RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 ATICP31939 592 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-215ENST00000628018 GJA8P48165 433 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-215ENST00000628018 GUCY2FP51841 1108 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-215ENST00000628018 CYP27A1Q02318 531 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-215ENST00000628018 HACE1Q8IYU2 909 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-215ENST00000628018 OLIG1Q8TAK6 271 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-215ENST00000628018 FAXDC2Q96IV6 333 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-215ENST00000628018 NIF3L1Q9GZT8 377 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-215ENST00000628018 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A087X0T9 212 aa26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A0U1RQJ8 604 aa26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-215ENST00000628018 TLR3O15455 904 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-215ENST00000628018 OFD1O75665 1012 aa26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM228BP0C875 321 aa26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-215ENST00000628018 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-215ENST00000628018 USP8P40818 1118 aa26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-215ENST00000628018 RAB27AP51159 221 aa26.72■■□□□ 1.87
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CAPNS1-215ENST00000628018 GLRA4Q5JXX5 417 aa26.72■■□□□ 1.87
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CAPNS1-215ENST00000628018 CYP26A1O43174 497 aa26.71■■□□□ 1.87
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CAPNS1-215ENST00000628018 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
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CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF662Q6ZS27 426 aa26.71■■□□□ 1.87
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CAPNS1-215ENST00000628018 ANKLE1Q8NAG6 615 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-215ENST00000628018 BEST2Q8NFU1 509 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-215ENST00000628018 ADAM2Q99965 735 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-215ENST00000628018 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP26.71■■□□□ 1.87
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CAPNS1-215ENST00000628018 AGAP1Q9UPQ3 857 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-215ENST00000628018 CNTN6Q9UQ52 1028 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A0U1RQF3 1178 aa26.7■■□□□ 1.87
CAPNS1-215ENST00000628018 CLSTN1O94985 981 aa26.7■■□□□ 1.87
CAPNS1-215ENST00000628018 VPS36Q86VN1 386 aa26.7■■□□□ 1.87
CAPNS1-215ENST00000628018 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.87
CAPNS1-215ENST00000628018 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.87
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CAPNS1-215ENST00000628018 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa26.7■■□□□ 1.87
CAPNS1-215ENST00000628018 MEIS3P2A8K0S8 358 aa26.7■■□□□ 1.86
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CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF667Q5HYK9 610 aa26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC30A5Q8TAD4 765 aa26.7■■□□□ 1.86
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CAPNS1-215ENST00000628018 SLC47A2Q86VL8 602 aa26.69■■□□□ 1.86
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CAPNS1-215ENST00000628018 HPDLQ96IR7 371 aa26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-215ENST00000628018 AGPAT1Q99943 283 aa26.69■■□□□ 1.86
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CAPNS1-215ENST00000628018 RNF19AQ9NV58 838 aa26.69■■□□□ 1.86
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CAPNS1-215ENST00000628018 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
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CAPNS1-215ENST00000628018 BCO2Q9BYV7 579 aa26.68■■□□□ 1.86
CAPNS1-215ENST00000628018 RGS18Q9NS28 235 aa26.68■■□□□ 1.86
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CAPNS1-215ENST00000628018 DCDC2CA8MYV0 355 aa26.67■■□□□ 1.86
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CAPNS1-215ENST00000628018 SLC20A1Q8WUM9 679 aa26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-215ENST00000628018 ZFP42Q96MM3 310 aa26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-215ENST00000628018 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-215ENST00000628018 ACP6Q9NPH0 428 aa26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-215ENST00000628018 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-215ENST00000628018 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa26.67■■□□□ 1.86
CAPNS1-215ENST00000628018 NBNO60934 754 aa26.66■■□□□ 1.86
CAPNS1-215ENST00000628018 ABL1P00519 1130 aa26.66■■□□□ 1.86
CAPNS1-215ENST00000628018 TNFAIP3P21580 790 aa26.66■■□□□ 1.86
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