RNA–Protein interactions for RNA: YOL054W

PSH1, Transcript of E3 ubiquitin ligase targeting centromere-binding protein Cse4p, yeast

Gene PSH1, Length 1,221 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PSH1	YOL054W	FYV6	P53913	173 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	EKI1	Q03764	534 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	YDR248C	Q03786	193 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	CAB5	Q03941	241 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	RTT103	Q05543	409 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	YCT1	Q12235	531 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	YOR343C	Q12484	108 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	COX19	Q3E731	98 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	CYR1	P08678	2026 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	FMP27	Q06179	2628 aa		4.9	□□□□□ -1.62
PSH1	YOL054W	ADH3	P07246	375 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	YFR010W-A	P0C5N0	62 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	STE18	P18852	110 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	YPT53	P36019	220 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	FRM2	P37261	193 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	SDH4	P37298	181 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	YHR180W	P38868	163 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	YEA6	P39953	335 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	YJR056C	P47115	236 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	DAN1	P47178	298 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	YGR126W	P53274	230 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	GPI15	P53961	229 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	SAM50	P53969	484 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	YMR253C	Q04835	414 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	NNT1	Q05874	261 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	COQ3	P27680	312 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	PPA2	P28239	310 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	YBL010C	P32788	280 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	MRPL4	P36517	319 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	AVT5	P38176	459 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	VMA21	P41806	77 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	SNO3	P43544	222 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	PKP2	P53170	491 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	MPA43	P53583	542 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	DUG3	P53871	357 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	YLR460C	P54007	376 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	PET191	Q02772	108 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	TMA23	Q03525	211 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	MIM1	Q08176	113 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	SCEI	P03882	235 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	MSW1	P04803	379 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	SGA1	P08019	549 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	RPB3	P16370	318 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	STP22	P25604	385 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	FAA1	P30624	700 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	YKL097C	P34245	136 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	RPS27A	P35997	82 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	RPS27B	P38711	82 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	PFS1	P38872	237 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	BAT1	P38891	393 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	YEA4	P40004	342 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	XBP1	P40489	647 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	PAU15	P40585	124 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	ALG9	P53868	555 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	THI74	Q04083	370 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	IRC19	Q07843	230 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	HNT3	Q08702	217 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	UBA3	Q99344	299 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	YSF3	P0C074	85 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	SEC59	P20048	519 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	RIB5	P38145	238 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	YBR292C	P38357	123 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	YPT31	P38555	223 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	TIF34	P40217	347 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	YIL152W	P40455	235 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	YFR054C	P43622	192 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	BRR6	P53062	197 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	RNH201	P53942	307 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	ARL3	Q02804	198 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	RSM10	Q03201	203 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	YPR147C	Q06522	304 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	REX3	Q12090	404 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	YLR118C	Q12354	227 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	SCO1	P23833	295 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	MXR2	P25566	168 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	POF1	P25576	258 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	EHD3	P28817	500 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	AGA2	P32781	87 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	NTF2	P33331	125 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	TRS20	P38334	175 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	WSC4	P38739	605 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	GNA1	P43577	159 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PSH1	YOL054W	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63

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