RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000031205.15

Gfi1-201, Transcript of Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gfi1, Length 2,860 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Plcd4Q8K3R3 807 aa24.28■■□□□ 1.48
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Armcx1Q9CX83 456 aa24.28■■□□□ 1.48
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Chmp5Q9D7S9 219 aa24.28■■□□□ 1.48
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Mast1Q9R1L5 1570 aa24.28■■□□□ 1.48
Gfi1-201ENSMUST00000031205 NhsB1AV60 1647 aa24.27■■□□□ 1.48
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Gtf3c3Q3TMP1 882 aa24.27■■□□□ 1.48
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Ecm2Q5FW85 670 aa24.26■■□□□ 1.47
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Dcaf11Q91VU6 549 aa24.26■■□□□ 1.47
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Srcin1Q9QWI6 1250 aa24.25■■□□□ 1.47
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Cfap74Q3UY96 1578 aa24.25■■□□□ 1.47
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Rwdd1Q9CQK7 243 aa24.24■■□□□ 1.47
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Tubgcp6G5E8P0 1769 aa24.24■■□□□ 1.47
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Adamts13Q769J6 1426 aa24.23■■□□□ 1.47
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Arid3cA6PWV5 409 aa24.22■■□□□ 1.47
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Nlrp6Q91WS2 869 aa24.22■■□□□ 1.47
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Kdm2bQ6P1G2 1309 aa24.21■■□□□ 1.47
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Edc4Q3UJB9 1406 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Usp54Q8BL06 1588 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Eif2s2Q99L45 331 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Abcc3B2RX12 1523 aa24.2■■□□□ 1.46
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Mink1Q9JM52 1308 aa24.2■■□□□ 1.46
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Fam184bQ0KK56 942 aa24.2■■□□□ 1.46
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Polr3glQ8R0C0 218 aa24.2■■□□□ 1.46
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Trim26Q99PN3 545 aa24.2■■□□□ 1.46
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Trim30dE9PWL0 497 aa24.19■■□□□ 1.46
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Kif3bQ61771 747 aa24.19■■□□□ 1.46
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Stk24Q99KH8 431 aa24.19■■□□□ 1.46
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Rangap1P46061 589 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Pank1Q8K4K6 548 aa24.17■■□□□ 1.46
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Cep170Q6A065 1588 aa24.17■■□□□ 1.46
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Plch2A2AP18 1501 aa24.17■■□□□ 1.46
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Kif7B7ZNG0 1348 aa24.17■■□□□ 1.46
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Prdm16A2A935 1275 aa24.17■■□□□ 1.46
Gfi1-201ENSMUST00000031205 EspnQ9ET47 871 aa24.17■■□□□ 1.46
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Hecw1Q8K4P8 1604 aa24.17■■□□□ 1.46
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Abca8bQ8K440 1620 aa24.17■■□□□ 1.46
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Ccdc30Q8BVF4 654 aa24.17■■□□□ 1.46
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Kif1bQ60575 1816 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Setd1aE9PYH6 1716 aa24.16■■□□□ 1.46
Gfi1-201ENSMUST00000031205 NudcO35685 332 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Irx3P81067 507 aa24.16■■□□□ 1.46
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Tulp4Q9JIL5 1547 aa24.16■■□□□ 1.46
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Kidins220E9Q9B7 1793 aa24.15■■□□□ 1.46
Gfi1-201ENSMUST00000031205 ShprhQ7TPQ3 1674 aa24.15■■□□□ 1.46
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Tex14Q7M6U3 1450 aa24.14■■□□□ 1.46
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa24.14■■□□□ 1.45
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Gm20521D3Z5F7 333 aa24.13■■□□□ 1.45
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Amer1Q7TS75 1132 aa24.13■■□□□ 1.45
