RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000244906.6

DKFZP434K028-201, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene DKFZP434K028, Length 927 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKFZP434K028-201ENST00000244906 SLC52A1Q9NWF4 448 aa22.85■■□□□ 1.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 ADGRL2O95490 1459 aa22.83■■□□□ 1.25
DKFZP434K028-201ENST00000244906 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.83■■□□□ 1.24
DKFZP434K028-201ENST00000244906 BCANQ96GW7 911 aa22.82■■□□□ 1.24
DKFZP434K028-201ENST00000244906 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
DKFZP434K028-201ENST00000244906 PHLPP1O60346 1717 aa22.8■■□□□ 1.24
DKFZP434K028-201ENST00000244906 ZFYVE9O95405 1425 aa22.8■■□□□ 1.24
DKFZP434K028-201ENST00000244906 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa22.79■■□□□ 1.24
DKFZP434K028-201ENST00000244906 SLAIN2Q9P270 581 aa22.79■■□□□ 1.24
DKFZP434K028-201ENST00000244906 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
DKFZP434K028-201ENST00000244906 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa22.78■■□□□ 1.24
DKFZP434K028-201ENST00000244906 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
DKFZP434K028-201ENST00000244906 MSH6P52701 1360 aa22.76■■□□□ 1.23
DKFZP434K028-201ENST00000244906 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa22.76■■□□□ 1.23
DKFZP434K028-201ENST00000244906 RIMS2Q9UQ26 1411 aa22.75■■□□□ 1.23
DKFZP434K028-201ENST00000244906 E9PCH4 1651 aa22.73■■□□□ 1.23
DKFZP434K028-201ENST00000244906 TBX22Q9Y458 520 aa22.72■■□□□ 1.23
DKFZP434K028-201ENST00000244906 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
DKFZP434K028-201ENST00000244906 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
DKFZP434K028-201ENST00000244906 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
DKFZP434K028-201ENST00000244906 HDGFP51858 240 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
DKFZP434K028-201ENST00000244906 UNC13BO14795 1591 aa22.7■■□□□ 1.22
DKFZP434K028-201ENST00000244906 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
DKFZP434K028-201ENST00000244906 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
DKFZP434K028-201ENST00000244906 CHGAP10645 457 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
DKFZP434K028-201ENST00000244906 JCADQ9P266 1359 aa22.68■■□□□ 1.22
DKFZP434K028-201ENST00000244906 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa22.67■■□□□ 1.22
DKFZP434K028-201ENST00000244906 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP22.64■■□□□ 1.21
DKFZP434K028-201ENST00000244906 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa22.64■■□□□ 1.21
DKFZP434K028-201ENST00000244906 LRP6O75581 1613 aa22.62■■□□□ 1.21
DKFZP434K028-201ENST00000244906 IQGAP3Q86VI3 1631 aa22.62■■□□□ 1.21
DKFZP434K028-201ENST00000244906 C14orf37Q86TY3 774 aa22.62■■□□□ 1.21
DKFZP434K028-201ENST00000244906 C19orf44Q9H6X5 657 aa22.6■■□□□ 1.21
DKFZP434K028-201ENST00000244906 PTPRUQ92729 1446 aa22.59■■□□□ 1.21
DKFZP434K028-201ENST00000244906 DIP2AQ14689 1571 aa22.59■■□□□ 1.21
DKFZP434K028-201ENST00000244906 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa22.58■■□□□ 1.21
DKFZP434K028-201ENST00000244906 PIK3R4Q99570 1358 aa22.58■■□□□ 1.21
DKFZP434K028-201ENST00000244906 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
DKFZP434K028-201ENST00000244906 CADPS2Q86UW7 1296 aa22.57■■□□□ 1.2
DKFZP434K028-201ENST00000244906 SHPRHQ149N8 1683 aa22.57■■□□□ 1.2
DKFZP434K028-201ENST00000244906 ATF3P18847 181 aa22.56■■□□□ 1.2
DKFZP434K028-201ENST00000244906 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa22.56■■□□□ 1.2
DKFZP434K028-201ENST00000244906 ROCK1Q13464 1354 aa22.55■■□□□ 1.2
DKFZP434K028-201ENST00000244906 NUP155O75694 1391 aa22.54■■□□□ 1.2
DKFZP434K028-201ENST00000244906 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa22.54■■□□□ 1.2
DKFZP434K028-201ENST00000244906 TRPM2O94759 1503 aa22.54■■□□□ 1.2
DKFZP434K028-201ENST00000244906 BRINP3Q76B58 766 aa22.53■■□□□ 1.2
DKFZP434K028-201ENST00000244906 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
DKFZP434K028-201ENST00000244906 ITGAEP38570 1179 aa22.5■■□□□ 1.19
