RNA–Protein interactions for RNA: YKR061W

KTR2, Transcript of Mannosyltransferase involved in N-linked protein glycosylation, yeast

Gene KTR2, Length 1,278 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KTR2	YKR061W	YCR007C	P25354	239 aa		3.78	□□□□□ -1.8
KTR2	YKR061W	FUN26	P31381	517 aa		3.78	□□□□□ -1.8
KTR2	YKR061W	TIR2	P33890	251 aa		3.78	□□□□□ -1.8
KTR2	YKR061W	SLM6	P38343	150 aa		3.78	□□□□□ -1.8
KTR2	YKR061W	YBR285W	P38354	144 aa		3.78	□□□□□ -1.8
KTR2	YKR061W	PAN6	P40459	309 aa		3.78	□□□□□ -1.8
KTR2	YKR061W	SER33	P40510	469 aa		3.78	□□□□□ -1.8
KTR2	YKR061W	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
KTR2	YKR061W	VHT1	P53241	593 aa		3.78	□□□□□ -1.8
KTR2	YKR061W	TIM13	P53299	105 aa		3.78	□□□□□ -1.8
KTR2	YKR061W	YNR048W	P53740	393 aa		3.78	□□□□□ -1.8
KTR2	YKR061W	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
KTR2	YKR061W	CCE1	Q03702	353 aa		3.78	□□□□□ -1.8
KTR2	YKR061W	GAT3	Q07928	141 aa		3.78	□□□□□ -1.8
KTR2	YKR061W	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
KTR2	YKR061W	RFM1	Q12192	310 aa		3.78	□□□□□ -1.8
KTR2	YKR061W	RIB3	Q99258	208 aa		3.78	□□□□□ -1.8
KTR2	YKR061W	UBR1	P19812	1950 aa		3.77	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	YAL064W-B	O13512	126 aa		3.77	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	MRPL39	P36533	70 aa		3.77	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	GPX2	P38143	162 aa		3.77	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	PCL5	P38794	229 aa		3.77	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	SIM1	P40472	476 aa		3.77	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	YIL060W	P40519	144 aa		3.77	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	YIL029C	P40538	142 aa		3.77	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	HAC1	P41546	238 aa		3.77	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	ERJ5	P43613	295 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	YJR015W	P47090	510 aa		3.77	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	UFD1	P53044	361 aa		3.77	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	YMR010W	Q03687	405 aa		3.77	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	GPI17	Q04080	534 aa		3.77	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	SPG4	Q04438	115 aa		3.77	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	YDR124W	Q04608	324 aa		3.77	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	FAR10	Q06001	478 aa		3.77	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	YPR114W	Q06107	315 aa		3.77	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	CNL1	Q06333	122 aa		3.77	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	PSF1	Q12488	208 aa		3.77	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	POL2	P21951	2222 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	YKR104W	P0CE69	306 aa		3.76	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	ATG22	P25568	528 aa		3.76	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	MRP49	P32388	137 aa		3.76	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	AEP1	P32493	518 aa		3.76	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	SFC1	P33303	322 aa		3.76	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	SRX1	P36077	127 aa		3.76	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	PRY2	P36110	329 aa		3.76	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	MRP21	P38175	177 aa		3.76	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	LEU5	P38702	357 aa		3.76	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	EGT2	P42835	1041 aa		3.76	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	SER2	P42941	309 aa		3.76	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	COQ5	P49017	307 aa		3.76	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	AVT4	P50944	713 aa		3.76	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	RPL22B	P56628	122 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	NUP100	Q02629	959 aa		3.76	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	RSC9	Q03124	581 aa		3.76	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	LIP2	Q06005	328 aa		3.76	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	TAZ1	Q06510	381 aa		3.76	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	COQ10	Q08058	207 aa		3.76	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	HRD1	Q08109	551 aa		3.76	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	SLD7	Q08457	257 aa		3.76	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	GEP5	Q12393	293 aa		3.76	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	PRM4	Q12498	284 aa		3.76	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		3.75	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	SNF4	P12904	322 aa		3.75	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	UGX2	P32772	223 aa		3.75	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	TRS65	P32893	560 aa		3.75	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	SHE2	P36068	246 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.75	□□□□□ -1.81	not detected
KTR2	YKR061W	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	COS8	P38723	381 aa		3.75	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	DOG2	P38773	246 aa		3.75	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	DOG1	P38774	246 aa		3.75	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	BAT1	P38891	393 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	AYR1	P40471	297 aa		3.75	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	YIL067C	P40514	678 aa		3.75	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	GLC8	P41818	229 aa		3.75	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	YFL015C	P43578	164 aa		3.75	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	YFL012W	P43580	148 aa		3.75	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	ILM1	P47155	203 aa		3.75	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	PAC10	P48363	199 aa		3.75	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	TPN1	P53099	579 aa		3.75	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	YNL184C	P53876	108 aa		3.75	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	SWS2	P53937	143 aa		3.75	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	HHT1	P61830	136 aa		3.75	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	HSK3	P69852	69 aa		3.75	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	YPL113C	Q02961	396 aa		3.75	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	FMN1	Q03778	218 aa		3.75	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	PEX30	Q06169	523 aa		3.75	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	YLR446W	Q06204	433 aa		3.75	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	SHH4	Q06236	168 aa		3.75	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	MCT1	Q12283	360 aa		3.75	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	TRM10	Q12400	293 aa		3.75	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	YKL068W-A	Q3E826	78 aa		3.75	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	NAG1	Q8TGN9	163 aa		3.75	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	CAP2	P13517	287 aa		3.74	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	NSP1	P14907	823 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	YCR100C	P25606	316 aa		3.74	□□□□□ -1.81
KTR2	YKR061W	AHC2	P25649	128 aa		3.74	□□□□□ -1.81

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 18.2 ms