RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521067.1

PABPC1-217, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 1, humanhuman

TSL 3

Gene PABPC1, Length 492 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1-217ENST00000521067 LMNAP02545 664 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PABPC1-217ENST00000521067 LRG1P02750 347 aa22.14■■□□□ 1.13
PABPC1-217ENST00000521067 CXCL8P10145 99 aa22.14■■□□□ 1.13
PABPC1-217ENST00000521067 FCARP24071 287 aa22.14■■□□□ 1.13
PABPC1-217ENST00000521067 SMTNP53814 917 aa22.14■■□□□ 1.13
PABPC1-217ENST00000521067 RABEP1Q15276 862 aa22.14■■□□□ 1.13
PABPC1-217ENST00000521067 ZBTB6Q15916 424 aa22.14■■□□□ 1.13
PABPC1-217ENST00000521067 CTXN3Q4LDR2 81 aa22.14■■□□□ 1.13
PABPC1-217ENST00000521067 ZPBP2Q6X784 338 aa22.14■■□□□ 1.13
PABPC1-217ENST00000521067 HS6ST3Q8IZP7 471 aa22.14■■□□□ 1.13
PABPC1-217ENST00000521067 KCNG4Q8TDN1 519 aa22.14■■□□□ 1.13
PABPC1-217ENST00000521067 INSL5Q9Y5Q6 135 aa22.14■■□□□ 1.13
PABPC1-217ENST00000521067 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa22.13■■□□□ 1.13
PABPC1-217ENST00000521067 CLDN3O15551 220 aa22.13■■□□□ 1.13
PABPC1-217ENST00000521067 MOSPD3O75425 235 aa22.13■■□□□ 1.13
PABPC1-217ENST00000521067 GJB2P29033 226 aa22.13■■□□□ 1.13
PABPC1-217ENST00000521067 MCM4P33991 863 aa22.13■■□□□ 1.13
PABPC1-217ENST00000521067 TNFSF9P41273 254 aa22.13■■□□□ 1.13
PABPC1-217ENST00000521067 UBXN2BQ14CS0 331 aa22.13■■□□□ 1.13
PABPC1-217ENST00000521067 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa22.13■■□□□ 1.13
PABPC1-217ENST00000521067 SEMA4AQ9H3S1 761 aa22.13■■□□□ 1.13
PABPC1-217ENST00000521067 CEP72Q9P209 647 aa22.13■■□□□ 1.13
PABPC1-217ENST00000521067 TTC26A0AVF1 554 aa22.12■■□□□ 1.13
PABPC1-217ENST00000521067 VNN2O95498 520 aa22.12■■□□□ 1.13
PABPC1-217ENST00000521067 NCKAP1LP55160 1127 aa22.12■■□□□ 1.13
PABPC1-217ENST00000521067 PFKPQ01813 784 aa22.12■■□□□ 1.13
PABPC1-217ENST00000521067 ADCY1Q08828 1119 aa22.12■■□□□ 1.13
PABPC1-217ENST00000521067 FZD5Q13467 585 aa22.12■■□□□ 1.13
PABPC1-217ENST00000521067 FAM78AQ5JUQ0 283 aa22.12■■□□□ 1.13
PABPC1-217ENST00000521067 TPGS2Q68CL5 300 aa22.12■■□□□ 1.13
PABPC1-217ENST00000521067 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa22.12■■□□□ 1.13
PABPC1-217ENST00000521067 KCTD17Q8N5Z5 321 aa22.12■■□□□ 1.13
PABPC1-217ENST00000521067 ZSWIM3Q96MP5 696 aa22.12■■□□□ 1.13
PABPC1-217ENST00000521067 LTB4R2Q9NPC1 389 aa22.12■■□□□ 1.13
PABPC1-217ENST00000521067 KCNG1Q9UIX4 513 aa22.12■■□□□ 1.13
PABPC1-217ENST00000521067 PCDHB8Q9UN66 801 aa22.12■■□□□ 1.13
PABPC1-217ENST00000521067 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PABPC1-217ENST00000521067 FAM189A1O60320 539 aa22.11■■□□□ 1.13
PABPC1-217ENST00000521067 CLTAP09496 248 aa22.11■■□□□ 1.13
PABPC1-217ENST00000521067 GUCY2FP51841 1108 aa22.11■■□□□ 1.13
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PABPC1-217ENST00000521067 HAUS6Q7Z4H7 955 aa22.11■■□□□ 1.13
PABPC1-217ENST00000521067 APPL2Q8NEU8 664 aa22.11■■□□□ 1.13
PABPC1-217ENST00000521067 KCNN1Q92952 543 aa22.11■■□□□ 1.13
