RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526550.1

PTPRJ-203, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRJ, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-203ENST00000526550 TBC1D32Q96NH3 1257 aa8□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 PGLYRP2Q96PD5 576 aa8□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 TIPINQ9BVW5 301 aa8□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 OSBPL6Q9BZF3 934 aa8□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 ASAH2Q9NR71 780 aa8□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 CNTN3Q9P232 1028 aa8□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 FBXO4Q9UKT5 387 aa8□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 KIF3AQ9Y496 699 aa8□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 USP34Q70CQ2 3546 aa8□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa8□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 CFAP54Q96N23 3096 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 DOCK8Q8NF50 2099 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 VWA3AA6NCI4 1184 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 H3BQV1 296 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 SPTLC1O15269 473 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 CLDN3O15551 220 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 OR4Q2P0C623 313 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 PLA2G4BP0C869 781 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 MAPTP10636 758 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 PLS3P13797 630 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 PROZP22891 400 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 GUCY2CP25092 1073 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP7.99□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 PRPHP41219 470 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 VIPR2P41587 438 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 LIG4P49917 911 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 GUCY2FP51841 1108 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 PPP2R3AQ06190 1150 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 SLC10A6Q3KNW5 377 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 PRSS36Q5K4E3 855 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 TPGS2Q68CL5 300 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 USP37Q86T82 979 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 YAF2Q8IY57 180 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 TMEM130Q8N3G9 435 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 RASSF8Q8NHQ8 419 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 SPIRE2Q8WWL2 714 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 FAM212AQ96EL1 285 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 SUSD3Q96L08 255 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 ZSWIM3Q96MP5 696 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 PNMA5Q96PV4 448 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 NELL2Q99435 816 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 ZHX3Q9H4I2 956 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 C17orf75Q9HAS0 396 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 ZSCAN32Q9NX65 697 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 PCDHB8Q9UN66 801 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 YIPF1Q9Y548 306 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 SPTBN4Q9H254 2564 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 H0YCG3 227 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 K7ENM7 598 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 MAN2B1O00754 1011 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 ABLIM1O14639 778 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 ZNF263O14978 683 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 TBC1D4O60343 1298 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 KRT18P05783 430 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 CLTAP09496 248 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 FCARP24071 287 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 CCR2P41597 374 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 EPHB3P54753 998 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 MTAPQ13126 283 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP7.98□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 TEAD2Q15562 447 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 LPAL2Q16609 132 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 ZNF528Q3MIS6 628 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 RILPL1Q5EBL4 403 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 POTEHQ6S545 545 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 VITQ6UXI7 678 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 ZPBP2Q6X784 338 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 GPIHBP1Q8IV16 184 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 SUMF1Q8NBK3 374 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 LEMD2Q8NC56 503 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 FAM3CQ92520 227 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 DNASE1L2Q92874 299 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 SMARCD2Q92925 531 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 IRF7Q92985 503 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 ASB16Q96NS5 453 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 CEP72Q9P209 647 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
PTPRJ-203ENST00000526550 KCNG1Q9UIX4 513 aa7.98□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.8 ms