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Dnai1Q8C0M8 701 aa24.13■■□□□ 1.45
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Atxn3Q9CVD2 355 aa24.13■■□□□ 1.45
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Fan1Q69ZT1 1020 aa24.12■■□□□ 1.45
Gfi1-201ENSMUST00000031205 TnikP83510 1323 aa24.12■■□□□ 1.45
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Robo2Q7TPD3 1470 aa24.11■■□□□ 1.45
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Ppip5k1A2ARP1 1436 aa24.11■■□□□ 1.45
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Xrn1P97789 1719 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Neurl4Q5NCX5 1563 aa24.1■■□□□ 1.45
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Ak7Q9D2H2 614 aa24.09■■□□□ 1.45
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Rab3gap2Q8BMG7 1366 aa24.09■■□□□ 1.45
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Nsd2Q8BVE8 1365 aa24.07■■□□□ 1.44
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Abcc6Q9R1S7 1498 aa24.06■■□□□ 1.44
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Gm16486A0A1D5RMD1 1434 aa24.06■■□□□ 1.44
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Kiaa1210E9Q0C6 1637 aa24.06■■□□□ 1.44
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Smc5Q8CG46 1101 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Plekhh1Q80TI1 1356 aa24.05■■□□□ 1.44
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Spryd3E9Q9B3 442 aa24.04■■□□□ 1.44
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Usp19Q3UJD6 1360 aa24.03■■□□□ 1.44
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Golga2Q921M4 999 aa24.03■■□□□ 1.44
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Hsp90ab1P11499 724 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Gm6268A2A3U9 297 aa24.02■■□□□ 1.44
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Usp40Q8BWR4 1235 aa24.02■■□□□ 1.44
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Rlbp1Q9Z275 317 aa24.01■■□□□ 1.43
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Pnmal2G3X9N3 661 aa24.01■■□□□ 1.43
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Abca17E9PX95 1733 aa24■■□□□ 1.43
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Gtf2e1Q9D0D5 440 aa23.99■■□□□ 1.43
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Myo5cE9Q1F5 1742 aa23.97■■□□□ 1.43
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Lemd3Q9WU40 921 aa23.97■■□□□ 1.43
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Mbd3Q9Z2D8 285 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Ppp1r3fQ9JIG4 799 aa23.97■■□□□ 1.43
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Srpk2O54781 681 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Ttc21bQ0HA38 1315 aa23.94■■□□□ 1.42
Gfi1-201ENSMUST00000031205 PtprtQ99M80 1454 aa23.94■■□□□ 1.42
Gfi1-201ENSMUST00000031205 KarsQ99MN1 595 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Kiaa1107Q80TK0 1369 aa23.94■■□□□ 1.42
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Ylpm1Q9R0I7 1386 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Apaf1O88879 1249 aa23.93■■□□□ 1.42
Gfi1-201ENSMUST00000031205 P2rx7Q9Z1M0 595 aa23.93■■□□□ 1.42
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Zranb1Q7M760 708 aa23.93■■□□□ 1.42
Gfi1-201ENSMUST00000031205 ErbinQ80TH2 1402 aa23.92■■□□□ 1.42
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Cluap1Q8R3P7 413 aa23.92■■□□□ 1.42
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Senp3Q9EP97 568 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Abca6Q8K441 1624 aa23.92■■□□□ 1.42
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Duxf3A0A0N4SV92 674 aa23.91■■□□□ 1.42
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Abca9Q8K449 1623 aa23.91■■□□□ 1.42
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Ccdc183A2AJB1 534 aa23.91■■□□□ 1.42
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Ipo8Q7TMY7 1010 aa23.91■■□□□ 1.42
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Igf1rQ60751 1373 aa23.9■■□□□ 1.42
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Zfyve16Q80U44 1528 aa23.9■■□□□ 1.42
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Sbno1Q689Z5 1390 aa23.89■■□□□ 1.42
Gfi1-201ENSMUST00000031205 Mre11Q61216 706 aa23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 26.6 ms