RNA–Protein interactions for RNA: YOR264W

DSE3, Transcript of Daughter cell-specific protein, may help establish daughter fate, yeast

Gene DSE3, Length 1,293 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSE3	YOR264W	SPA2	P23201	1466 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
DSE3	YOR264W	YLR156W	P0CE96	114 aa		2.75	□□□□□ -1.97
DSE3	YOR264W	YLR159W	P0CE97	114 aa		2.75	□□□□□ -1.97
DSE3	YOR264W	YLR161W	P0CE98	114 aa		2.75	□□□□□ -1.97
DSE3	YOR264W	RAD17	P48581	401 aa		2.75	□□□□□ -1.97
DSE3	YOR264W	MGA1	P53050	456 aa		2.75	□□□□□ -1.97
DSE3	YOR264W	GAS3	Q03655	524 aa		2.75	□□□□□ -1.97
DSE3	YOR264W	TDA8	Q6B2U8	126 aa		2.75	□□□□□ -1.97
DSE3	YOR264W	NCB2	Q92317	146 aa		2.75	□□□□□ -1.97
DSE3	YOR264W	CDC7	P06243	507 aa		2.74	□□□□□ -1.97
DSE3	YOR264W	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
DSE3	YOR264W	MRPS28	P21771	286 aa		2.73	□□□□□ -1.97
DSE3	YOR264W	MRPL28	P36527	147 aa		2.73	□□□□□ -1.97
DSE3	YOR264W	TIR3	P40552	269 aa		2.73	□□□□□ -1.97
DSE3	YOR264W	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
DSE3	YOR264W	PGA2	P53903	129 aa		2.73	□□□□□ -1.97
DSE3	YOR264W	GIS3	Q12418	502 aa		2.73	□□□□□ -1.97
DSE3	YOR264W	PRX1	P34227	261 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
DSE3	YOR264W	SKG1	P36169	355 aa		2.72	□□□□□ -1.97
DSE3	YOR264W	SVP26	P38869	228 aa		2.72	□□□□□ -1.97
DSE3	YOR264W	ICE2	P40499	491 aa		2.72	□□□□□ -1.97
DSE3	YOR264W	YDR157W	A0A023PZE8	133 aa		2.71	□□□□□ -1.98
DSE3	YOR264W	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
DSE3	YOR264W	BNA7	Q04066	261 aa		2.71	□□□□□ -1.98
DSE3	YOR264W	TCA17	P32613	152 aa		2.7	□□□□□ -1.98
DSE3	YOR264W	RMD6	P39975	231 aa		2.7	□□□□□ -1.98
DSE3	YOR264W	BOL2	P53082	120 aa		2.7	□□□□□ -1.98
DSE3	YOR264W	BUD25	P85052	153 aa		2.7	□□□□□ -1.98
DSE3	YOR264W	SML1	Q04964	104 aa		2.7	□□□□□ -1.98
DSE3	YOR264W	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
DSE3	YOR264W	GCN3	P14741	305 aa		2.69	□□□□□ -1.98
DSE3	YOR264W	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.69	□□□□□ -1.98	not detected
DSE3	YOR264W	NTG1	P31378	399 aa		2.69	□□□□□ -1.98
DSE3	YOR264W	SIP3	P38717	1229 aa		2.69	□□□□□ -1.98
DSE3	YOR264W	AST2	P39945	430 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
DSE3	YOR264W	AVT2	P39981	480 aa		2.69	□□□□□ -1.98
DSE3	YOR264W	PDR17	P53844	350 aa		2.69	□□□□□ -1.98
DSE3	YOR264W	SWP1	Q02795	286 aa		2.69	□□□□□ -1.98
DSE3	YOR264W	TSC3	Q3E790	80 aa		2.69	□□□□□ -1.98
DSE3	YOR264W	YBR219C	P38317	127 aa		2.68	□□□□□ -1.98
DSE3	YOR264W	YNL217W	P40152	326 aa		2.68	□□□□□ -1.98
DSE3	YOR264W	IRC18	P47056	224 aa		2.68	□□□□□ -1.98
DSE3	YOR264W	MRPL17	P36528	281 aa		2.67	□□□□□ -1.98
DSE3	YOR264W	YPL162C	Q12042	273 aa		2.67	□□□□□ -1.98
DSE3	YOR264W	YHR214C-E	Q8TGK0	99 aa		2.67	□□□□□ -1.98
DSE3	YOR264W	SSN2	P38931	1420 aa		2.67	□□□□□ -1.98
DSE3	YOR264W	YOL162W	P0CF19	215 aa		2.66	□□□□□ -1.98
DSE3	YOR264W	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	2.66	□□□□□ -1.98
DSE3	YOR264W	SPS18	P32572	300 aa		2.66	□□□□□ -1.98
