RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, human

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTDNEP1-208	ENST00000573600	TLR10	Q9BXR5	811 aa		31.19	■■■□□ 2.58
CTDNEP1-208	ENST00000573600	THAP2	Q9H0W7	228 aa		31.19	■■■□□ 2.58
CTDNEP1-208	ENST00000573600	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		31.19	■■■□□ 2.58
CTDNEP1-208	ENST00000573600	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	31.19	■■■□□ 2.58
CTDNEP1-208	ENST00000573600	HMGCR	P04035	888 aa		31.18	■■■□□ 2.58
CTDNEP1-208	ENST00000573600	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	31.18	■■■□□ 2.58
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ELN	P15502	786 aa		31.18	■■■□□ 2.58
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	31.18	■■■□□ 2.58
CTDNEP1-208	ENST00000573600	YWHAE	P62258	255 aa	Known RBP	31.18	■■■□□ 2.58
CTDNEP1-208	ENST00000573600	GPC5	P78333	572 aa		31.18	■■■□□ 2.58
CTDNEP1-208	ENST00000573600	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	31.18	■■■□□ 2.58
CTDNEP1-208	ENST00000573600	SLC35G2	Q8TBE7	412 aa		31.18	■■■□□ 2.58
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		31.18	■■■□□ 2.58
CTDNEP1-208	ENST00000573600	SRGAP2	O75044	1071 aa		31.18	■■■□□ 2.58
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ATIC	P31939	592 aa		31.18	■■■□□ 2.58
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ELF2	Q15723	593 aa		31.18	■■■□□ 2.58
CTDNEP1-208	ENST00000573600	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		31.18	■■■□□ 2.58
CTDNEP1-208	ENST00000573600	LRRC57	Q8N9N7	239 aa		31.18	■■■□□ 2.58
CTDNEP1-208	ENST00000573600	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		31.18	■■■□□ 2.58
CTDNEP1-208	ENST00000573600	RPGRIP1	Q96KN7	1286 aa		31.18	■■■□□ 2.58
CTDNEP1-208	ENST00000573600	OSBPL9	Q96SU4	736 aa		31.18	■■■□□ 2.58
CTDNEP1-208	ENST00000573600	DERA	Q9Y315	318 aa		31.18	■■■□□ 2.58
CTDNEP1-208	ENST00000573600	KRT19	P08727	400 aa		31.17	■■■□□ 2.58
CTDNEP1-208	ENST00000573600	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		31.17	■■■□□ 2.58
CTDNEP1-208	ENST00000573600	RSPH3	Q86UC2	560 aa		31.17	■■■□□ 2.58
CTDNEP1-208	ENST00000573600	SIX4	Q9UIU6	781 aa		31.17	■■■□□ 2.58
CTDNEP1-208	ENST00000573600		M0QZ92	97 aa		31.16	■■■□□ 2.58
CTDNEP1-208	ENST00000573600	HADHB	P55084	474 aa	Known RBP	31.16	■■■□□ 2.58
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		31.16	■■■□□ 2.58
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ACAD10	Q6JQN1	1059 aa		31.16	■■■□□ 2.58
CTDNEP1-208	ENST00000573600	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		31.16	■■■□□ 2.58
CTDNEP1-208	ENST00000573600	SLFN11	Q7Z7L1	901 aa		31.16	■■■□□ 2.58
CTDNEP1-208	ENST00000573600	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		31.16	■■■□□ 2.58
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	31.16	■■■□□ 2.58
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		31.16	■■■□□ 2.58
CTDNEP1-208	ENST00000573600	FTCD	O95954	541 aa		31.15	■■■□□ 2.58
CTDNEP1-208	ENST00000573600	GNA15	P30679	374 aa		31.15	■■■□□ 2.58
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ZNF132	P52740	706 aa		31.15	■■■□□ 2.58
CTDNEP1-208	ENST00000573600	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	31.15	■■■□□ 2.58
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ZNF667	Q5HYK9	610 aa		31.15	■■■□□ 2.58
CTDNEP1-208	ENST00000573600	SESTD1	Q86VW0	696 aa		31.15	■■■□□ 2.58
CTDNEP1-208	ENST00000573600	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	31.15	■■■□□ 2.58
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ARHGEF26	Q96DR7	871 aa		31.15	■■■□□ 2.58
CTDNEP1-208	ENST00000573600	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	31.15	■■■□□ 2.58
CTDNEP1-208	ENST00000573600	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		31.15	■■■□□ 2.58
CTDNEP1-208	ENST00000573600	NCK2	O43639	380 aa		31.15	■■■□□ 2.58
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ITGB3	P05106	788 aa		31.15	■■■□□ 2.58
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ASGR1	P07306	291 aa		31.15	■■■□□ 2.58
CTDNEP1-208	ENST00000573600	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		31.15	■■■□□ 2.58
CTDNEP1-208	ENST00000573600	PXYLP1	Q8TE99	480 aa		31.15	■■■□□ 2.58
