RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
TSNARE1-208ENST00000524325 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
TSNARE1-208ENST00000524325 ANK1P16157 1881 aa24.48■■□□□ 1.51
TSNARE1-208ENST00000524325 SPTLC1O15269 473 aa24.48■■□□□ 1.51
TSNARE1-208ENST00000524325 ITGB1P05556 798 aa24.48■■□□□ 1.51
TSNARE1-208ENST00000524325 MYOGP15173 224 aa24.48■■□□□ 1.51
TSNARE1-208ENST00000524325 OR1G1P47890 313 aa24.48■■□□□ 1.51
TSNARE1-208ENST00000524325 RBP5P82980 135 aa24.48■■□□□ 1.51
TSNARE1-208ENST00000524325 DSC1Q08554 894 aa24.48■■□□□ 1.51
TSNARE1-208ENST00000524325 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa24.48■■□□□ 1.51
TSNARE1-208ENST00000524325 RRAGAQ7L523 313 aa24.48■■□□□ 1.51
TSNARE1-208ENST00000524325 ARHGEF19Q8IW93 802 aa24.48■■□□□ 1.51
TSNARE1-208ENST00000524325 COLGALT2Q8IYK4 626 aa24.48■■□□□ 1.51
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
TSNARE1-208ENST00000524325 ERGIC2Q96RQ1 377 aa24.48■■□□□ 1.51
TSNARE1-208ENST00000524325 SIX2Q9NPC8 291 aa24.48■■□□□ 1.51
TSNARE1-208ENST00000524325 KANSL3Q9P2N6 904 aa24.48■■□□□ 1.51
TSNARE1-208ENST00000524325 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
TSNARE1-208ENST00000524325 CITO14578 2027 aa24.48■■□□□ 1.51
TSNARE1-208ENST00000524325 TRIP11Q15643 1979 aa24.48■■□□□ 1.51
TSNARE1-208ENST00000524325 ANO9A1A5B4 782 aa24.47■■□□□ 1.51
TSNARE1-208ENST00000524325 LCHNA4D1U4 455 aa24.47■■□□□ 1.51
TSNARE1-208ENST00000524325 PODXLO00592 558 aa24.47■■□□□ 1.51
TSNARE1-208ENST00000524325 CETN1Q12798 172 aa24.47■■□□□ 1.51
TSNARE1-208ENST00000524325 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
TSNARE1-208ENST00000524325 KAT5Q92993 513 aa24.47■■□□□ 1.51
TSNARE1-208ENST00000524325 HPDLQ96IR7 371 aa24.47■■□□□ 1.51
TSNARE1-208ENST00000524325 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
TSNARE1-208ENST00000524325 POLIQ9UNA4 740 aa24.47■■□□□ 1.51
TSNARE1-208ENST00000524325 NUB1Q9Y5A7 615 aa24.47■■□□□ 1.51
TSNARE1-208ENST00000524325 I3L4J1 428 aa24.47■■□□□ 1.51
TSNARE1-208ENST00000524325 PIRO00625 290 aa24.47■■□□□ 1.51
TSNARE1-208ENST00000524325 P4HA2O15460 535 aa24.47■■□□□ 1.51
TSNARE1-208ENST00000524325 XPOTO43592 962 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
TSNARE1-208ENST00000524325 TPM3P06753 285 aa24.47■■□□□ 1.51
TSNARE1-208ENST00000524325 CYP3A5P20815 502 aa24.47■■□□□ 1.51
TSNARE1-208ENST00000524325 UPP1Q16831 310 aa24.47■■□□□ 1.51
TSNARE1-208ENST00000524325 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa24.47■■□□□ 1.51
TSNARE1-208ENST00000524325 SPC24Q8NBT2 197 aa24.47■■□□□ 1.51
TSNARE1-208ENST00000524325 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
TSNARE1-208ENST00000524325 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
TSNARE1-208ENST00000524325 COL4A6Q14031 1691 aa24.46■■□□□ 1.51
TSNARE1-208ENST00000524325 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
TSNARE1-208ENST00000524325 PMM2O15305 246 aa24.46■■□□□ 1.51
TSNARE1-208ENST00000524325 B3GAT3O94766 335 aa24.46■■□□□ 1.51
TSNARE1-208ENST00000524325 NOL4O94818 638 aa24.46■■□□□ 1.51
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF699Q32M78 642 aa24.46■■□□□ 1.51
TSNARE1-208ENST00000524325 TMC6Q7Z403 805 aa24.46■■□□□ 1.51
TSNARE1-208ENST00000524325 VSTM4Q8IW00 320 aa24.46■■□□□ 1.51
TSNARE1-208ENST00000524325 LRRC43Q8N309 656 aa24.46■■□□□ 1.51
TSNARE1-208ENST00000524325 ARID3AQ99856 593 aa24.46■■□□□ 1.51
TSNARE1-208ENST00000524325 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
TSNARE1-208ENST00000524325 CWH43Q9H720 699 aa24.46■■□□□ 1.51
