RNA–Protein interactions for RNA: YOL006C

TOP1, Transcript of Topoisomerase I, yeast

Gene TOP1, Length 2,310 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TOP1	YOL006C	IES4	Q08561	116 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOP1	YOL006C	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	2.81	□□□□□ -1.96
TOP1	YOL006C	PRR2	Q12310	699 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOP1	YOL006C	MPD1	Q12404	318 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
TOP1	YOL006C	PDR18	P53756	1333 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOP1	YOL006C	CCH1	P50077	2039 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TOP1	YOL006C	CDC7	P06243	507 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TOP1	YOL006C	MAG1	P22134	296 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
TOP1	YOL006C	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
TOP1	YOL006C	CNB1	P25296	175 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TOP1	YOL006C	LDS1	P31379	325 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TOP1	YOL006C	SHE2	P36068	246 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.8	□□□□□ -1.96	not detected
TOP1	YOL006C	HOT13	P36078	116 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TOP1	YOL006C	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
TOP1	YOL006C	MED6	P38782	295 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TOP1	YOL006C	EDC2	P40023	145 aa	Predicted RBP	2.8	□□□□□ -1.96
TOP1	YOL006C	CAT5	P41735	233 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TOP1	YOL006C	BIR1	P47134	954 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TOP1	YOL006C	ARO8	P53090	500 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
TOP1	YOL006C	YGR050C	P53231	118 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TOP1	YOL006C	YNL010W	P53981	241 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
TOP1	YOL006C	ADD37	Q03233	198 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TOP1	YOL006C	CNL1	Q06333	122 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TOP1	YOL006C	YBL008W-A	Q3E821	79 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TOP1	YOL006C	SPO13	P23624	291 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TOP1	YOL006C	STP22	P25604	385 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TOP1	YOL006C	RPC19	P28000	142 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
TOP1	YOL006C	IMP1	P28627	190 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TOP1	YOL006C	SFC1	P33303	322 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TOP1	YOL006C	LHP1	P33399	275 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
TOP1	YOL006C	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
TOP1	YOL006C	YER186C	P40101	306 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TOP1	YOL006C	OST2	P46964	130 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TOP1	YOL006C	TIM13	P53299	105 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TOP1	YOL006C	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
TOP1	YOL006C	YOR342C	Q12182	319 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TOP1	YOL006C	PEP1	P32319	1579 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TOP1	YOL006C	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
TOP1	YOL006C	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
TOP1	YOL006C	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	2.79	□□□□□ -1.96
TOP1	YOL006C	SCO2	P38072	301 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TOP1	YOL006C	AYR1	P40471	297 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TOP1	YOL006C	NCA3	P46955	337 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TOP1	YOL006C	ARP3	P47117	449 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
TOP1	YOL006C	ORM1	P53224	222 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TOP1	YOL006C	PGA1	P53896	198 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TOP1	YOL006C	SAE3	P89114	91 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TOP1	YOL006C	VHS1	Q03785	461 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TOP1	YOL006C	YOR376W	Q08900	122 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TOP1	YOL006C	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
TOP1	YOL006C	YOR214C	Q12282	236 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TOP1	YOL006C	TSC3	Q3E790	80 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TOP1	YOL006C	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TOP1	YOL006C	YCL001W-B	Q96VH2	84 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TOP1	YOL006C	TRP1	P00912	224 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TOP1	YOL006C	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
TOP1	YOL006C	RPL30	P14120	105 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
TOP1	YOL006C	YPL073C	P40323	161 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TOP1	YOL006C	YGR017W	P53210	297 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TOP1	YOL006C	HHO1	P53551	258 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TOP1	YOL006C	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	2.79	□□□□□ -1.96
TOP1	YOL006C	PSF1	Q12488	208 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TOP1	YOL006C	TY1B-DR4	Q07793	1604 aa		2.78	□□□□□ -1.96
TOP1	YOL006C	YOR093C	Q12275	1648 aa		2.78	□□□□□ -1.96
TOP1	YOL006C	TCB3	Q03640	1545 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
TOP1	YOL006C	HIS3	P06633	220 aa		2.78	□□□□□ -1.96
TOP1	YOL006C	ATR1	P13090	542 aa		2.78	□□□□□ -1.96
TOP1	YOL006C	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
TOP1	YOL006C	SMP1	P38128	452 aa		2.78	□□□□□ -1.96
TOP1	YOL006C	SLM2	P53955	656 aa		2.78	□□□□□ -1.96
TOP1	YOL006C	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
TOP1	YOL006C	YMR253C	Q04835	414 aa		2.78	□□□□□ -1.96
TOP1	YOL006C	MRX8	Q05473	314 aa		2.78	□□□□□ -1.96
TOP1	YOL006C	RTR2	Q12378	196 aa		2.78	□□□□□ -1.96
TOP1	YOL006C	YLR099W-A	Q3E798	87 aa		2.78	□□□□□ -1.96
TOP1	YOL006C	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		2.78	□□□□□ -1.96
TOP1	YOL006C	BUD4	P47136	1447 aa		2.78	□□□□□ -1.96
TOP1	YOL006C	TY1B-H	O13535	1793 aa		2.78	□□□□□ -1.96
TOP1	YOL006C	YPT53	P36019	220 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	DLS1	P40366	167 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	YIL012W	P40551	113 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	YFR054C	P43622	192 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	YDR366C	P87287	132 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	THI74	Q04083	370 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	YMR254C	Q04838	102 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	YDL180W	Q12301	547 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	GEA2	P39993	1459 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	BPT1	P14772	1559 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	ADH1	P00330	348 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	DDI2	P0CH63	225 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	DDI3	P0CH64	225 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	PHO13	P19881	312 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	FLO5	P38894	1075 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	AST2	P39945	430 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	FMP48	P53233	369 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	CLD1	P53264	445 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	CAB4	P53332	305 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	YPR011C	Q12251	326 aa		2.77	□□□□□ -1.97
TOP1	YOL006C	RPA190	P10964	1664 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97

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