PABPC1-217ENST00000521067 ELSPBP1Q96BH3 223 aa22.11■■□□□ 1.13
PABPC1-217ENST00000521067 OSBPL6Q9BZF3 934 aa22.11■■□□□ 1.13
PABPC1-217ENST00000521067 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa22.11■■□□□ 1.13
PABPC1-217ENST00000521067 HEBP1Q9NRV9 189 aa22.11■■□□□ 1.13
PABPC1-217ENST00000521067 KCND2Q9NZV8 630 aa22.11■■□□□ 1.13
PABPC1-217ENST00000521067 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PABPC1-217ENST00000521067 KIF3AQ9Y496 699 aa22.11■■□□□ 1.13
PABPC1-217ENST00000521067 F5P12259 2224 aa22.11■■□□□ 1.13
PABPC1-217ENST00000521067 LACTBL1A8MY62 500 aa22.1■■□□□ 1.13
PABPC1-217ENST00000521067 M0QZQ0 153 aa22.1■■□□□ 1.13
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PABPC1-217ENST00000521067 TARSP26639 723 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
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PABPC1-217ENST00000521067 TWF1Q12792 350 aa22.1■■□□□ 1.13
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PABPC1-217ENST00000521067 ZNF280DQ6N043 979 aa22.1■■□□□ 1.13
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PABPC1-217ENST00000521067 KIF12Q96FN5 646 aa22.1■■□□□ 1.13
PABPC1-217ENST00000521067 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa22.1■■□□□ 1.13
PABPC1-217ENST00000521067 ASB16Q96NS5 453 aa22.1■■□□□ 1.13
PABPC1-217ENST00000521067 REEP2Q9BRK0 252 aa22.1■■□□□ 1.13
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PABPC1-217ENST00000521067 MICAL2O94851 1124 aa22.09■■□□□ 1.13
PABPC1-217ENST00000521067 OAZ2O95190 189 aa22.09■■□□□ 1.13
PABPC1-217ENST00000521067 OR4Q2P0C623 313 aa22.09■■□□□ 1.13
PABPC1-217ENST00000521067 GJA1P17302 382 aa22.09■■□□□ 1.13
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PABPC1-217ENST00000521067 CLDN23Q96B33 292 aa22.09■■□□□ 1.13
PABPC1-217ENST00000521067 TBX20Q9UMR3 447 aa22.09■■□□□ 1.13
PABPC1-217ENST00000521067 ZNF197O14709 1029 aa22.08■■□□□ 1.13
PABPC1-217ENST00000521067 PPEF2O14830 753 aa22.08■■□□□ 1.13
PABPC1-217ENST00000521067 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
PABPC1-217ENST00000521067 ID4P47928 161 aa22.08■■□□□ 1.13
PABPC1-217ENST00000521067 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
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PABPC1-217ENST00000521067 SLC39A4Q6P5W5 647 aa22.08■■□□□ 1.13
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PABPC1-217ENST00000521067 ZNF687Q8N1G0 1237 aa22.08■■□□□ 1.13
PABPC1-217ENST00000521067 DCLK2Q8N568 766 aa22.08■■□□□ 1.13
PABPC1-217ENST00000521067 BICD1Q96G01 975 aa22.08■■□□□ 1.13
PABPC1-217ENST00000521067 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
PABPC1-217ENST00000521067 FIZ1Q96SL8 496 aa22.08■■□□□ 1.13
PABPC1-217ENST00000521067 NCANO14594 1321 aa22.07■■□□□ 1.12
PABPC1-217ENST00000521067 CACNA1AO00555 2505 aa22.07■■□□□ 1.12
PABPC1-217ENST00000521067 ADRB2P07550 413 aa22.07■■□□□ 1.12
PABPC1-217ENST00000521067 CPB1P15086 417 aa22.07■■□□□ 1.12
PABPC1-217ENST00000521067 CYP3A5P20815 502 aa22.07■■□□□ 1.12
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