RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000171737.2

Odc1-201, Transcript of Ornithine decarboxylase, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Odc1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ncoa1P70365 1447 aa34,26■■■■□ 3,08
Odc1-201ENSMUST00000171737 Card11Q8CIS0 1159 aa34,25■■■■□ 3,07
Odc1-201ENSMUST00000171737 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa34,25■■■■□ 3,07
Odc1-201ENSMUST00000171737 Hfm1D3Z4R1 1434 aa34,25■■■■□ 3,07
Odc1-201ENSMUST00000171737 Plppr3Q7TPB0 716 aa34,22■■■■□ 3,07
Odc1-201ENSMUST00000171737 Skint5A7XUY5 1461 aa34,21■■■■□ 3,07
Odc1-201ENSMUST00000171737 Uggt1Q6P5E4 1551 aa34,2■■■■□ 3,07
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ahdc1Q6PAL7 1594 aaKnown RBP34,19■■■■□ 3,06
Odc1-201ENSMUST00000171737 Rims1Q99NE5 1463 aa34,19■■■■□ 3,06
Odc1-201ENSMUST00000171737 Cep152A2AUM9 1736 aaKnown RBP34,17■■■■□ 3,06
Odc1-201ENSMUST00000171737 Mroh1E0CZ22 1640 aa34,17■■■■□ 3,06
Odc1-201ENSMUST00000171737 Rsph4aQ8BYM7 716 aa34,14■■■■□ 3,06
Odc1-201ENSMUST00000171737 Myo3aQ8K3H5 1613 aa34,12■■■■□ 3,05
Odc1-201ENSMUST00000171737 Kif13aQ9EQW7 1749 aa34,08■■■■□ 3,05
Odc1-201ENSMUST00000171737 Plxnc1Q9QZC2 1574 aa34,07■■■■□ 3,04
Odc1-201ENSMUST00000171737 Cwc22Q8C5N3 908 aaKnown RBP34,07■■■■□ 3,04
Odc1-201ENSMUST00000171737 Cdk5rap2Q8K389 1822 aa34,06■■■■□ 3,04
Odc1-201ENSMUST00000171737 Kdm2aP59997 1161 aa34,06■■■■□ 3,04
Odc1-201ENSMUST00000171737 Myom1Q62234 1667 aaKnown RBP34,06■■■■□ 3,04
Odc1-201ENSMUST00000171737 Itsn1Q9Z0R4 1714 aa34,04■■■■□ 3,04
Odc1-201ENSMUST00000171737 AU022751B1B0V2 589 aa34,02■■■■□ 3,04
Odc1-201ENSMUST00000171737 PtprmP28828 1452 aa34,02■■■■□ 3,04
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ercc6l2Q9JIM3 1537 aa34■■■■□ 3,03
Odc1-201ENSMUST00000171737 Setd1aE9PYH6 1716 aa33,99■■■■□ 3,03
Odc1-201ENSMUST00000171737 Med14A2ABV5 1459 aaKnown RBP33,97■■■■□ 3,03
Odc1-201ENSMUST00000171737 Prrc2bQ7TPM1 1486 aaKnown RBP33,96■■■■□ 3,03
Odc1-201ENSMUST00000171737 Sipa1l1Q8C0T5 1782 aa33,93■■■■□ 3,02
Odc1-201ENSMUST00000171737 Zbtb4Q5F293 982 aa33,92■■■■□ 3,02
Odc1-201ENSMUST00000171737 Rock2P70336 1388 aa33,92■■■■□ 3,02
Odc1-201ENSMUST00000171737 Naip7Q9JIB3 1402 aa33,91■■■■□ 3,02
Odc1-201ENSMUST00000171737 Fan1Q69ZT1 1020 aa33,9■■■■□ 3,02