DKFZP434K028-201ENST00000244906 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa22.5■■□□□ 1.19
DKFZP434K028-201ENST00000244906 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
DKFZP434K028-201ENST00000244906 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
DKFZP434K028-201ENST00000244906 TRIM52Q96A61 297 aa22.49■■□□□ 1.19
DKFZP434K028-201ENST00000244906 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP22.48■■□□□ 1.19
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DKFZP434K028-201ENST00000244906 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
DKFZP434K028-201ENST00000244906 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
DKFZP434K028-201ENST00000244906 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa22.46■■□□□ 1.19
DKFZP434K028-201ENST00000244906 METP08581 1390 aa22.45■■□□□ 1.18
DKFZP434K028-201ENST00000244906 NHSL1Q5SYE7 1610 aa22.45■■□□□ 1.18
DKFZP434K028-201ENST00000244906 MST1RQ04912 1400 aa22.44■■□□□ 1.18
DKFZP434K028-201ENST00000244906 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
DKFZP434K028-201ENST00000244906 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa22.44■■□□□ 1.18
DKFZP434K028-201ENST00000244906 DCCP43146 1447 aa22.42■■□□□ 1.18
DKFZP434K028-201ENST00000244906 RXRBP28702 533 aa22.42■■□□□ 1.18
DKFZP434K028-201ENST00000244906 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
DKFZP434K028-201ENST00000244906 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
DKFZP434K028-201ENST00000244906 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.4■■□□□ 1.18
DKFZP434K028-201ENST00000244906 NALCNQ8IZF0 1738 aa22.4■■□□□ 1.18
DKFZP434K028-201ENST00000244906 CLTCL1P53675 1640 aa22.39■■□□□ 1.18
DKFZP434K028-201ENST00000244906 AFF2P51816 1311 aa22.38■■□□□ 1.17
DKFZP434K028-201ENST00000244906 KIF1BO60333 1816 aa22.38■■□□□ 1.17
DKFZP434K028-201ENST00000244906 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa22.37■■□□□ 1.17
DKFZP434K028-201ENST00000244906 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
DKFZP434K028-201ENST00000244906 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa22.34■■□□□ 1.17
DKFZP434K028-201ENST00000244906 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
DKFZP434K028-201ENST00000244906 PNPLA6Q8IY17 1366 aa22.32■■□□□ 1.16
DKFZP434K028-201ENST00000244906 C8orf37Q96NL8 207 aa22.31■■□□□ 1.16
DKFZP434K028-201ENST00000244906 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
DKFZP434K028-201ENST00000244906 C1orf167Q5SNV9 1468 aa22.28■■□□□ 1.16
DKFZP434K028-201ENST00000244906 LAMC1P11047 1609 aa22.28■■□□□ 1.16
DKFZP434K028-201ENST00000244906 ORAI2Q96SN7 254 aa22.27■■□□□ 1.16
DKFZP434K028-201ENST00000244906 RGS12O14924 1447 aa22.26■■□□□ 1.15
DKFZP434K028-201ENST00000244906 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
DKFZP434K028-201ENST00000244906 ADAMTS2O95450 1211 aa22.25■■□□□ 1.15
DKFZP434K028-201ENST00000244906 ROBO2Q9HCK4 1378 aa22.25■■□□□ 1.15
DKFZP434K028-201ENST00000244906 NAIPQ13075 1403 aa22.23■■□□□ 1.15
DKFZP434K028-201ENST00000244906 NGLY1Q96IV0 654 aa22.23■■□□□ 1.15
DKFZP434K028-201ENST00000244906 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
DKFZP434K028-201ENST00000244906 PPLO60437 1756 aa22.22■■□□□ 1.15
DKFZP434K028-201ENST00000244906 VGFO15240 615 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
DKFZP434K028-201ENST00000244906 PTCH1Q13635 1447 aa22.2■■□□□ 1.14
DKFZP434K028-201ENST00000244906 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
DKFZP434K028-201ENST00000244906 USP21Q9UK80 565 aa22.16■■□□□ 1.14
DKFZP434K028-201ENST00000244906 PRAG1Q86YV5 1406 aa22.14■■□□□ 1.14
DKFZP434K028-201ENST00000244906 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
DKFZP434K028-201ENST00000244906 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa22.14■■□□□ 1.14
DKFZP434K028-201ENST00000244906 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
DKFZP434K028-201ENST00000244906 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
DKFZP434K028-201ENST00000244906 HFM1A2PYH4 1435 aa22.12■■□□□ 1.13
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