CTDNEP1-208	ENST00000573600	RABGGTA	Q92696	567 aa		31.15	■■■□□ 2.58
CTDNEP1-208	ENST00000573600	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	31.15	■■■□□ 2.58
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ASPA	P45381	313 aa		31.14	■■■□□ 2.58
CTDNEP1-208	ENST00000573600	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	31.14	■■■□□ 2.58
CTDNEP1-208	ENST00000573600	TEX35	Q5T0J7	233 aa		31.14	■■■□□ 2.58
CTDNEP1-208	ENST00000573600	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		31.14	■■■□□ 2.58
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CAGE1	Q8TC20	777 aa		31.14	■■■□□ 2.58
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CAPZA3	Q96KX2	299 aa		31.14	■■■□□ 2.58
CTDNEP1-208	ENST00000573600	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	31.14	■■■□□ 2.58
CTDNEP1-208	ENST00000573600	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		31.14	■■■□□ 2.58
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CISH	Q9NSE2	258 aa		31.14	■■■□□ 2.58
CTDNEP1-208	ENST00000573600	SNTG2	Q9NY99	539 aa		31.14	■■■□□ 2.58
CTDNEP1-208	ENST00000573600	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	31.13	■■■□□ 2.57
CTDNEP1-208	ENST00000573600	KCNA10	Q16322	511 aa		31.13	■■■□□ 2.57
CTDNEP1-208	ENST00000573600	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	31.13	■■■□□ 2.57
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CXorf38	Q8TB03	319 aa		31.13	■■■□□ 2.57
CTDNEP1-208	ENST00000573600	RAET1E	Q8TD07	263 aa		31.13	■■■□□ 2.57
CTDNEP1-208	ENST00000573600	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		31.13	■■■□□ 2.57
CTDNEP1-208	ENST00000573600	RNF14	Q9UBS8	474 aa		31.13	■■■□□ 2.57
CTDNEP1-208	ENST00000573600	UNG	P13051	313 aa	Predicted RBP	31.12	■■■□□ 2.57
CTDNEP1-208	ENST00000573600	RPS6KA1	Q15418	735 aa		31.12	■■■□□ 2.57
CTDNEP1-208	ENST00000573600	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		31.12	■■■□□ 2.57
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	31.12	■■■□□ 2.57
CTDNEP1-208	ENST00000573600	DAAM2	Q86T65	1068 aa		31.12	■■■□□ 2.57
CTDNEP1-208	ENST00000573600	KIF12	Q96FN5	646 aa		31.12	■■■□□ 2.57
CTDNEP1-208	ENST00000573600	SNX27	Q96L92	541 aa		31.12	■■■□□ 2.57
CTDNEP1-208	ENST00000573600	DPP3	Q9NY33	737 aa		31.12	■■■□□ 2.57
CTDNEP1-208	ENST00000573600	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	31.12	■■■□□ 2.57
CTDNEP1-208	ENST00000573600	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		31.12	■■■□□ 2.57
CTDNEP1-208	ENST00000573600	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		31.12	■■■□□ 2.57
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ZNF185	O15231	689 aa		31.12	■■■□□ 2.57
CTDNEP1-208	ENST00000573600	STAU1	O95793	577 aa	Known RBP	31.12	■■■□□ 2.57
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CYP1A1	P04798	512 aa	Predicted RBP	31.12	■■■□□ 2.57
CTDNEP1-208	ENST00000573600	P4HA1	P13674	534 aa		31.12	■■■□□ 2.57
CTDNEP1-208	ENST00000573600	RBP5	P82980	135 aa		31.12	■■■□□ 2.57
CTDNEP1-208	ENST00000573600	ARHGEF6	Q15052	776 aa		31.12	■■■□□ 2.57
CTDNEP1-208	ENST00000573600	RPAIN	Q86UA6	219 aa		31.12	■■■□□ 2.57
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CREG2	Q8IUH2	290 aa		31.12	■■■□□ 2.57
CTDNEP1-208	ENST00000573600	GPR161	Q8N6U8	529 aa	Known RBP	31.12	■■■□□ 2.57
CTDNEP1-208	ENST00000573600	BCO2	Q9BYV7	579 aa		31.12	■■■□□ 2.57
CTDNEP1-208	ENST00000573600	CTTNBP2NL	Q9P2B4	639 aa		31.12	■■■□□ 2.57
CTDNEP1-208	ENST00000573600	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		31.11	■■■□□ 2.57
CTDNEP1-208	ENST00000573600	MTA2	O94776	668 aa		31.11	■■■□□ 2.57
CTDNEP1-208	ENST00000573600	VEGFB	P49765	207 aa		31.11	■■■□□ 2.57
CTDNEP1-208	ENST00000573600	PEX26	Q7Z412	305 aa		31.11	■■■□□ 2.57
CTDNEP1-208	ENST00000573600	SERINC5	Q86VE9	423 aa		31.11	■■■□□ 2.57
CTDNEP1-208	ENST00000573600	TRIM11	Q96F44	468 aa		31.11	■■■□□ 2.57
CTDNEP1-208	ENST00000573600	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		31.11	■■■□□ 2.57
CTDNEP1-208	ENST00000573600	MMS19	Q96T76	1030 aa		31.11	■■■□□ 2.57
CTDNEP1-208	ENST00000573600	NXF1	Q9UBU9	619 aa	Known RBP	31.11	■■■□□ 2.57

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