RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533342.5

ANKRD42-209, Transcript of ankyrin repeat domain 42, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD42, Length 1,949 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42-209ENST00000533342 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 BECN1Q14457 450 aa11.75□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 TMEM132DQ14C87 1099 aa11.75□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 ZBTB6Q15916 424 aa11.75□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 SLC7A14Q8TBB6 771 aa11.75□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa11.75□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 MTRRQ9UBK8 725 aa11.75□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa11.75□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 CLIC2O15247 247 aa11.74□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 SPTLC1O15269 473 aa11.74□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 C8AP07357 584 aa11.74□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 PRR29P0C7W0 189 aa11.74□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 CTXN3Q4LDR2 81 aa11.74□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 TMEM31Q5JXX7 168 aa11.74□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 DSTYKQ6XUX3 929 aa11.74□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 RDH13Q8NBN7 331 aa11.74□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 C7orf25Q9BPX7 421 aa11.74□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa11.74□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 OLFML3Q9NRN5 406 aa11.74□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 FBXW11Q9UKB1 542 aa11.74□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 STYXL1Q9Y6J8 313 aa11.74□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 TSC2P49815 1807 aa11.74□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 TECTAO75443 2155 aa11.74□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 DOCK8Q8NF50 2099 aa11.74□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 TRAPPC3O43617 180 aa11.74□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 COL9A1P20849 921 aa11.74□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 RPL9P32969 192 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 NDUFA8P51970 172 aa11.74□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 ROR1Q01973 937 aa11.74□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 FAM26FQ5R3K3 315 aa11.74□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 PPM1LQ5SGD2 360 aa11.74□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 C9orf57Q5W0N0 161 aa11.74□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 SLFN12LQ6IEE8 588 aa11.74□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 ARMCX5Q6P1M9 558 aa11.74□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 CCDC149Q6ZUS6 474 aa11.74□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 CEP57L1Q8IYX8 460 aa11.74□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 FSIP1Q8NA03 581 aa11.74□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 BEST2Q8NFU1 509 aa11.74□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 RSAD2Q8WXG1 361 aa11.74□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 KCNN1Q92952 543 aa11.74□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 HVCN1Q96D96 273 aa11.74□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 PAGE5Q96GU1 130 aa11.74□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 SUSD3Q96L08 255 aa11.74□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 TMEM209Q96SK2 561 aa11.74□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 FBXL5Q9UKA1 691 aa11.74□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 EXOC7Q9UPT5 735 aa11.74□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 NOTCH4Q99466 2003 aa11.74□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 WDR27A2RRH5 827 aa11.73□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 ZMYND10O75800 440 aa11.73□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 SEC24AO95486 1093 aa11.73□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 LRPAP1P30533 357 aa11.73□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 CYP2J2P51589 502 aa11.73□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 AMPD3Q01432 767 aa11.73□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 LIN9Q5TKA1 542 aa11.73□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 SPATA1Q5VX52 437 aa11.73□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 ATL3Q6DD88 541 aa11.73□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 UNC13DQ70J99 1090 aa11.73□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 NECTIN4Q96NY8 510 aa11.73□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 PGLYRP2Q96PD5 576 aa11.73□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 MYADMQ96S97 322 aa11.73□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 CUEDC2Q9H467 287 aa11.73□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 PDE11AQ9HCR9 933 aa11.73□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 DPP3Q9NY33 737 aa11.73□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 NR2E1Q9Y466 385 aa11.73□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 TRIOO75962 3097 aa11.73□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 ALADP13716 330 aa11.72□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 CREMQ03060 361 aa11.72□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 RAB33AQ14088 237 aa11.72□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 ANKS3Q6ZW76 656 aa11.72□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 CBWD2Q8IUF1 395 aa11.72□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 SCFD1Q8WVM8 642 aa11.72□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 ING5Q8WYH8 240 aa11.72□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa11.72□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 PRKD2Q9BZL6 878 aa11.72□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 PCDHB8Q9UN66 801 aa11.72□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 CLUHO75153 1309 aa11.72□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 PTPRJQ12913 1337 aa11.72□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 KLRC4O43908 158 aa11.72□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 ADRB2P07550 413 aa11.72□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 CPB1P15086 417 aa11.72□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 CMA1P23946 247 aa11.72□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 LILRA4P59901 499 aa11.72□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 ZXDAP98168 799 aa11.72□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 POSTNQ15063 836 aa11.72□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 KYAT1Q16773 422 aa11.72□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa11.72□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 ITFG1Q8TB96 612 aa11.72□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
ANKRD42-209ENST00000533342 SENP8Q96LD8 212 aa11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms