RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548567.5

CS-212, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 3,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-212ENST00000548567 MTMR12Q9C0I1 747 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 PCDHA7Q9UN72 937 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 COG5Q9UP83 839 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 APC2O95996 2303 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 AGRPO00253 132 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 NT5C2P49902 561 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 SPOPLQ6IQ16 392 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 GPR153Q6NV75 609 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 ARMCX5Q6P1M9 558 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 FBXL18Q96ME1 805 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 CLSTN3Q9BQT9 956 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 ATXN3LQ9H3M9 355 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 GTSE1Q9NYZ3 720 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 ZFHX4Q86UP3 3567 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 ADH1AP07327 375 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 MAPK7Q13164 816 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 GIT2Q14161 759 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP8.18□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 TEX2Q8IWB9 1127 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 SMRP1Q8NCR6 262 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 SNX21Q969T3 373 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 ZSWIM3Q96MP5 696 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 CRISPLD1Q9H336 500 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 ANKEF1Q9NU02 776 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 EOMESO95936 686 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 TRIM49P0CI25 452 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 TRIM49CP0CI26 452 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 BFSP1Q12934 665 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 PLD1Q13393 1074 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 SLC5A9Q2M3M2 681 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 DEFB119Q8N690 84 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 LINC01465Q8N7H1 131 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 MAB21L3Q8N8X9 362 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 IGSF22Q8N9C0 903 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 FSIP1Q8NA03 581 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 CCDC39Q9UFE4 941 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
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CS-212ENST00000548567 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
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CS-212ENST00000548567 RB1P06400 928 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 PRR29P0C7W0 189 aa8.17□□□□□ -1.1
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CS-212ENST00000548567 TWF1Q12792 350 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 RESTQ13127 1097 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 TUSC3Q13454 348 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 MCTP2Q6DN12 878 aa8.17□□□□□ -1.1
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CS-212ENST00000548567 FAM49BQ9NUQ9 324 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 TBX20Q9UMR3 447 aa8.17□□□□□ -1.1
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CS-212ENST00000548567 NOTCH2Q04721 2471 aa8.17□□□□□ -1.1
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CS-212ENST00000548567 SEC24AO95486 1093 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 HMBSP08397 361 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 CTSAP10619 480 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 IRF1P10914 325 aa8.16□□□□□ -1.1
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CS-212ENST00000548567 PPM1AP35813 382 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 FAM189BP81408 668 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 WDR72Q3MJ13 1102 aa8.16□□□□□ -1.1
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CS-212ENST00000548567 ANKRD54Q6NXT1 300 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 FBXL16Q8N461 479 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 SMOC1Q9H4F8 434 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
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CS-212ENST00000548567 PLS3P13797 630 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 PDCP20941 246 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 LMO2P25791 158 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 NAMPTP43490 491 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 ROR1Q01973 937 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 PNOCQ13519 176 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 PPP2R5AQ15172 486 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-212ENST00000548567 DUSP6Q16828 381 aa8.16□□□□□ -1.1
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