RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516272.1

RNU6-277P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 277, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-277P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-277P-201ENST00000516272 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-277P-201ENST00000516272 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
RNU6-277P-201ENST00000516272 PDPRQ8NCN5 879 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC30A5Q8TAD4 765 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-277P-201ENST00000516272 CYFIP2Q96F07 1278 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-277P-201ENST00000516272 SCOCQ9UIL1 159 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-277P-201ENST00000516272 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-277P-201ENST00000516272 MAPRE3Q9UPY8 281 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-277P-201ENST00000516272 DNM3Q9UQ16 869 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-277P-201ENST00000516272 CDYLQ9Y232 598 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-277P-201ENST00000516272 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
RNU6-277P-201ENST00000516272 PRKCGP05129 697 aa3.96□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 CELA2AP08217 269 aa3.96□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 SRGNP10124 158 aa3.96□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 WT1P19544 449 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 MCAMP43121 646 aa3.96□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLFN5Q08AF3 891 aa3.96□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 MAPK7Q13164 816 aa3.96□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 ANO4Q32M45 955 aa3.96□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 KIAA0895LQ68EN5 471 aa3.96□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 FCRLBQ6BAA4 426 aa3.96□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF425Q6IV72 752 aa3.96□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 CLNKQ7Z7G1 428 aa3.96□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 C9orf106Q8NAJ2 232 aa3.96□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 LPIN2Q92539 896 aa3.96□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 UBXN4Q92575 508 aa3.96□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 DPF1Q92782 380 aa3.96□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 HAPLN3Q96S86 360 aa3.96□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa3.96□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 A0A087X0B3 334 aa3.95□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa3.95□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 LINC00473A8K010 186 aa3.95□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM171A2A8MVW0 826 aa3.95□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 PRAMEF10O60809 474 aa3.95□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 DDCP20711 480 aa3.95□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC5A3P53794 718 aa3.95□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 SOX10P56693 466 aa3.95□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 RPS7P62081 194 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF844Q08AG5 666 aa3.95□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 GRM1Q13255 1194 aa3.95□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 SEPT2Q15019 361 aa3.95□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM119Q4V9L6 283 aa3.95□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 MTX3Q5HYI7 312 aa3.95□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 RASAL3Q86YV0 1011 aa3.95□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP3.95□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 LMBR1Q8WVP7 490 aa3.95□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 PGBD1Q96JS3 809 aa3.95□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 MANSC1Q9H8J5 431 aa3.95□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 DNAJC28Q9NX36 388 aa3.95□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 A0A1W2PS29 197 aa3.94□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 WIPF3A6NGB9 483 aa3.94□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 ADM5C9JUS6 153 aa3.94□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 TOR1BO14657 336 aa3.94□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 HAUS5O94927 633 aa3.94□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 BMP15O95972 392 aa3.94□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 OSMP13725 252 aa3.94□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 KCNA2P16389 499 aa3.94□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 GATA3P23771 443 aa3.94□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 ITPKBP27987 946 aa3.94□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC6A9P48067 706 aa3.94□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 MGAT2Q10469 447 aa3.94□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 MTM1Q13496 603 aa3.94□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 KCNK18Q7Z418 384 aa3.94□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 VGLL2Q8N8G2 317 aa3.94□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 Q8NA96 180 aa3.94□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa3.94□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa3.94□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 DRC1Q96MC2 740 aa3.94□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 TLR10Q9BXR5 811 aa3.94□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 PADI4Q9UM07 663 aa3.94□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 NR2E3Q9Y5X4 410 aa3.94□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 AGFG2O95081 481 aa3.93□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 AMY1AP04745 511 aa3.93□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 ELFN1P0C7U0 828 aa3.93□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 LLGL1Q15334 1064 aa3.93□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 TXNRD1Q16881 649 aa3.93□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 TAF7LQ5H9L4 462 aa3.93□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.93□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 SUMO4Q6EEV6 95 aa3.93□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 RSPH3Q86UC2 560 aa3.93□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 RHOT1Q8IXI2 618 aa3.93□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 UBR7Q8N806 425 aa3.93□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 SNX19Q92543 992 aa3.93□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZBTB9Q96C00 473 aa3.93□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 C7orf25Q9BPX7 421 aa3.93□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 C14orf119Q9NWQ9 140 aa3.93□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF804BA4D1E1 1349 aa3.93□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 PROM1O43490 865 aa3.92□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 TTLL1O95922 423 aa3.92□□□□□ -1.78
RNU6-277P-201ENST00000516272 PRR35P0CG20 571 aa3.92□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms