RNA–Protein interactions for RNA: YBL078C

ATG8, Transcript of Component of autophagosomes and Cvt vesicles, yeastyeast

Gene ATG8, Length 354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Peroxisome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG8YBL078C SOL2P37262 315 aa3.44□□□□□ -1.86
ATG8YBL078C POP8P38208 133 aa3.44□□□□□ -1.86
ATG8YBL078C TMA22P47089 198 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
ATG8YBL078C BXI1P48558 297 aa3.44□□□□□ -1.86
ATG8YBL078C YGL034CP53186 121 aa3.44□□□□□ -1.86
ATG8YBL078C YNL046WP53956 172 aa3.44□□□□□ -1.86
ATG8YBL078C MRX11Q03079 207 aa3.44□□□□□ -1.86
ATG8YBL078C DXO1Q06349 442 aa3.44□□□□□ -1.86
ATG8YBL078C NOC4Q06512 552 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
ATG8YBL078C LDB18Q07887 179 aa3.44□□□□□ -1.86
ATG8YBL078C BRX1Q08235 291 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
ATG8YBL078C YLR046CQ12253 270 aa3.44□□□□□ -1.86
ATG8YBL078C CMD1P06787 147 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
ATG8YBL078C MET2P08465 486 aa3.43□□□□□ -1.86
ATG8YBL078C CAT2P32796 670 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
ATG8YBL078C MRPL28P36527 147 aa3.43□□□□□ -1.86
ATG8YBL078C FIG1P38224 298 aa3.43□□□□□ -1.86
ATG8YBL078C SEO1P39709 593 aa3.43□□□□□ -1.86
ATG8YBL078C MRPL49P40858 161 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
ATG8YBL078C MEP2P41948 499 aa3.43□□□□□ -1.86
ATG8YBL078C YJR056CP47115 236 aa3.43□□□□□ -1.86
ATG8YBL078C NRK1P53915 240 aa3.43□□□□□ -1.86
ATG8YBL078C IMP4P53941 290 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
ATG8YBL078C RMI1Q02685 241 aa3.43□□□□□ -1.86
ATG8YBL078C RPL21AQ02753 160 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
ATG8YBL078C YMR244WQ04018 355 aa3.43□□□□□ -1.86
ATG8YBL078C IRC25Q07951 179 aa3.43□□□□□ -1.86
ATG8YBL078C SLD7Q08457 257 aa3.43□□□□□ -1.86
ATG8YBL078C MSA1Q08471 629 aa3.43□□□□□ -1.86
ATG8YBL078C FDH1Q08911 376 aa3.43□□□□□ -1.86
ATG8YBL078C PEX11Q12462 236 aa3.43□□□□□ -1.86
ATG8YBL078C YAL063C-AQ3E791 96 aa3.43□□□□□ -1.86
ATG8YBL078C FAB1P34756 2278 aa3.42□□□□□ -1.86
ATG8YBL078C GCN3P14741 305 aa3.42□□□□□ -1.86
ATG8YBL078C YBL059WP34224 193 aa3.42□□□□□ -1.86
ATG8YBL078C MRH4P53166 561 aa3.42□□□□□ -1.86
ATG8YBL078C PIR1Q03178 341 aa3.42□□□□□ -1.86
ATG8YBL078C YMR279CQ03263 540 aa3.42□□□□□ -1.86
ATG8YBL078C INP1Q03694 420 aa3.42□□□□□ -1.86
ATG8YBL078C YOR186WQ08560 144 aa3.42□□□□□ -1.86
ATG8YBL078C AGC1Q12482 902 aa3.42□□□□□ -1.86
ATG8YBL078C TOR2P32600 2474 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
ATG8YBL078C ERD2P18414 219 aa3.41□□□□□ -1.86
ATG8YBL078C YOX1P34161 385 aa3.41□□□□□ -1.86
ATG8YBL078C ETR1P38071 380 aa3.41□□□□□ -1.86
ATG8YBL078C ECM33P38248 429 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
ATG8YBL078C MIG3P39943 394 aa3.41□□□□□ -1.86
ATG8YBL078C YFL012WP43580 148 aa3.41□□□□□ -1.86
ATG8YBL078C YGL235WP53071 178 aa3.41□□□□□ -1.86
ATG8YBL078C RCF2P53721 224 aa3.41□□□□□ -1.86
ATG8YBL078C AAH1P53909 347 aa3.41□□□□□ -1.86
ATG8YBL078C YPR114WQ06107 315 aa3.41□□□□□ -1.86
ATG8YBL078C PPT2Q12036 173 aa3.41□□□□□ -1.86
ATG8YBL078C YHR139C-AO13536 103 aa3.4□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C YBR032WP38223 100 aa3.4□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C PHO89P38361 574 aa3.4□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C YHI9P38765 294 aa3.4□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C YER076CP40049 302 aa3.4□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C PEX17P40155 199 aa3.4□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C REE1P40893 198 aa3.4□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C PET191Q02772 108 aa3.4□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C GOT1Q03554 138 aa3.4□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C YDR248CQ03786 193 aa3.4□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C PEX12Q04370 399 aa3.4□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C PAL1Q05518 499 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C LIP2Q06005 328 aa3.4□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C SYC1Q08553 188 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C TIR4Q12218 487 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C COS2P0CX12 379 aa3.39□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C COS3P0CX13 379 aa3.39□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C CUP2P15315 225 aa3.39□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C HSP26P15992 214 aaKnown RBP RIP-Chip data3.39□□□□□ -1.87not detected
ATG8YBL078C TAH1P25638 111 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C YPT52P36018 234 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C ARN2P38724 620 aa3.39□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C EFM1P38732 585 aa3.39□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C GGC1P38988 300 aa3.39□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C COS4P43542 379 aa3.39□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C IGD1P43598 195 aa3.39□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C API2Q04413 109 aa3.39□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C YDR124WQ04608 324 aa3.39□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C YOL019WQ08157 551 aa3.39□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C GTT2Q12390 233 aa3.39□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C TRM10Q12400 293 aa3.39□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C NOT5Q12514 560 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C YBL008W-AQ3E821 79 aa3.39□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C IGO2Q9P305 131 aa3.39□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C CCH1P50077 2039 aa3.39□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C MRS1P07266 363 aa3.38□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C SPT15P13393 240 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C ZRT3P34240 503 aa3.38□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C PRY2P36110 329 aa3.38□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C YKR041WP36134 250 aa3.38□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C DER1P38307 211 aa3.38□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C OM14P38325 134 aa3.38□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C MED6P38782 295 aa3.38□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C ECM14P38836 430 aa3.38□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C KRE9P39005 276 aa3.38□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C RRG9P40156 214 aa3.38□□□□□ -1.87
ATG8YBL078C PEP8P40335 379 aa3.38□□□□□ -1.87
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