RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF174Q15697 407 aa29.98■■■□□ 2.39
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CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF280DQ6N043 979 aa29.98■■■□□ 2.39
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF687Q8N1G0 1237 aa29.98■■■□□ 2.39
CAPNS1-217ENST00000629983 ZSWIM3Q96MP5 696 aa29.98■■■□□ 2.39
CAPNS1-217ENST00000629983 ASAH2Q9NR71 780 aa29.98■■■□□ 2.39
CAPNS1-217ENST00000629983 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa29.97■■■□□ 2.39
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CAPNS1-217ENST00000629983 GUCY1B3Q02153 619 aa29.97■■■□□ 2.39
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CAPNS1-217ENST00000629983 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP29.97■■■□□ 2.39
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CAPNS1-217ENST00000629983 TCHPQ9BT92 498 aa29.97■■■□□ 2.39
CAPNS1-217ENST00000629983 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
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CAPNS1-217ENST00000629983 KCNA4P22459 653 aa29.96■■■□□ 2.39
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CAPNS1-217ENST00000629983 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP29.95■■■□□ 2.39
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CAPNS1-217ENST00000629983 XKR4Q5GH76 650 aa29.94■■■□□ 2.38
CAPNS1-217ENST00000629983 PPM1JQ5JR12 505 aa29.94■■■□□ 2.38
CAPNS1-217ENST00000629983 ALKAL1Q6UXT8 129 aa29.94■■■□□ 2.38
CAPNS1-217ENST00000629983 MAMSTRQ6ZN01 415 aa29.94■■■□□ 2.38
CAPNS1-217ENST00000629983 APPL2Q8NEU8 664 aa29.94■■■□□ 2.38
CAPNS1-217ENST00000629983 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
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CAPNS1-217ENST00000629983 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa29.93■■■□□ 2.38
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CAPNS1-217ENST00000629983 FNTBP49356 437 aa29.93■■■□□ 2.38
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CAPNS1-217ENST00000629983 KIAA1024Q9UPX6 916 aa29.93■■■□□ 2.38
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CAPNS1-217ENST00000629983 MOSPD3O75425 235 aa29.92■■■□□ 2.38
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CAPNS1-217ENST00000629983 ST3GAL2Q16842 350 aa29.92■■■□□ 2.38
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CAPNS1-217ENST00000629983 DDX12PQ92771 950 aa29.92■■■□□ 2.38
CAPNS1-217ENST00000629983 CHAMP1Q96JM3 812 aa29.92■■■□□ 2.38
CAPNS1-217ENST00000629983 SUSD3Q96L08 255 aa29.92■■■□□ 2.38
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CAPNS1-217ENST00000629983 FAM200AQ8TCP9 573 aa29.91■■■□□ 2.38
CAPNS1-217ENST00000629983 TBC1D32Q96NH3 1257 aa29.91■■■□□ 2.38
CAPNS1-217ENST00000629983 PTPRHQ9HD43 1115 aa29.91■■■□□ 2.38
CAPNS1-217ENST00000629983 KMT5AQ9NQR1 393 aa29.91■■■□□ 2.38
CAPNS1-217ENST00000629983 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
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CAPNS1-217ENST00000629983 SLC38A8A6NNN8 435 aa29.9■■■□□ 2.38
CAPNS1-217ENST00000629983 DMWDQ09019 674 aa29.9■■■□□ 2.38
CAPNS1-217ENST00000629983 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP29.9■■■□□ 2.38
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CAPNS1-217ENST00000629983 MPZL3Q6UWV2 235 aa29.9■■■□□ 2.38
CAPNS1-217ENST00000629983 PRR23CQ6ZRP0 262 aa29.9■■■□□ 2.38
CAPNS1-217ENST00000629983 SHKBP1Q8TBC3 707 aa29.9■■■□□ 2.38
CAPNS1-217ENST00000629983 E2F7Q96AV8 911 aa29.9■■■□□ 2.38
CAPNS1-217ENST00000629983 GPR88Q9GZN0 384 aa29.9■■■□□ 2.38
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM134Q9H6X4 195 aa29.9■■■□□ 2.38
CAPNS1-217ENST00000629983 TRPV4Q9HBA0 871 aa29.9■■■□□ 2.38
CAPNS1-217ENST00000629983 MAFFQ9ULX9 164 aa29.9■■■□□ 2.38
CAPNS1-217ENST00000629983 NCANO14594 1321 aa29.9■■■□□ 2.38
CAPNS1-217ENST00000629983 HIP1RO75146 1068 aa29.89■■■□□ 2.38
CAPNS1-217ENST00000629983 SOX9P48436 509 aa29.89■■■□□ 2.38
CAPNS1-217ENST00000629983 PTGDRQ13258 359 aa29.89■■■□□ 2.38
CAPNS1-217ENST00000629983 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP29.89■■■□□ 2.38
CAPNS1-217ENST00000629983 GAS6Q14393 721 aa29.89■■■□□ 2.38
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