RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531466.1

PTPRK-220, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 311 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-220ENST00000531466 LPIN2Q92539 896 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-220ENST00000531466 IFT22Q9H7X7 185 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-220ENST00000531466 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-220ENST00000531466 SRGNP10124 158 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-220ENST00000531466 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-220ENST00000531466 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-220ENST00000531466 MCAMP43121 646 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-220ENST00000531466 MTM1Q13496 603 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-220ENST00000531466 DHCR24Q15392 516 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-220ENST00000531466 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-220ENST00000531466 FCRLBQ6BAA4 426 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-220ENST00000531466 KCNK18Q7Z418 384 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-220ENST00000531466 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-220ENST00000531466 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-220ENST00000531466 WNT6Q9Y6F9 365 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRK-220ENST00000531466 AMY1AP04745 511 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRK-220ENST00000531466 MTHFD2P13995 350 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRK-220ENST00000531466 SCAND1P57086 179 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRK-220ENST00000531466 MALLQ13021 153 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRK-220ENST00000531466 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRK-220ENST00000531466 LMBR1Q8WVP7 490 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRK-220ENST00000531466 TLR10Q9BXR5 811 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRK-220ENST00000531466 INTS13Q9NVM9 706 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRK-220ENST00000531466 AOX1Q06278 1338 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRK-220ENST00000531466 A0A1W2PS29 197 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRK-220ENST00000531466 LINC00473A8K010 186 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRK-220ENST00000531466 ADM5C9JUS6 153 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRK-220ENST00000531466 PROM1O43490 865 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRK-220ENST00000531466 CHRM2P08172 466 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRK-220ENST00000531466 GATA3P23771 443 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRK-220ENST00000531466 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRK-220ENST00000531466 NBPF8Q3BBV2 869 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRK-220ENST00000531466 TTC1Q99614 292 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRK-220ENST00000531466 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRK-220ENST00000531466 ADAM21Q9UKJ8 722 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRK-220ENST00000531466 MAPRE3Q9UPY8 281 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRK-220ENST00000531466 ZEB2O60315 1214 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-220ENST00000531466 MGAT2Q10469 447 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-220ENST00000531466 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-220ENST00000531466 MTX3Q5HYI7 312 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-220ENST00000531466 CLNKQ7Z7G1 428 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-220ENST00000531466 VGLL2Q8N8G2 317 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-220ENST00000531466 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-220ENST00000531466 ZBTB9Q96C00 473 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-220ENST00000531466 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-220ENST00000531466 CDYLQ9Y232 598 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRK-220ENST00000531466 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-220ENST00000531466 PRAMEF10O60809 474 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-220ENST00000531466 DDCP20711 480 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-220ENST00000531466 SOX10P56693 466 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-220ENST00000531466 CREMQ03060 361 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-220ENST00000531466 FPGSQ05932 587 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-220ENST00000531466 STRN3Q13033 797 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-220ENST00000531466 TXNRD1Q16881 649 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-220ENST00000531466 ANO4Q32M45 955 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-220ENST00000531466 OR2I1PQ8NGU4 316 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-220ENST00000531466 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-220ENST00000531466 CYFIP2Q96F07 1278 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-220ENST00000531466 ORAI2Q96SN7 254 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-220ENST00000531466 VTA1Q9NP79 307 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-220ENST00000531466 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-220ENST00000531466 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-220ENST00000531466 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRK-220ENST00000531466 TP73O15350 636 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRK-220ENST00000531466 KCNA2P16389 499 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRK-220ENST00000531466 SLC6A4P31645 630 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRK-220ENST00000531466 RPS7P62081 194 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRK-220ENST00000531466 ATP8B2P98198 1209 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRK-220ENST00000531466 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRK-220ENST00000531466 PTPRRQ15256 657 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRK-220ENST00000531466 TMEM119Q4V9L6 283 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRK-220ENST00000531466 RASAL3Q86YV0 1011 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRK-220ENST00000531466 HAPLN3Q96S86 360 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRK-220ENST00000531466 DNM3Q9UQ16 869 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRK-220ENST00000531466 ZNF804BA4D1E1 1349 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRK-220ENST00000531466 HAUS5O94927 633 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRK-220ENST00000531466 LLGL1Q15334 1064 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRK-220ENST00000531466 ZNF626Q68DY1 528 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRK-220ENST00000531466 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
PTPRK-220ENST00000531466 PGBD1Q96JS3 809 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRK-220ENST00000531466 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
PTPRK-220ENST00000531466 DNAJC28Q9NX36 388 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRK-220ENST00000531466 FLRT1Q9NZU1 646 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRK-220ENST00000531466 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
PTPRK-220ENST00000531466 LINC01548A6NM66 108 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRK-220ENST00000531466 FAM171A2A8MVW0 826 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRK-220ENST00000531466 AGFG2O95081 481 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRK-220ENST00000531466 PRR35P0CG20 571 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRK-220ENST00000531466 OSMP13725 252 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRK-220ENST00000531466 PPP3CBP16298 524 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRK-220ENST00000531466 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
PTPRK-220ENST00000531466 GRM1Q13255 1194 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRK-220ENST00000531466 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
PTPRK-220ENST00000531466 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
PTPRK-220ENST00000531466 DACT2Q5SW24 774 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRK-220ENST00000531466 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
PTPRK-220ENST00000531466 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
PTPRK-220ENST00000531466 STRA8Q7Z7C7 330 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRK-220ENST00000531466 UBR7Q8N806 425 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRK-220ENST00000531466 MANSC1Q9H8J5 431 aa6.22□□□□□ -1.41
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