RNA–Protein interactions for RNA: YLR165C

PUS5, Transcript of Pseudouridine synthase, yeast

Gene PUS5, Length 765 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PUS5	YLR165C	TIM22	Q12328	207 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUS5	YLR165C	JLP1	Q12358	412 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUS5	YLR165C	YDR157W	A0A023PZE8	133 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUS5	YLR165C	RAD10	P06838	210 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUS5	YLR165C	SPT3	P06844	337 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUS5	YLR165C	PPH21	P23594	369 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUS5	YLR165C	MGT1	P26188	188 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUS5	YLR165C	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	not detected
PUS5	YLR165C	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PUS5	YLR165C	SFC1	P33303	322 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUS5	YLR165C	MIG2	P53035	382 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUS5	YLR165C	YJR149W	P47177	404 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PUS5	YLR165C	NUP57	P48837	541 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PUS5	YLR165C	HOP2	P53187	214 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PUS5	YLR165C	YPR063C	Q12160	140 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PUS5	YLR165C	MEI4	P29467	408 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PUS5	YLR165C	ECM13	P38195	257 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PUS5	YLR165C	HAM1	P47119	197 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PUS5	YLR165C	ADO1	P47143	340 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PUS5	YLR165C	MGA1	P53050	456 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PUS5	YLR165C	SPC24	Q04477	213 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PUS5	YLR165C	EMP46	Q12396	444 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PUS5	YLR165C	YPL247C	Q12523	523 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PUS5	YLR165C	ERD2	P18414	219 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PUS5	YLR165C	RNP1	P32385	249 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PUS5	YLR165C	TKL2	P33315	681 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PUS5	YLR165C	SLX1	P38324	304 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PUS5	YLR165C	YIL059C	P40520	121 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PUS5	YLR165C	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PUS5	YLR165C	TPO4	Q12256	659 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PUS5	YLR165C	URA6	P15700	204 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PUS5	YLR165C	TAF14	P35189	244 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PUS5	YLR165C	YBR032W	P38223	100 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PUS5	YLR165C	ARO80	Q04052	950 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PUS5	YLR165C	CDD1	Q06549	142 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PUS5	YLR165C	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PUS5	YLR165C	HTB2	P02294	131 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PUS5	YLR165C	BRR6	P53062	197 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PUS5	YLR165C	MDM34	P53083	459 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PUS5	YLR165C	TOS8	P53147	276 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PUS5	YLR165C	YNL247W	P53852	767 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PUS5	YLR165C	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PUS5	YLR165C	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PUS5	YLR165C	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PUS5	YLR165C	YPK2	P18961	677 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PUS5	YLR165C	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PUS5	YLR165C	AVT2	P39981	480 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PUS5	YLR165C	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PUS5	YLR165C	ILM1	P47155	203 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PUS5	YLR165C	YET3	Q07451	203 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PUS5	YLR165C	MSA1	Q08471	629 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PUS5	YLR165C	YLR053C	Q12026	108 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PUS5	YLR165C	MRX4	Q12467	430 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PUS5	YLR165C	COX5A	P00424	153 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PUS5	YLR165C	RPC19	P28000	142 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PUS5	YLR165C	ETR1	P38071	380 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PUS5	YLR165C	ECM14	P38836	430 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PUS5	YLR165C	IKI1	P38874	309 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PUS5	YLR165C	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PUS5	YLR165C	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PUS5	YLR165C	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PUS5	YLR165C	MER1	P16523	270 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PUS5	YLR165C	SEC22	P22214	214 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PUS5	YLR165C	GEP5	Q12393	293 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PUS5	YLR165C	YPL229W	Q99395	206 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PUS5	YLR165C	RFA3	P26755	122 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PUS5	YLR165C	YRB2	P40517	327 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUS5	YLR165C	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PUS5	YLR165C	IRC18	P47056	224 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUS5	YLR165C	CCH1	P50077	2039 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUS5	YLR165C	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PUS5	YLR165C	YPR172W	Q06608	200 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUS5	YLR165C	GPA2	P10823	449 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUS5	YLR165C	KDX1	P36005	433 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUS5	YLR165C	PRY2	P36110	329 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUS5	YLR165C	PEP8	P40335	379 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUS5	YLR165C	GET1	P53192	235 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUS5	YLR165C	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PUS5	YLR165C	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PUS5	YLR165C	HIS3	P06633	220 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PUS5	YLR165C	RPS23A	P0CX29	145 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PUS5	YLR165C	RPS23B	P0CX30	145 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PUS5	YLR165C	DBF2	P22204	572 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PUS5	YLR165C	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
PUS5	YLR165C	FMT1	P32785	401 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PUS5	YLR165C	SRY1	P36007	326 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PUS5	YLR165C	AIM18	P38884	321 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PUS5	YLR165C	PEX17	P40155	199 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PUS5	YLR165C	CAT5	P41735	233 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PUS5	YLR165C	YGL159W	P53110	370 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PUS5	YLR165C	MSA2	P36157	363 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PUS5	YLR165C	RIO2	P40160	425 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PUS5	YLR165C	BXI1	P48558	297 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PUS5	YLR165C	SNZ1	Q03148	297 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PUS5	YLR165C	FMN1	Q03778	218 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PUS5	YLR165C	HTL1	Q9URQ5	78 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PUS5	YLR165C	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PUS5	YLR165C	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PUS5	YLR165C	RCN1	P36054	211 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PUS5	YLR165C	YHL026C	P38740	315 aa		4.72	□□□□□ -1.65

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