DSE3	YOR264W	SEC17	P32602	292 aa		2.66	□□□□□ -1.98
DSE3	YOR264W	FZF1	P32805	299 aa		2.66	□□□□□ -1.98
DSE3	YOR264W	PTM1	P32857	523 aa		2.66	□□□□□ -1.98
DSE3	YOR264W	YET1	P35723	206 aa		2.66	□□□□□ -1.98
DSE3	YOR264W	UTP30	P36144	274 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
DSE3	YOR264W	YRB2	P40517	327 aa		2.66	□□□□□ -1.98
DSE3	YOR264W	DOC1	P53068	250 aa		2.66	□□□□□ -1.98
DSE3	YOR264W	MCP1	Q12106	302 aa		2.66	□□□□□ -1.98
DSE3	YOR264W	TIM9	O74700	87 aa		2.65	□□□□□ -1.99
DSE3	YOR264W	UMP1	P38293	148 aa		2.65	□□□□□ -1.99
DSE3	YOR264W	YNR077C	P53758	84 aa		2.65	□□□□□ -1.99
DSE3	YOR264W	FLO9	P39712	1322 aa		2.65	□□□□□ -1.99
DSE3	YOR264W	TUS1	Q06412	1307 aa		2.65	□□□□□ -1.99
DSE3	YOR264W	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
DSE3	YOR264W	SNC2	P33328	115 aa		2.64	□□□□□ -1.99
DSE3	YOR264W	TAF14	P35189	244 aa		2.64	□□□□□ -1.99
DSE3	YOR264W	YKR045C	P36138	183 aa		2.64	□□□□□ -1.99
DSE3	YOR264W	MET5	P47169	1442 aa		2.64	□□□□□ -1.99
DSE3	YOR264W	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	2.63	□□□□□ -1.99
DSE3	YOR264W	KSS1	P14681	368 aa		2.63	□□□□□ -1.99
DSE3	YOR264W	TRM5	P38793	499 aa		2.63	□□□□□ -1.99
DSE3	YOR264W	YER135C	P40082	130 aa		2.63	□□□□□ -1.99
DSE3	YOR264W	EAF6	P47128	113 aa		2.63	□□□□□ -1.99
DSE3	YOR264W	YGR050C	P53231	118 aa		2.63	□□□□□ -1.99
DSE3	YOR264W	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	2.62	□□□□□ -1.99
DSE3	YOR264W	MER1	P16523	270 aa		2.62	□□□□□ -1.99
DSE3	YOR264W	BET1	P22804	142 aa		2.62	□□□□□ -1.99
DSE3	YOR264W	YCR087C-A	P37263	153 aa		2.62	□□□□□ -1.99
DSE3	YOR264W	IKI1	P38874	309 aa		2.62	□□□□□ -1.99
DSE3	YOR264W	GVP36	P40531	326 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
DSE3	YOR264W	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
DSE3	YOR264W	MDM32	Q12171	622 aa		2.62	□□□□□ -1.99
DSE3	YOR264W	PDR18	P53756	1333 aa		2.62	□□□□□ -1.99
DSE3	YOR264W	TY1B-DR4	Q07793	1604 aa		2.61	□□□□□ -1.99
DSE3	YOR264W	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
DSE3	YOR264W	HTB2	P02294	131 aa		2.61	□□□□□ -1.99
DSE3	YOR264W	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
DSE3	YOR264W	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
DSE3	YOR264W	PET191	Q02772	108 aa		2.61	□□□□□ -1.99
DSE3	YOR264W	URA5	P13298	226 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
DSE3	YOR264W	YDR249C	Q03787	373 aa		2.6	□□□□□ -1.99
DSE3	YOR264W	YFR032C-B	Q8TGU2	87 aa		2.6	□□□□□ -1.99
DSE3	YOR264W	RFA3	P26755	122 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
DSE3	YOR264W	GAA1	P39012	614 aa		2.59	□□□□□ -1.99
DSE3	YOR264W	CSI2	Q08054	341 aa		2.59	□□□□□ -1.99
DSE3	YOR264W	GPM2	Q12008	311 aa		2.59	□□□□□ -1.99
DSE3	YOR264W	MAG1	P22134	296 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
DSE3	YOR264W	SAY1	P53324	424 aa		2.58	□□□□□ -2
DSE3	YOR264W	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
DSE3	YOR264W	YLR162W	Q06235	118 aa		2.58	□□□□□ -2
DSE3	YOR264W	YOL160W	Q08321	113 aa		2.58	□□□□□ -2

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