15117 783 aa16.48■□□□□ 0.23
TMX4-201ENST00000246024 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
TMX4-201ENST00000246024 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
TMX4-201ENST00000246024 APAF1O14727 1248 aa16.48■□□□□ 0.23
TMX4-201ENST00000246024 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa16.48■□□□□ 0.23
TMX4-201ENST00000246024 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa16.48■□□□□ 0.23
TMX4-201ENST00000246024 NLRP13Q86W25 1043 aa16.47■□□□□ 0.23
TMX4-201ENST00000246024 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa16.47■□□□□ 0.23
TMX4-201ENST00000246024 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
TMX4-201ENST00000246024 ANKRD45Q5TZF3 282 aa16.47■□□□□ 0.23
TMX4-201ENST00000246024 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
TMX4-201ENST00000246024 CCER2I3L3R5 266 aa16.47■□□□□ 0.23
TMX4-201ENST00000246024 ABTB2Q8N961 1025 aa16.47■□□□□ 0.23
TMX4-201ENST00000246024 MTMR7Q9Y216 660 aa16.47■□□□□ 0.23
TMX4-201ENST00000246024 ZNF592Q92610 1267 aa16.46■□□□□ 0.23
TMX4-201ENST00000246024 CPLX1O14810 134 aa16.46■□□□□ 0.23
TMX4-201ENST00000246024 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
TMX4-201ENST00000246024 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
TMX4-201ENST00000246024 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
TMX4-201ENST00000246024 RIPK4P57078 832 aa16.46■□□□□ 0.23
TMX4-201ENST00000246024 PAF1Q8N7H5 531 aa16.46■□□□□ 0.23
TMX4-201ENST00000246024 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.22
TMX4-201ENST00000246024 NFXL1Q6ZNB6 911 aa16.46■□□□□ 0.22
TMX4-201ENST00000246024 SLC26A8Q96RN1 970 aa16.46■□□□□ 0.22
TMX4-201ENST00000246024 KDM4AO75164 1064 aa16.45■□□□□ 0.22
TMX4-201ENST00000246024 ODF2Q5BJF6 829 aa16.45■□□□□ 0.22
TMX4-201ENST00000246024 CHMP4CQ96CF2 233 aa16.45■□□□□ 0.22
TMX4-201ENST00000246024 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa16.44■□□□□ 0.22
TMX4-201ENST00000246024 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa16.43■□□□□ 0.22
TMX4-201ENST00000246024 COG6Q9Y2V7 657 aa16.43■□□□□ 0.22
TMX4-201ENST00000246024 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
TMX4-201ENST00000246024 ARHGAP5Q13017 1502 aa16.43■□□□□ 0.22
TMX4-201ENST00000246024 USP47Q96K76 1375 aa16.43■□□□□ 0.22
TMX4-201ENST00000246024 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
TMX4-201ENST00000246024 TRDNQ13061 729 aa16.43■□□□□ 0.22
TMX4-201ENST00000246024 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
TMX4-201ENST00000246024 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
TMX4-201ENST00000246024 KIF15Q9NS87 1388 aa16.42■□□□□ 0.22
TMX4-201ENST00000246024 FOSBP53539 338 aa16.42■□□□□ 0.22
TMX4-201ENST00000246024 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
TMX4-201ENST00000246024 UACAQ9BZF9 1416 aa16.42■□□□□ 0.22
TMX4-201ENST00000246024 IGF1RP08069 1367 aa16.42■□□□□ 0.22
TMX4-201ENST00000246024 ANO2Q9NQ90 1003 aa16.42■□□□□ 0.22
TMX4-201ENST00000246024 TSPYL4Q9UJ04 414 aa16.42■□□□□ 0.22
TMX4-201ENST00000246024 ERICH2A1L162 156 aa16.41■□□□□ 0.22
TMX4-201ENST00000246024 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP16.41■□□□□ 0.22
TMX4-201ENST00000246024 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa16.41■□□□□ 0.22
TMX4-201ENST00000246024 GPS2Q13227 327 aa16.41■□□□□ 0.22
TMX4-201ENST00000246024 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
TMX4-201ENST00000246024 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
TMX4-201ENST00000246024 CFAP70Q5T0N1 1121 aa16.4■□□□□ 0.22
TMX4-201ENST00000246024 SLC4A3P48751 1232 aa16.4■□□□□ 0.22
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