RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 USP49Q70CQ1 688 aa22.41■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 PDGFRAP16234 1089 aa22.41■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 ADRA2BP18089 450 aa22.41■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 HLA-DPA1P20036 260 aa22.41■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 SBK1Q52WX2 424 aa22.41■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 SGSM3Q96HU1 749 aa22.41■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 SLC26A4O43511 780 aa22.4■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 PYGLP06737 847 aa22.4■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 LRRC36Q1X8D7 754 aa22.4■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 SLC44A4Q53GD3 710 aa22.4■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 ASAP3Q8TDY4 903 aa22.4■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 DNAJC9Q8WXX5 260 aa22.4■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 COMTP21964 271 aa22.4■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 PTK7Q13308 1070 aa22.4■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 NCOA4Q13772 614 aa22.4■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 WDR35Q9P2L0 1181 aa22.4■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 USP38Q8NB14 1042 aa22.4■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 ZBED2Q9BTP6 218 aa22.4■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 TRADDQ15628 312 aa22.4■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa22.4■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 PNPLA6Q8IY17 1366 aa22.4■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 DGAT1O75907 488 aa22.39■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 PTK2BQ14289 1009 aa22.39■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 C2orf69Q8N8R5 385 aa22.39■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 ERP27Q96DN0 273 aa22.39■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 OTUD5Q96G74 571 aa22.39■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 ELMO2Q96JJ3 720 aa22.39■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 RUBCNLQ9H714 662 aa22.39■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 PSD3Q9NYI0 1048 aa22.39■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa22.39■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 REREQ9P2R6 1566 aa22.39■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 TBX3O15119 743 aa22.39■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 RALAP11233 206 aa22.39■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 NNMTP40261 264 aa22.39■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 CORO7P57737 925 aa22.39■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 EDRF1Q3B7T1 1238 aa22.39■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 CYFIP2Q96F07 1278 aa22.39■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 NEUROG2Q9H2A3 272 aa22.39■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 ADNPQ9H2P0 1102 aa22.39■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 SENP2Q9HC62 589 aa22.39■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 RHBDL2Q9NX52 303 aa22.39■■□□□ 1.18
PTPRM-211ENST00000580170 SERPINB9P50453 376 aa22.39■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 TAGAPQ8N103 731 aa22.39■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 ISCUQ9H1K1 167 aa22.39■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 CHMP2BQ9UQN3 213 aa22.39■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa22.39■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa22.39■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa22.39■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 OVOS2Q6IE36 1432 aa22.39■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 FDPSP14324 419 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 CPB1P15086 417 aa22.39■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 KCND2Q9NZV8 630 aa22.39■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM120BA0PK00 339 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM253P0C7T8 217 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 TTC23LQ6PF05 361 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 RFWD2Q8NHY2 731 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 ITGA8P53708 1063 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 MTMR2Q13614 643 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP22.38■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 CRB1P82279 1406 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 H0Y626 953 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 AP3B1O00203 1094 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 WBP4O75554 376 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 TRIM16O95361 564 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 GRIK1P39086 918 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 MAGEA4P43358 317 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC15Q0P6D6 951 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 MMGT1Q8N4V1 131 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 SH3KBP1Q96B97 665 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 SLC40A1Q9NP59 571 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 COBLL1Q53SF7 1204 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 XKR3Q5GH77 459 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 APPL2Q8NEU8 664 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 USP33Q8TEY7 942 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 CTDNEP1O95476 244 aa22.38■■□□□ 1.17
PTPRM-211ENST00000580170 SH3TC2Q8TF17 1288 aa22.38■■□□□ 1.17
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