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gm20521D3Z5F7 333 aa33,89■■■■□ 3,02
Odc1-201ENSMUST00000171737 Os9Q8K2C7 672 aa33,89■■■■□ 3,02
Odc1-201ENSMUST00000171737 Srpk2O54781 681 aaKnown RBP33,89■■■■□ 3,02
Odc1-201ENSMUST00000171737 Plekhg5Q66T02 1073 aa33,87■■■■□ 3,01
Odc1-201ENSMUST00000171737 Pola1P33609 1465 aa33,87■■■■□ 3,01
Odc1-201ENSMUST00000171737 Safb2Q80YR5 991 aaKnown RBP33,84■■■■□ 3,01
Odc1-201ENSMUST00000171737 DnmbpQ6TXD4 1580 aa33,83■■■■□ 3,01
Odc1-201ENSMUST00000171737 Srcin1Q9QWI6 1250 aa33,81■■■■□ 3
Odc1-201ENSMUST00000171737 Dip2bQ3UH60 1574 aa33,79■■■■□ 3
Odc1-201ENSMUST00000171737 Puf60Q3UEB3 564 aaKnown RBP33,79■■■■□ 3
Odc1-201ENSMUST00000171737 Nphp4P59240 1425 aa33,79■■■■□ 3
Odc1-201ENSMUST00000171737 Chd2E9PZM4 1827 aaKnown RBP33,78■■■■□ 3
Odc1-201ENSMUST00000171737 Itsn2Q9Z0R6 1659 aa33,77■■■■□ 3
Odc1-201ENSMUST00000171737 Tubgcp6G5E8P0 1769 aa33,77■■■■□ 3
Odc1-201ENSMUST00000171737 Lrrc7Q80TE7 1490 aa33,76■■■□□ 2,99
Odc1-201ENSMUST00000171737 Zc3h13E9Q784 1729 aaKnown RBP33,75■■■□□ 2,99
Odc1-201ENSMUST00000171737 Arhgef28P97433 1693 aa33,75■■■□□ 2,99
Odc1-201ENSMUST00000171737 Usp40Q8BWR4 1235 aa33,75■■■□□ 2,99
Odc1-201ENSMUST00000171737 Kdm5aQ3UXZ9 1690 aa33,74■■■□□ 2,99
Odc1-201ENSMUST00000171737 Ift172Q6VH22 1749 aa33,74■■■□□ 2,99
Odc1-201ENSMUST00000171737 Smg6P61406 1418 aaKnown RBP33,74■■■□□ 2,99
Odc1-201ENSMUST00000171737 Alpk3Q924C5 1678 aa33,72■■■□□ 2,99
Odc1-201ENSMUST00000171737 Slc52a2Q9D8F3 450 aa33,71■■■□□ 2,99
Odc1-201ENSMUST00000171737 Slc24a1Q91WD8 1130 aa33,69■■■□□ 2,98
Odc1-201ENSMUST00000171737 PplQ9R269 1755 aa33,68■■■□□ 2,98
Odc1-201ENSMUST00000171737 PalldQ9ET54 1408 aa33,68■■■□□ 2,98
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gtf2e1Q9D0D5 440 aa33,67■■■□□ 2,98
Odc1-201ENSMUST00000171737 Nop58Q6DFW4 536 aaKnown RBP33,66■■■□□ 2,98
Odc1-201ENSMUST00000171737 Stard8Q8K031 1019 aa33,65■■■□□ 2,98
Odc1-201ENSMUST00000171737 4930407I10RikD3Z5T8 1512 aa33,64■■■□□ 2,98
Odc1-201ENSMUST00000171737 MaddQ80U28 1577 aa33,64■■■□□ 2,98
Odc1-201ENSMUST00000171737 Shq1Q7TMX5 569 aa33,64■■■□□ 2,98
Odc1-201ENSMUST00000171737 Eif2ak4Q9QZ05 1648 aa33,64■■■□□ 2,98
Odc1-201ENSMUST00000171737 Atp1b4Q99ME6 356 aa33,61■■■□□ 2,97
Odc1-201ENSMUST00000171737 P3h3Q8CG70 732 aa33,61■■■□□ 2,97
