RNA–Protein interactions for RNA: YFR032C

RRT5, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene RRT5, Length 870 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRT5YFR032C IKI1P38874 309 aa8.44□□□□□ -1.06
RRT5YFR032C SSO2P39926 295 aa8.44□□□□□ -1.06
RRT5YFR032C YJL218WP40892 196 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
RRT5YFR032C DIE2P50076 525 aa8.44□□□□□ -1.06
RRT5YFR032C YDR286CQ05530 114 aa8.44□□□□□ -1.06
RRT5YFR032C YOL118CQ08259 102 aa8.44□□□□□ -1.06
RRT5YFR032C RPS18AP0CX55 146 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
RRT5YFR032C RPS18BP0CX56 146 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
RRT5YFR032C RPB7P34087 171 aa8.43□□□□□ -1.06
RRT5YFR032C PHM8P40025 321 aa8.43□□□□□ -1.06
RRT5YFR032C PCL6P40038 420 aa8.43□□□□□ -1.06
RRT5YFR032C VHT1P53241 593 aa8.43□□□□□ -1.06
RRT5YFR032C YDR415CQ04033 374 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
RRT5YFR032C PRM3Q08931 133 aa8.43□□□□□ -1.06
RRT5YFR032C AAC1P04710 309 aa8.42□□□□□ -1.06
RRT5YFR032C FLO10P36170 1169 aa8.42□□□□□ -1.06
RRT5YFR032C YJR011CP47086 261 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
RRT5YFR032C ALG6Q12001 544 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
RRT5YFR032C URA3P03962 267 aa8.41□□□□□ -1.06
RRT5YFR032C GAL1P04385 528 aa8.41□□□□□ -1.06
RRT5YFR032C YBR197CP38306 217 aa8.41□□□□□ -1.06
RRT5YFR032C FCY21P40039 528 aa8.41□□□□□ -1.06
RRT5YFR032C DUO1P53168 247 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
RRT5YFR032C SWT1Q12104 458 aa8.41□□□□□ -1.06
RRT5YFR032C MSS1P32559 526 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
RRT5YFR032C RIB7P33312 244 aa8.4□□□□□ -1.06
RRT5YFR032C FMP23P38231 175 aa8.4□□□□□ -1.06
RRT5YFR032C YIL060WP40519 144 aa8.4□□□□□ -1.06
RRT5YFR032C RBL2P48606 106 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
RRT5YFR032C CAB4P53332 305 aa8.4□□□□□ -1.06
RRT5YFR032C YDR179W-AQ03983 463 aa8.4□□□□□ -1.06
RRT5YFR032C MCH1Q07376 486 aa8.4□□□□□ -1.06
RRT5YFR032C ATG41Q12048 136 aa8.4□□□□□ -1.06
RRT5YFR032C YLR365WQ7LIF2 110 aa8.4□□□□□ -1.06
RRT5YFR032C TDH1P00360 332 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
RRT5YFR032C RPL9AP05738 191 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
RRT5YFR032C SEC66P33754 206 aa8.39□□□□□ -1.07
RRT5YFR032C PCL7P40186 285 aa8.39□□□□□ -1.07
RRT5YFR032C ATG18P43601 500 aa8.39□□□□□ -1.07
RRT5YFR032C RSM27P53305 110 aa8.39□□□□□ -1.07
RRT5YFR032C NDE2Q07500 545 aa8.39□□□□□ -1.07
RRT5YFR032C YOR292CQ08743 309 aa8.39□□□□□ -1.07
RRT5YFR032C RPL24BP24000 155 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
RRT5YFR032C UTR5P32630 166 aa8.38□□□□□ -1.07
RRT5YFR032C RFC2P40348 353 aa8.38□□□□□ -1.07
RRT5YFR032C GVP36P40531 326 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
RRT5YFR032C WWM1P43582 211 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
RRT5YFR032C CWC25P53854 179 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
RRT5YFR032C CKA1P15790 372 aa8.37□□□□□ -1.07
RRT5YFR032C AGA2P32781 87 aa8.37□□□□□ -1.07
RRT5YFR032C GPP2P40106 250 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
RRT5YFR032C TOS8P53147 276 aa8.37□□□□□ -1.07
RRT5YFR032C ASM4Q05166 528 aa8.37□□□□□ -1.07
RRT5YFR032C COX2P00410 251 aa8.36□□□□□ -1.07
RRT5YFR032C YMR31P19955 123 aa8.36□□□□□ -1.07
RRT5YFR032C FLO5P38894 1075 aa8.36□□□□□ -1.07
RRT5YFR032C ERG25P53045 309 aa8.36□□□□□ -1.07
RRT5YFR032C YGR042WP53227 271 aa8.36□□□□□ -1.07
RRT5YFR032C ALG9P53868 555 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
RRT5YFR032C MRPL22P53881 309 aa8.36□□□□□ -1.07
RRT5YFR032C TMA20P89886 181 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
RRT5YFR032C HED1Q03937 162 aa8.36□□□□□ -1.07
RRT5YFR032C RGC1Q06108 1083 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
RRT5YFR032C MRPL35Q06678 367 aa8.36□□□□□ -1.07
RRT5YFR032C YPR108W-AQ3E7B3 70 aa8.36□□□□□ -1.07
RRT5YFR032C ROX3P25046 220 aa8.35□□□□□ -1.07
RRT5YFR032C HOM6P31116 359 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
RRT5YFR032C GEP4P38812 185 aa8.35□□□□□ -1.07
RRT5YFR032C OTU1P43558 301 aa8.35□□□□□ -1.07
RRT5YFR032C YJL163CP46996 555 aa8.35□□□□□ -1.07
RRT5YFR032C YHP1Q04116 353 aa8.35□□□□□ -1.07
RRT5YFR032C YLR281CQ05863 155 aa8.35□□□□□ -1.07
RRT5YFR032C YFH1Q07540 174 aa8.35□□□□□ -1.07
RRT5YFR032C SOG2Q08817 791 aa8.35□□□□□ -1.07
RRT5YFR032C AEP3Q12089 606 aa8.35□□□□□ -1.07
RRT5YFR032C MED4Q12343 284 aa8.35□□□□□ -1.07
RRT5YFR032C SUS1Q6WNK7 96 aa8.35□□□□□ -1.07
RRT5YFR032C GRX2P17695 143 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
RRT5YFR032C YML122CQ03207 126 aa8.34□□□□□ -1.07
RRT5YFR032C TSA2Q04120 196 aa8.34□□□□□ -1.07
RRT5YFR032C HYM1P32464 399 aa8.33□□□□□ -1.08
RRT5YFR032C VMA8P32610 256 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
RRT5YFR032C SDH4P37298 181 aa8.33□□□□□ -1.08
RRT5YFR032C MED8P38304 223 aa8.33□□□□□ -1.08
RRT5YFR032C GIM3P53900 129 aa8.33□□□□□ -1.08
RRT5YFR032C INP53Q12271 1107 aa8.33□□□□□ -1.08
RRT5YFR032C UBA3Q99344 299 aa8.33□□□□□ -1.08
RRT5YFR032C SEN2P16658 377 aa8.32□□□□□ -1.08
RRT5YFR032C STF2P16965 84 aa8.32□□□□□ -1.08
RRT5YFR032C HTD2P38790 280 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
RRT5YFR032C YHR138CP38841 114 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
RRT5YFR032C RPA34P47006 233 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
RRT5YFR032C YML018CQ03730 393 aa8.32□□□□□ -1.08
RRT5YFR032C CAB5Q03941 241 aa8.32□□□□□ -1.08
RRT5YFR032C KEI1Q06346 221 aa8.32□□□□□ -1.08
RRT5YFR032C HRD1Q08109 551 aa8.32□□□□□ -1.08
RRT5YFR032C BOL1Q3E793 110 aa8.32□□□□□ -1.08
RRT5YFR032C HBN1Q96VH4 193 aa8.32□□□□□ -1.08
RRT5YFR032C TY1A-DR4O74302 440 aa8.31□□□□□ -1.08
RRT5YFR032C HTB1P02293 131 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 25.6 ms