RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588555.1

SCAMP4-210, Transcript of secretory carrier membrane protein 4, humanhuman

Gene SCAMP4, Length 1,785 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4-210ENST00000588555 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa27.95■■■□□ 2.06
SCAMP4-210ENST00000588555 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa27.95■■■□□ 2.06
SCAMP4-210ENST00000588555 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.06
SCAMP4-210ENST00000588555 SELPP16109 830 aa27.95■■■□□ 2.06
SCAMP4-210ENST00000588555 GLRA4Q5JXX5 417 aa27.95■■■□□ 2.06
SCAMP4-210ENST00000588555 LRRC8DQ7L1W4 858 aa27.95■■■□□ 2.06
SCAMP4-210ENST00000588555 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa27.95■■■□□ 2.06
SCAMP4-210ENST00000588555 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.06
SCAMP4-210ENST00000588555 UBR7Q8N806 425 aa27.95■■■□□ 2.06
SCAMP4-210ENST00000588555 MEIS3P2A8K0S8 358 aa27.94■■■□□ 2.06
SCAMP4-210ENST00000588555 CYP26A1O43174 497 aa27.94■■■□□ 2.06
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF623O75123 536 aa27.94■■■□□ 2.06
SCAMP4-210ENST00000588555 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
SCAMP4-210ENST00000588555 USP8P40818 1118 aa27.94■■■□□ 2.06
SCAMP4-210ENST00000588555 GJA8P48165 433 aa27.94■■■□□ 2.06
SCAMP4-210ENST00000588555 BFSP2Q13515 415 aa27.94■■■□□ 2.06
SCAMP4-210ENST00000588555 SPA17Q15506 151 aa27.94■■■□□ 2.06
SCAMP4-210ENST00000588555 RNF19AQ9NV58 838 aa27.94■■■□□ 2.06
SCAMP4-210ENST00000588555 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa27.94■■■□□ 2.06
SCAMP4-210ENST00000588555 NENFQ9UMX5 172 aa27.94■■■□□ 2.06
SCAMP4-210ENST00000588555 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
SCAMP4-210ENST00000588555 ATICP31939 592 aa27.94■■■□□ 2.06
SCAMP4-210ENST00000588555 ARHGAP25P42331 645 aa27.94■■■□□ 2.06
SCAMP4-210ENST00000588555 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
SCAMP4-210ENST00000588555 EPS8L1Q8TE68 723 aa27.94■■■□□ 2.06
SCAMP4-210ENST00000588555 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
SCAMP4-210ENST00000588555 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
SCAMP4-210ENST00000588555 CNTN6Q9UQ52 1028 aa27.94■■■□□ 2.06
SCAMP4-210ENST00000588555 PITPNM1O00562 1244 aa27.93■■■□□ 2.06
SCAMP4-210ENST00000588555 STAU1O95793 577 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
SCAMP4-210ENST00000588555 ASPAP45381 313 aa27.93■■■□□ 2.06
SCAMP4-210ENST00000588555 RAB27AP51159 221 aa27.93■■■□□ 2.06
SCAMP4-210ENST00000588555 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
SCAMP4-210ENST00000588555 C1orf53Q5VUE5 145 aa27.93■■■□□ 2.06
SCAMP4-210ENST00000588555 SLC30A5Q8TAD4 765 aa27.93■■■□□ 2.06
SCAMP4-210ENST00000588555 ADAM2Q99965 735 aa27.93■■■□□ 2.06
SCAMP4-210ENST00000588555 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP27.93■■■□□ 2.06
SCAMP4-210ENST00000588555 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
SCAMP4-210ENST00000588555 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
SCAMP4-210ENST00000588555 AGAP1Q9UPQ3 857 aa27.93■■■□□ 2.06
SCAMP4-210ENST00000588555 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa27.93■■■□□ 2.06
SCAMP4-210ENST00000588555 A0A0U1RQF3 1178 aa27.92■■■□□ 2.06
SCAMP4-210ENST00000588555 RCCD1A6NED2 376 aa27.92■■■□□ 2.06
SCAMP4-210ENST00000588555 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP27.92■■■□□ 2.069e-15■■■■■ 28.6
SCAMP4-210ENST00000588555 PTGESO14684 152 aa27.92■■■□□ 2.06
SCAMP4-210ENST00000588555 ABL1P00519 1130 aa27.92■■■□□ 2.06
SCAMP4-210ENST00000588555 ITGA4P13612 1032 aa27.92■■■□□ 2.06
SCAMP4-210ENST00000588555 RBP5P82980 135 aa27.92■■■□□ 2.06
SCAMP4-210ENST00000588555 GPNMBQ14956 572 aa27.92■■■□□ 2.06
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF662Q6ZS27 426 aa27.92■■■□□ 2.06
SCAMP4-210ENST00000588555 SLC47A2Q86VL8 602 aa27.92■■■□□ 2.06
SCAMP4-210ENST00000588555 BEST2Q8NFU1 509 aa27.92■■■□□ 2.06
SCAMP4-210ENST00000588555 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
SCAMP4-210ENST00000588555 FAXDC2Q96IV6 333 aa27.92■■■□□ 2.06
SCAMP4-210ENST00000588555 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
SCAMP4-210ENST00000588555 ACP6Q9NPH0 428 aa27.92■■■□□ 2.06
SCAMP4-210ENST00000588555 LZTFL1Q9NQ48 299 aa27.92■■■□□ 2.06
SCAMP4-210ENST00000588555 OFD1O75665 1012 aa27.91■■■□□ 2.06
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SCAMP4-210ENST00000588555 PTPN14Q15678 1187 aa27.91■■■□□ 2.06
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SCAMP4-210ENST00000588555 HACE1Q8IYU2 909 aa27.91■■■□□ 2.06
SCAMP4-210ENST00000588555 SLC20A1Q8WUM9 679 aa27.91■■■□□ 2.06
SCAMP4-210ENST00000588555 ZFP42Q96MM3 310 aa27.91■■■□□ 2.06
SCAMP4-210ENST00000588555 TFR2Q9UP52 801 aa27.91■■■□□ 2.06
SCAMP4-210ENST00000588555 TLR3O15455 904 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
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SCAMP4-210ENST00000588555 CYP11B1P15538 503 aa27.9■■■□□ 2.06
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SCAMP4-210ENST00000588555 NBNO60934 754 aa27.89■■■□□ 2.06
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SCAMP4-210ENST00000588555 KIAA1328Q86T90 577 aa27.89■■■□□ 2.06
SCAMP4-210ENST00000588555 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.06
SCAMP4-210ENST00000588555 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
SCAMP4-210ENST00000588555 SCN1AP35498 2009 aa27.89■■■□□ 2.05
SCAMP4-210ENST00000588555 TANC1Q9C0D5 1861 aa27.89■■■□□ 2.05
SCAMP4-210ENST00000588555 PPEF2O14830 753 aa27.88■■■□□ 2.05
SCAMP4-210ENST00000588555 CHRNB2P17787 502 aa27.88■■■□□ 2.05
SCAMP4-210ENST00000588555 CYP3A5P20815 502 aa27.88■■■□□ 2.05
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