TSNARE1-208ENST00000524325 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
TSNARE1-208ENST00000524325 LRPAP1P30533 357 aa24.45■■□□□ 1.51
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC11A1P49279 550 aa24.45■■□□□ 1.51
TSNARE1-208ENST00000524325 NOP14P78316 857 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.51
TSNARE1-208ENST00000524325 GOLGA8FQ08AF8 430 aa24.45■■□□□ 1.51
TSNARE1-208ENST00000524325 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa24.45■■□□□ 1.51
TSNARE1-208ENST00000524325 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.51
TSNARE1-208ENST00000524325 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa24.45■■□□□ 1.51
TSNARE1-208ENST00000524325 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.51
TSNARE1-208ENST00000524325 CPLX3Q8WVH0 158 aa24.45■■□□□ 1.51
TSNARE1-208ENST00000524325 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa24.45■■□□□ 1.51
TSNARE1-208ENST00000524325 TSPAN18Q96SJ8 248 aa24.45■■□□□ 1.51
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC9A7Q96T83 725 aa24.45■■□□□ 1.51
TSNARE1-208ENST00000524325 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
TSNARE1-208ENST00000524325 TLL1O43897 1013 aa24.45■■□□□ 1.5
TSNARE1-208ENST00000524325 KIF4AO95239 1232 aa24.45■■□□□ 1.5
TSNARE1-208ENST00000524325 ASS1P00966 412 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
TSNARE1-208ENST00000524325 WDR72Q3MJ13 1102 aa24.45■■□□□ 1.5
TSNARE1-208ENST00000524325 CD300LGQ6UXG3 332 aa24.45■■□□□ 1.5
TSNARE1-208ENST00000524325 A0A1W2PQC6 194 aa24.44■■□□□ 1.5
TSNARE1-208ENST00000524325 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa24.44■■□□□ 1.5
TSNARE1-208ENST00000524325 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa24.44■■□□□ 1.5
TSNARE1-208ENST00000524325 SPRED2Q7Z698 418 aa24.44■■□□□ 1.5
TSNARE1-208ENST00000524325 DRC7Q8IY82 874 aa24.44■■□□□ 1.5
TSNARE1-208ENST00000524325 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
TSNARE1-208ENST00000524325 NLRC4Q9NPP4 1024 aa24.44■■□□□ 1.5
TSNARE1-208ENST00000524325 FHOD1Q9Y613 1164 aa24.44■■□□□ 1.5
TSNARE1-208ENST00000524325 NRP1O14786 923 aa24.43■■□□□ 1.5
TSNARE1-208ENST00000524325 BRCC3P46736 316 aa24.43■■□□□ 1.5
TSNARE1-208ENST00000524325 BCAR1P56945 870 aa24.43■■□□□ 1.5
TSNARE1-208ENST00000524325 LILRA4P59901 499 aa24.43■■□□□ 1.5
TSNARE1-208ENST00000524325 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
TSNARE1-208ENST00000524325 WDR44Q5JSH3 913 aa24.43■■□□□ 1.5
TSNARE1-208ENST00000524325 PPM1KQ8N3J5 372 aa24.43■■□□□ 1.5
TSNARE1-208ENST00000524325 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
TSNARE1-208ENST00000524325 ARHGEF15O94989 841 aa24.43■■□□□ 1.5
TSNARE1-208ENST00000524325 GALTP07902 379 aa24.43■■□□□ 1.5
TSNARE1-208ENST00000524325 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
TSNARE1-208ENST00000524325 RAP1GAPP47736 663 aa24.43■■□□□ 1.5
TSNARE1-208ENST00000524325 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
TSNARE1-208ENST00000524325 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa24.43■■□□□ 1.5
TSNARE1-208ENST00000524325 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa24.43■■□□□ 1.5
TSNARE1-208ENST00000524325 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
TSNARE1-208ENST00000524325 GANQ9H2C0 597 aa24.43■■□□□ 1.5
TSNARE1-208ENST00000524325 INSL6Q9Y581 213 aa24.43■■□□□ 1.5
TSNARE1-208ENST00000524325 SNX9Q9Y5X1 595 aa24.43■■□□□ 1.5
TSNARE1-208ENST00000524325 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms