RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	SLMAP	Q14BN4	828 aa		13.94	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	CDC42EP4	Q9H3Q1	356 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		13.94	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	ATP2A1	O14983	1001 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	GBP1	P32455	592 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	ADCY8	P40145	1251 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	IFNAR2	P48551	515 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	NOMO3	P69849	1222 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	MAMLD1	Q13495	774 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	NCOA4	Q13772	614 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	CAPS	Q13938	189 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	ATP13A4	Q4VNC1	1196 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF677	Q86XU0	584 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	PGM2	Q96G03	612 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	CABS1	Q96KC9	395 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	MYH9	P35579	1960 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152		A0A0B4J269	797 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	FOXO6	A8MYZ6	492 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	PI4K2B	G5E9Z4	385 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	ATP2C2	O75185	946 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	STAM2	O75886	525 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	PROSC	O94903	275 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	CLTA	P09496	248 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	ARL2	P36404	184 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	CDR1	P51861	262 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	RPL7A	P62424	266 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	LIN9	Q5TKA1	542 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	KAZN	Q674X7	775 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	SLFN12L	Q6IEE8	588 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	FAM81B	Q96LP2	452 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	XPO6	Q96QU8	1125 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	PCYT2	Q99447	389 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	AAAS	Q9NRG9	546 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	STYXL1	Q9Y6J8	313 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	WDR81	Q562E7	1941 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	MYBL1	P10243	752 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	TCF4	P15884	667 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	SLC1A1	P43005	524 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	ITGA8	P53708	1063 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	ADCY2	Q08462	1091 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	LY6K	Q17RY6	165 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	C6orf118	Q5T5N4	469 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	TRIM50	Q86XT4	487 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	PRPF31	Q8WWY3	499 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	SEC16B	Q96JE7	1060 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	RUNDC3B	Q96NL0	473 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	DCLK3	Q9C098	648 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	ADAM7	Q9H2U9	754 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	CNOT10	Q9H9A5	744 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	BTBD7	Q9P203	1132 aa		13.93	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		13.92	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	STAT5B	P51692	787 aa		13.92	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	OSTN	P61366	133 aa		13.92	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	KYNU	Q16719	465 aa		13.92	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		13.92	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	TRIM11	Q96F44	468 aa		13.92	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	SCLT1	Q96NL6	688 aa		13.92	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	MTMR12	Q9C0I1	747 aa		13.92	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		13.92	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	RLF	Q13129	1914 aa		13.92	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	FARP2	O94887	1054 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	ATG7	O95352	703 aa		13.92	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	GAS8	O95995	478 aa		13.92	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	POTEJ	P0CG39	1038 aa		13.92	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	ERMARD	Q5T6L9	678 aa		13.92	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	MGARP	Q8TDB4	240 aa		13.92	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF606	Q8WXB4	792 aa		13.92	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	ACSF2	Q96CM8	615 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	CGRRF1	Q99675	332 aa		13.92	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	PRMT1	Q99873	361 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		13.92	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	CTNNAL1	Q9UBT7	734 aa		13.92	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		13.92	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	PAEP	P09466	180 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	CHRM1	P11229	460 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	KRT10	P13645	584 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	ATF2	P15336	505 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	MMP13	P45452	471 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	SCARA5	Q6ZMJ2	495 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BRF1-222	ENST00000635152	RHOT1	Q8IXI2	618 aa		13.91	□□□□□ -0.18

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