RNA–Protein interactions for RNA: YGL158W

RCK1, Transcript of Protein kinase involved in the response to oxidative stress, yeast

Gene RCK1, Length 1,539 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RCK1	YGL158W	SPS2	P08459	502 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RCK1	YGL158W	ZRC1	P20107	442 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RCK1	YGL158W	YCR099C	P25657	155 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RCK1	YGL158W	RNP1	P32385	249 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RCK1	YGL158W	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RCK1	YGL158W	WSC4	P38739	605 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RCK1	YGL158W	BAT1	P38891	393 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RCK1	YGL158W	RRG9	P40156	214 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RCK1	YGL158W	TIR3	P40552	269 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RCK1	YGL158W	YAE1	P47118	141 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RCK1	YGL158W	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RCK1	YGL158W	GMC1	Q04399	608 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RCK1	YGL158W	SPO77	Q06134	477 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RCK1	YGL158W	PEX30	Q06169	523 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RCK1	YGL158W	LDB18	Q07887	179 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RCK1	YGL158W	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RCK1	YGL158W	FAB1	P34756	2278 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RCK1	YGL158W	PET54	P10834	293 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RCK1	YGL158W	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RCK1	YGL158W	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RCK1	YGL158W	RNA15	P25299	296 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RCK1	YGL158W	SRX1	P36077	127 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RCK1	YGL158W	MAL32	P38158	584 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RCK1	YGL158W	EFM1	P38732	585 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RCK1	YGL158W	NVJ1	P38881	321 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RCK1	YGL158W	REE1	P40893	198 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RCK1	YGL158W	YJR012C	P47087	207 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RCK1	YGL158W	COG7	P53195	279 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RCK1	YGL158W	MAL12	P53341	584 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RCK1	YGL158W	YMR317W	Q04893	1140 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RCK1	YGL158W	DPP1	Q05521	289 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RCK1	YGL158W	IRC25	Q07951	179 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RCK1	YGL158W	FDH1	Q08911	376 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RCK1	YGL158W	CSM4	Q08955	156 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RCK1	YGL158W	TOR2	P32600	2474 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RCK1	YGL158W	YGL041W-A	P0C5N3	154 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RCK1	YGL158W	IFM1	P25038	676 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RCK1	YGL158W	YER184C	P39961	794 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RCK1	YGL158W	MEP2	P41948	499 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RCK1	YGL158W	FMP48	P53233	369 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RCK1	YGL158W	PRM15	Q03262	622 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RCK1	YGL158W	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
RCK1	YGL158W	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	YKL187C	P34231	750 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	YCR087C-A	P37263	153 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	TIF34	P40217	347 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	SWM2	P40342	146 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	IBA57	P47158	497 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	COQ5	P49017	307 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	JAC1	P53193	184 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	FYV6	P53913	173 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	ATG10	Q07879	167 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	YPL245W	Q12179	454 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	YOR114W	Q12219	294 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	PHO80	P20052	293 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	OAC1	P32332	324 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	YBR063C	P38083	404 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	RAD17	P48581	401 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	ERV29	P53337	310 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	DCR2	Q05924	578 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	YCR102C	P25608	368 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	QRI5	P32344	111 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	SEC17	P32602	292 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	UTH1	P36135	365 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	OXA1	P39952	402 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	HPA3	P39979	161 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	YPS5	P53057	165 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	YGR015C	P53208	328 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	HHO1	P53551	258 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	NRM1	P53718	249 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	YPL113C	Q02961	396 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	MIM1	Q08176	113 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	YOR283W	Q12040	230 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	YCL012C	Q8J0M4	134 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	REP2	P03872	296 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	SIR2	P06700	562 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	MIC12	P38341	106 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	COS8	P38723	381 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	KRE9	P39005	276 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	SMB1	P40018	196 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	LSM8	P47093	109 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	YNR066C	P53752	436 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	SNZ1	Q03148	297 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	YGL194C-A	Q2V2P6	80 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	STE7	P06784	515 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	MET2	P08465	486 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	YKR104W	P0CE69	306 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	NAM9	P27929	486 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RCK1	YGL158W	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.62	□□□□□ -1.67	not detected
RCK1	YGL158W	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 26.5 ms