RNA–Protein interactions for RNA: YER127W

LCP5, Essential protein involved in maturation of 18S rRNA, yeast

Gene LCP5, Length 1,074 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LCP5	YER127W	YBL081W	P38180	368 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LCP5	YER127W	SOK1	P40317	901 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LCP5	YER127W	RPS12	P48589	143 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LCP5	YER127W	AIF1	P52923	378 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LCP5	YER127W	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LCP5	YER127W	CTR3	Q06686	241 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LCP5	YER127W	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
LCP5	YER127W	POP8	P38208	133 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LCP5	YER127W	FMP32	P43557	207 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LCP5	YER127W	ECO1	P43605	281 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LCP5	YER127W	MNN5	P46982	586 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LCP5	YER127W	COX20	Q04935	205 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LCP5	YER127W	BTS1	Q12051	335 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LCP5	YER127W	YFR010W-A	P0C5N0	62 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LCP5	YER127W	YAK1	P14680	807 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LCP5	YER127W	PBN1	P25580	416 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LCP5	YER127W	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
LCP5	YER127W	AGA2	P32781	87 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LCP5	YER127W	YFR045W	P43617	309 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LCP5	YER127W	TIM21	P53220	239 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LCP5	YER127W	OST6	Q03723	332 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LCP5	YER127W	DCR2	Q05924	578 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LCP5	YER127W	RRT8	Q08219	342 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LCP5	YER127W	YAL064W-B	O13512	126 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LCP5	YER127W	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LCP5	YER127W	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LCP5	YER127W	GRE3	P38715	327 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.57	□□□□□ -1.68	not detected
LCP5	YER127W	RPE1	P46969	238 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LCP5	YER127W	APJ1	P53940	528 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LCP5	YER127W	GTO3	Q04806	366 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LCP5	YER127W	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LCP5	YER127W	DXO1	Q06349	442 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LCP5	YER127W	YPR063C	Q12160	140 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LCP5	YER127W	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LCP5	YER127W	COX2	P00410	251 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LCP5	YER127W	RPS23A	P0CX29	145 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LCP5	YER127W	RPS23B	P0CX30	145 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LCP5	YER127W	CAF4	P36130	643 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LCP5	YER127W	FES1	P38260	290 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LCP5	YER127W	YHL044W	P38727	235 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LCP5	YER127W	MNT4	P53745	580 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LCP5	YER127W	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LCP5	YER127W	YDR124W	Q04608	324 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LCP5	YER127W	SSQ1	Q05931	657 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LCP5	YER127W	LOA1	Q06508	300 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LCP5	YER127W	PSF1	Q12488	208 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LCP5	YER127W	YPR096C	O13587	100 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LCP5	YER127W	MET2	P08465	486 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LCP5	YER127W	YHR214C-D	P0CX93	97 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LCP5	YER127W	STP22	P25604	385 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LCP5	YER127W	PEX3	P28795	441 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LCP5	YER127W	YNL010W	P53981	241 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LCP5	YER127W	YDR249C	Q03787	373 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LCP5	YER127W	TVP15	Q03860	143 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LCP5	YER127W	ATG5	Q12380	294 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LCP5	YER127W	SAS5	Q99314	248 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LCP5	YER127W	RAS2	P01120	322 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LCP5	YER127W	YOR062C	P36025	268 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LCP5	YER127W	MAL32	P38158	584 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LCP5	YER127W	ECM14	P38836	430 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LCP5	YER127W	DDI1	P40087	428 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LCP5	YER127W	AYR1	P40471	297 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LCP5	YER127W	YDR476C	Q03362	224 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LCP5	YER127W	FAR8	Q05040	523 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LCP5	YER127W	Q0144	Q9ZZW2	109 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LCP5	YER127W	ERG2	P32352	222 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LCP5	YER127W	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
LCP5	YER127W	MED8	P38304	223 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LCP5	YER127W	PAC10	P48363	199 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LCP5	YER127W	RSM27	P53305	110 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LCP5	YER127W	CUS2	P53830	285 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
LCP5	YER127W	SDC1	Q03323	175 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LCP5	YER127W	MIX14	Q04341	121 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LCP5	YER127W	YOL163W	P0CF20	169 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LCP5	YER127W	AIM2	P39721	246 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LCP5	YER127W	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
LCP5	YER127W	YJR012C	P47087	207 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LCP5	YER127W	CTS2	Q06350	511 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LCP5	YER127W	YOR214C	Q12282	236 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LCP5	YER127W	RPC19	P28000	142 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
LCP5	YER127W	YAR1	P46683	200 aa		4.51	□□□□□ -1.69
LCP5	YER127W	SWP1	Q02795	286 aa		4.51	□□□□□ -1.69
LCP5	YER127W	NCE101	Q02820	53 aa		4.51	□□□□□ -1.69
LCP5	YER127W	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
LCP5	YER127W	YLR036C	Q07986	203 aa		4.51	□□□□□ -1.69
LCP5	YER127W	PRR2	Q12310	699 aa		4.51	□□□□□ -1.69
LCP5	YER127W	FLO9	P39712	1322 aa		4.5	□□□□□ -1.69
LCP5	YER127W	KSS1	P14681	368 aa		4.5	□□□□□ -1.69
LCP5	YER127W	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
LCP5	YER127W	AST2	P39945	430 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
LCP5	YER127W	MIG2	P53035	382 aa		4.5	□□□□□ -1.69
LCP5	YER127W	MAL12	P53341	584 aa		4.5	□□□□□ -1.69
LCP5	YER127W	YNL095C	P53932	642 aa		4.5	□□□□□ -1.69
LCP5	YER127W	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
LCP5	YER127W	MRX4	Q12467	430 aa		4.5	□□□□□ -1.69
LCP5	YER127W	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
LCP5	YER127W	RAD51	P25454	400 aa		4.49	□□□□□ -1.69
LCP5	YER127W	SEC17	P32602	292 aa		4.49	□□□□□ -1.69
LCP5	YER127W	PRS3	P38689	320 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
LCP5	YER127W	NSG1	P38837	291 aa		4.49	□□□□□ -1.69

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