RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 SNX27Q96L92 541 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 VRTNQ9H8Y1 702 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 DPP3Q9NY33 737 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 A0A1W2PQY0 241 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 CYP26A1O43174 497 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 GZMAP12544 262 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 PNPLA4P41247 253 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 WNT7BP56706 349 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 MYL6P60660 151 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 TNNC1P63316 161 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM228AQ86W67 206 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 EFCAB13Q8IY85 973 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 CAGE1Q8TC20 777 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 PGBD4Q96DM1 585 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 UBN1Q9NPG3 1134 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC38A7Q9NVC3 462 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 SNTG2Q9NY99 539 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 CNTN3Q9P232 1028 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 PARP2Q9UGN5 583 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 HTTP42858 3142 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 ANO9A1A5B4 782 aa24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 ARVCFO00192 962 aa24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 NFICP08651 508 aa24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 CYP11B1P15538 503 aa24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 CAPN2P17655 700 aa24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 CYP3A5P20815 502 aa24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 BFSP2Q13515 415 aa24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 GLYCTKQ8IVS8 523 aa24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 LRRC52Q8N7C0 313 aa24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF560Q96MR9 790 aa24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF263O14978 683 aa24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 MED7O43513 233 aa24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 RTN2O75298 545 aa24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 ITGB3P05106 788 aa24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 CTSHP09668 335 aa24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM253P0C7T8 217 aa24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 MGAT3Q09327 533 aa24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC43A3Q8NBI5 491 aa24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC30A5Q8TAD4 765 aa24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 EPS8L1Q8TE68 723 aa24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM40Q8WWA1 233 aa24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 CNTN6Q9UQ52 1028 aa24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 CEP83Q9Y592 693 aa24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 MACROD2A1Z1Q3 448 aa24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 ANKRD62A6NC57 917 aa24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP24.22■■□□□ 1.471e-10■■■■■ 31
CAPNS1-212ENST00000591041 RECQL4O94761 1208 aa24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 URI1O94763 535 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 ITGA4P13612 1032 aa24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 KCNE1P15382 129 aa24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 RHOT2Q8IXI1 618 aa24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM192Q8IY95 271 aa24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 SYCE1Q8N0S2 351 aa24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 C1orf127Q8N9H9 656 aa24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 HPDLQ96IR7 371 aa24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 RPS6KC1Q96S38 1066 aa24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 AGAP1Q9UPQ3 857 aa24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 JRKLQ9Y4A0 524 aa24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 NUB1Q9Y5A7 615 aa24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 GRIN2DO15399 1336 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 SGPL1O95470 568 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 CST3P01034 146 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 CHRNA1P02708 482 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 PAX3P23760 479 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 TUBB4BP68371 445 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 FBXO47Q5MNV8 452 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM270Q6UE05 265 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 GPIHBP1Q8IV16 184 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC35F6Q8N357 371 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 SH3TC2Q8TF17 1288 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 KAT5Q92993 513 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 TRAIPQ9BWF2 469 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 IPPQ9Y573 584 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-212ENST00000591041 MYBL1P10243 752 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 GNA15P30679 374 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 WDR72Q3MJ13 1102 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 SPOPLQ6IQ16 392 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 SYT11Q9BT88 431 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 APOL6Q9BWW8 343 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 LACRTQ9GZZ8 138 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 ERVK-5Q9HDB9 667 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-212ENST00000591041 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
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