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gemin5Q8BX17 1502 aaKnown RBP33,58■■■□□ 2,97
Odc1-201ENSMUST00000171737 Q9D9H8 365 aa33,57■■■□□ 2,96
Odc1-201ENSMUST00000171737 Sbno1Q689Z5 1390 aa33,56■■■□□ 2,96
Odc1-201ENSMUST00000171737 PrxO55103 1391 aa33,54■■■□□ 2,96
Odc1-201ENSMUST00000171737 Cep170bQ80U49 1574 aa33,54■■■□□ 2,96
Odc1-201ENSMUST00000171737 Dip2aQ8BWT5 1523 aa33,54■■■□□ 2,96
Odc1-201ENSMUST00000171737 Asxl2Q8BZ32 1370 aa33,51■■■□□ 2,96
Odc1-201ENSMUST00000171737 Txndc2Q6P902 515 aa33,51■■■□□ 2,96
Odc1-201ENSMUST00000171737 Stag3O70576 1240 aa33,51■■■□□ 2,95
Odc1-201ENSMUST00000171737 Stk26Q99JT2 416 aa33,5■■■□□ 2,95
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gm13695A2AK44 830 aa33,49■■■□□ 2,95
Odc1-201ENSMUST00000171737 IghaA0A0A6YXW6 389 aa33,47■■■□□ 2,95
Odc1-201ENSMUST00000171737 Bcl9Q9D219 1425 aa33,46■■■□□ 2,95
Odc1-201ENSMUST00000171737 MyclP10166 368 aa33,46■■■□□ 2,95
Odc1-201ENSMUST00000171737 Pank3Q8R2W9 370 aa33,45■■■□□ 2,95
Odc1-201ENSMUST00000171737 MlecQ6ZQI3 291 aaKnown RBP33,45■■■□□ 2,95
Odc1-201ENSMUST00000171737 IqubQ8CDK3 788 aa33,45■■■□□ 2,95
Odc1-201ENSMUST00000171737 Psme1P97371 249 aa33,44■■■□□ 2,94
Odc1-201ENSMUST00000171737 Slc4a1apE9PX68 744 aa33,43■■■□□ 2,94
Odc1-201ENSMUST00000171737 Topaz1E5FYH1 1653 aa33,42■■■□□ 2,94
Odc1-201ENSMUST00000171737 Slit3Q9WVB4 1523 aa33,4■■■□□ 2,94
Odc1-201ENSMUST00000171737 Abca14E9Q8F8 1683 aa33,39■■■□□ 2,94
Odc1-201ENSMUST00000171737 Gm16486A0A1D5RMD1 1434 aa33,39■■■□□ 2,94
Odc1-201ENSMUST00000171737 Inpp5dQ9ES52 1191 aa33,39■■■□□ 2,94
Odc1-201ENSMUST00000171737 Tmf1B9EKI3 1091 aa33,37■■■□□ 2,93
Odc1-201ENSMUST00000171737 Utp14aQ640M1 767 aaKnown RBP33,36■■■□□ 2,93
Odc1-201ENSMUST00000171737 Wwc2Q6NXJ0 1187 aa33,36■■■□□ 2,93
Odc1-201ENSMUST00000171737 Exoc6Q8R313 802 aa33,35■■■□□ 2,93
Odc1-201ENSMUST00000171737 Plekhg1F6S200 1446 aa33,34■■■□□ 2,93
Odc1-201ENSMUST00000171737 Fam184bQ0KK56 942 aa33,33■■■□□ 2,93
Odc1-201ENSMUST00000171737 InsrP15208 1372 aa33,32■■■□□ 2,92
Odc1-201ENSMUST00000171737 Zscan10Q3URR7 782 aa33,31■■■□□ 2,92
Odc1-201ENSMUST00000171737 CenpjQ569L8 1344 aa33,31■■■□□ 2,92
Odc1-201ENSMUST00000171737 Nwd1A6H603 1563 aa33,3■■■□□ 2,92
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 39,1 ms