RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495399.1

C9orf135-204, Transcript of chromosome 9 open reading frame 135, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf135, Length 502 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-204ENST00000495399 DARSP14868 501 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 XBP1P17861 261 aa8.3□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 RPL17P18621 184 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 CCNE1P24864 410 aa8.3□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 KRT2P35908 639 aa8.3□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 ZNF76P36508 570 aa8.3□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 PXNP49023 591 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 GLUD2P49448 558 aa8.3□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 SLC26A2P50443 739 aa8.3□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 GRM2Q14416 872 aa8.3□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 SLC5A9Q2M3M2 681 aa8.3□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 PKN3Q6P5Z2 889 aa8.3□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa8.3□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 PCSK4Q6UW60 755 aa8.3□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 CKAP2LQ8IYA6 745 aa8.3□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 FAM184AQ8NB25 1140 aa8.3□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 BICD2Q8TD16 824 aa8.3□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 C8orf76Q96K31 380 aa8.3□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 MKNK1Q9BUB5 465 aa8.3□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 TMEM9BQ9NQ34 198 aa8.3□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 ZNF302Q9NR11 478 aa8.3□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 KCNH3Q9ULD8 1083 aa8.3□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa8.3□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 FAN1Q9Y2M0 1017 aa8.3□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 PIAS3Q9Y6X2 628 aa8.3□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 VWA8A3KMH1 1905 aa8.3□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 ABCA7Q8IZY2 2146 aa8.3□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 ARID2Q68CP9 1835 aa8.29□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa8.29□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 A0A087WV48 116 aa8.29□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 PATE3B3GLJ2 98 aa8.29□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 FAM86B1E9PN63 330 aa8.29□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 CCL16O15467 120 aa8.29□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 DHX15O43143 795 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 CAVIN2O95810 425 aa8.29□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 CYP3A4P08684 503 aa8.29□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP8.29□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 FAM86B2P0C5J1 330 aa8.29□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 HOXA9P31269 272 aa8.29□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 GPC3P51654 580 aa8.29□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 CLCN3P51790 818 aa8.29□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 TRIM29Q14134 588 aa8.29□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa8.29□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 TXNDC11Q6PKC3 985 aa8.29□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 GLB1LQ6UWU2 654 aa8.29□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa8.29□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 PLA2G4DQ86XP0 818 aa8.29□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 COLGALT2Q8IYK4 626 aa8.29□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 GPR65Q8IYL9 337 aa8.29□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 LRRC71Q8N4P6 559 aa8.29□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 TBCKQ8TEA7 893 aa8.29□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 ING5Q8WYH8 240 aa8.29□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 MCRS1Q96EZ8 462 aa8.29□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 GPR62Q9BZJ7 368 aa8.29□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 DKK4Q9UBT3 224 aa8.29□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 AKT3Q9Y243 479 aa8.29□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 MYO9AB2RTY4 2548 aa8.29□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 ATMQ13315 3056 aa8.28□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 UPK3BL1B0FP48 263 aa8.28□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 UPK3BL2E5RIL1 263 aa8.28□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 H0Y626 953 aa8.28□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 KRT38O76015 456 aa8.28□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 TRIM16O95361 564 aa8.28□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 SYT1P21579 422 aa8.28□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 LORP23490 312 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP8.28□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 CIITAP33076 1130 aa8.28□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 IRX4P78413 519 aa8.28□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 DSC1Q08554 894 aa8.28□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 SEMA3BQ13214 749 aa8.28□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 CCINQ13939 588 aa8.28□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 INF2Q27J81 1249 aa8.28□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 EFCAB12Q6NXP0 572 aa8.28□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 VITQ6UXI7 678 aa8.28□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 KRT25Q7Z3Z0 450 aa8.28□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 GLYCTKQ8IVS8 523 aa8.28□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa8.28□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 LENG9Q96B70 501 aa8.28□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 CLMPQ9H6B4 373 aa8.28□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 BRD9Q9H8M2 597 aa8.28□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 CHST12Q9NRB3 414 aa8.28□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 FAM105AQ9NUU6 356 aa8.28□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 DACT1Q9NYF0 836 aa8.28□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 GDE1Q9NZC3 331 aa8.28□□□□□ -1.08
C9orf135-204ENST00000495399 COL6A6A6NMZ7 2263 aa8.27□□□□□ -1.09
C9orf135-204ENST00000495399 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa8.27□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms