RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000044155.14

Ubash3b-201, Transcript of Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ubash3b, Length 6,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Tnnt2P50752 301 aa18.8■□□□□ 0.6
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gm21969J3QJZ1 289 aa18.79■□□□□ 0.6
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Filip1lQ6P6L0 1131 aa18.79■□□□□ 0.6
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Rpgrip1lQ8CG73 1264 aa18.78■□□□□ 0.6
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Rsph3aQ3UFY4 516 aa18.78■□□□□ 0.6
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Atf3Q60765 181 aa18.78■□□□□ 0.6
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Krt82Q99M74 516 aa18.78■□□□□ 0.6
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Puf60Q3UEB3 564 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Zpr1Q62384 459 aa18.77■□□□□ 0.6
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Hmox1P14901 289 aa18.76■□□□□ 0.59
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 St18Q80TY4 1045 aa18.76■□□□□ 0.59
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Pde4cQ3UEI1 686 aa18.76■□□□□ 0.59
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Nap1l3Q794H2 544 aa18.76■□□□□ 0.59
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Map3k5O35099 1380 aa18.75■□□□□ 0.59
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Polr3gQ6NXY9 223 aa18.75■□□□□ 0.59
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Sirt1Q923E4 737 aa18.75■□□□□ 0.59
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Phactr2B1AVP0 632 aa18.75■□□□□ 0.59
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Rbm25B2RY56 838 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Atp2b2Q9R0K7 1198 aa18.74■□□□□ 0.59
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gsdma3Q5Y4Y6 464 aa18.74■□□□□ 0.59
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ddx11Q6AXC6 880 aa18.74■□□□□ 0.59
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ralbp1Q62172 648 aa18.74■□□□□ 0.59
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Pank1Q8K4K6 548 aa18.74■□□□□ 0.59
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Q8C5K5 320 aa18.74■□□□□ 0.59
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gm10471E9Q1C7 252 aa18.73■□□□□ 0.59
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Casq1O09165 405 aa18.73■□□□□ 0.59
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Eva1cP58659 440 aa18.73■□□□□ 0.59
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Tpm3P21107 285 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ccp110Q7TSH4 1004 aa18.72■□□□□ 0.59
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ccdc30Q8BVF4 654 aa18.72■□□□□ 0.59
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Sytl4Q9R0Q1 673 aa18.72■□□□□ 0.59
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Evi5lH3BKQ3 813 aa18.72■□□□□ 0.59
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ak7Q9D2H2 614 aa18.71■□□□□ 0.59
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Nsd2Q8BVE8 1365 aa18.71■□□□□ 0.59
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 TatQ8QZR1 454 aa18.71■□□□□ 0.59
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Cfdp1O88271 295 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Trim30aP15533 496 aa18.71■□□□□ 0.59
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Trim58Q5NCC9 485 aa18.7■□□□□ 0.58
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Swt1Q9DBQ9 907 aa18.7■□□□□ 0.58
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Wdr78E9PYY5 807 aa18.7■□□□□ 0.58
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Noc3lQ8VI84 807 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Mphosph10Q810V0 681 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Rrp12Q6P5B0 1295 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gnai1B2RSH2 354 aa18.69■□□□□ 0.58
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gnai3Q9DC51 354 aa18.69■□□□□ 0.58
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Sv2bQ8BG39 683 aa18.69■□□□□ 0.58
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 MpripP97434 1024 aa18.68■□□□□ 0.58
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 CrcpO35427 148 aa18.68■□□□□ 0.58
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 KinQ8K339 391 aa18.68■□□□□ 0.58
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Stk3Q9JI10 497 aa18.68■□□□□ 0.58
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Utp3Q9JI13 469 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Tpm4Q6IRU2 248 aa18.67■□□□□ 0.58
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gabpb2P81069 414 aa18.67■□□□□ 0.58
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Arid4aF8VPQ2 1261 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Sf3b2Q3UJB0 878 aaKnown RBP18.66■□□□□ 0.58
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Q9D2X8 372 aa18.66■□□□□ 0.58
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Sh3bgrQ9WUZ7 214 aa18.66■□□□□ 0.58
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Drc7Q6V3W6 876 aa18.66■□□□□ 0.58
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Cspp1B2RX88 1205 aa18.66■□□□□ 0.58
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ift140E9PY46 1464 aa18.66■□□□□ 0.58
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Samd1D3YXK1 519 aa18.65■□□□□ 0.58
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Srek1Q8BZX4 494 aaKnown RBP18.65■□□□□ 0.58
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Zranb3Q6NZP1 1069 aa18.65■□□□□ 0.58
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Cd109Q8R422 1442 aa18.65■□□□□ 0.58
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Tpm2P58774 284 aa18.65■□□□□ 0.58
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 NexnQ7TPW1 607 aa18.65■□□□□ 0.58
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Cplx1P63040 134 aa18.64■□□□□ 0.57
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Bicd2Q921C5 820 aa18.64■□□□□ 0.57
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Q7TT23 1179 aa18.63■□□□□ 0.57
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Cplx2P84086 134 aa18.63■□□□□ 0.57
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Rec8Q8C5S7 591 aa18.63■□□□□ 0.57
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Arhgap31A6X8Z5 1425 aa18.63■□□□□ 0.57
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Rnf20Q5DTM8 973 aa18.62■□□□□ 0.57
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ccdc43Q9CR29 222 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Fam193aQ8CGI1 1231 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ddx54Q8K4L0 874 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Kif16bB1AVY7 1312 aa18.61■□□□□ 0.57
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 FanciQ8K368 1330 aa18.61■□□□□ 0.57
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Becn1O88597 448 aa18.61■□□□□ 0.57
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 PnisrA2AJT4 805 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Abl1P00520 1123 aa18.61■□□□□ 0.57
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Nol12Q8BG17 217 aa18.61■□□□□ 0.57
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Mad1l1Q9WTX8 717 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Cnnm1Q0GA42 951 aa18.61■□□□□ 0.57
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ankrd36D3Z4K0 1415 aa18.61■□□□□ 0.57
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Evc2Q8K1G2 1220 aa18.6■□□□□ 0.57
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Klf15Q9EPW2 415 aa18.6■□□□□ 0.57
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Smc3Q9CW03 1217 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 KarsQ99MN1 595 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Smg7Q5RJH6 1138 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ncbp3Q8BZR9 615 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Odf2A3KGV1 830 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Erc2Q6PH08 957 aa18.59■□□□□ 0.57
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 PhaxQ9JJT9 385 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Duox2A2AQ99 1517 aa18.59■□□□□ 0.57
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Cyp46a1Q9WVK8 500 aa18.59■□□□□ 0.57
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Cabp2Q9JLK4 216 aa18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 16.3 ms