RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 PCDHB8Q9UN66 801 aa21.95■■□□□ 1.1
ACTB-212ENST00000484841 ARHGEF37A1IGU5 675 aa21.94■■□□□ 1.1
ACTB-212ENST00000484841 ZNF197O14709 1029 aa21.94■■□□□ 1.1
ACTB-212ENST00000484841 PLCG1P19174 1290 aa21.94■■□□□ 1.1
ACTB-212ENST00000484841 SPAG1Q07617 926 aa21.94■■□□□ 1.1
ACTB-212ENST00000484841 MCM6Q14566 821 aa21.94■■□□□ 1.1
ACTB-212ENST00000484841 KARSQ15046 597 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
ACTB-212ENST00000484841 CYP4A22Q5TCH4 519 aa21.94■■□□□ 1.1
ACTB-212ENST00000484841 DSTYKQ6XUX3 929 aa21.94■■□□□ 1.1
ACTB-212ENST00000484841 USP37Q86T82 979 aa21.94■■□□□ 1.1
ACTB-212ENST00000484841 NPAS3Q8IXF0 933 aa21.94■■□□□ 1.1
ACTB-212ENST00000484841 TCEAL8Q8IYN2 117 aa21.94■■□□□ 1.1
ACTB-212ENST00000484841 RAD54LQ92698 747 aa21.94■■□□□ 1.1
ACTB-212ENST00000484841 FAM212AQ96EL1 285 aa21.94■■□□□ 1.1
ACTB-212ENST00000484841 MCRS1Q96EZ8 462 aa21.94■■□□□ 1.1
ACTB-212ENST00000484841 TSPAN18Q96SJ8 248 aa21.94■■□□□ 1.1
ACTB-212ENST00000484841 KXD1Q9BQD3 176 aa21.94■■□□□ 1.1
ACTB-212ENST00000484841 CORO1BQ9BR76 489 aa21.94■■□□□ 1.1
ACTB-212ENST00000484841 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
ACTB-212ENST00000484841 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
ACTB-212ENST00000484841 GDE1Q9NZC3 331 aa21.94■■□□□ 1.1
ACTB-212ENST00000484841 CCDC39Q9UFE4 941 aa21.94■■□□□ 1.1
ACTB-212ENST00000484841 OGTO15294 1046 aa21.93■■□□□ 1.1
ACTB-212ENST00000484841 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
ACTB-212ENST00000484841 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
ACTB-212ENST00000484841 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
ACTB-212ENST00000484841 FRMD5Q7Z6J6 570 aa21.93■■□□□ 1.1
ACTB-212ENST00000484841 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
ACTB-212ENST00000484841 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
ACTB-212ENST00000484841 MSTO1Q9BUK6 570 aa21.93■■□□□ 1.1
ACTB-212ENST00000484841 MAFFQ9ULX9 164 aa21.93■■□□□ 1.1
ACTB-212ENST00000484841 INSL5Q9Y5Q6 135 aa21.93■■□□□ 1.1
ACTB-212ENST00000484841 TTC26A0AVF1 554 aa21.92■■□□□ 1.1
ACTB-212ENST00000484841 TBC1D4O60343 1298 aa21.92■■□□□ 1.1
ACTB-212ENST00000484841 CYP3A5P20815 502 aa21.92■■□□□ 1.1
ACTB-212ENST00000484841 LRPAP1P30533 357 aa21.92■■□□□ 1.1
ACTB-212ENST00000484841 TXLNAP40222 546 aa21.92■■□□□ 1.1
ACTB-212ENST00000484841 TNFSF9P41273 254 aa21.92■■□□□ 1.1
ACTB-212ENST00000484841 ADCY1Q08828 1119 aa21.92■■□□□ 1.1
ACTB-212ENST00000484841 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
ACTB-212ENST00000484841 CD302Q8IX05 232 aa21.92■■□□□ 1.1
ACTB-212ENST00000484841 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
ACTB-212ENST00000484841 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
ACTB-212ENST00000484841 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
ACTB-212ENST00000484841 MIA3Q5JRA6 1907 aa21.92■■□□□ 1.1
ACTB-212ENST00000484841 NOTCH4Q99466 2003 aa21.91■■□□□ 1.1
ACTB-212ENST00000484841 LACTBL1A8MY62 500 aa21.91■■□□□ 1.1
ACTB-212ENST00000484841 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
ACTB-212ENST00000484841 DCNP07585 359 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
ACTB-212ENST00000484841 STARD6P59095 220 aa21.91■■□□□ 1.1
ACTB-212ENST00000484841 PRKCQQ04759 706 aa21.91■■□□□ 1.1
ACTB-212ENST00000484841 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
ACTB-212ENST00000484841 BEST2Q8NFU1 509 aa21.91■■□□□ 1.1
ACTB-212ENST00000484841 KCNN1Q92952 543 aa21.91■■□□□ 1.1
ACTB-212ENST00000484841 CCSER1Q9C0I3 900 aa21.91■■□□□ 1.1
ACTB-212ENST00000484841 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa21.91■■□□□ 1.1
ACTB-212ENST00000484841 PIEZO1Q92508 2521 aa21.91■■□□□ 1.1
ACTB-212ENST00000484841 PRR23AA6NEV1 266 aa21.9■■□□□ 1.1
ACTB-212ENST00000484841 ECI2O75521 394 aa21.9■■□□□ 1.1
ACTB-212ENST00000484841 PIGRP01833 764 aa21.9■■□□□ 1.1
ACTB-212ENST00000484841 DDIT3P35638 169 aa21.9■■□□□ 1.1
ACTB-212ENST00000484841 ZNF131P52739 623 aa21.9■■□□□ 1.1
ACTB-212ENST00000484841 SLC44A4Q53GD3 710 aa21.9■■□□□ 1.1
ACTB-212ENST00000484841 LEMD2Q8NC56 503 aa21.9■■□□□ 1.1
ACTB-212ENST00000484841 PJA1Q8NG27 643 aa21.9■■□□□ 1.1
ACTB-212ENST00000484841 HAPLN2Q9GZV7 340 aa21.9■■□□□ 1.1
ACTB-212ENST00000484841 KANSL1LA0AUZ9 987 aa21.89■■□□□ 1.09
ACTB-212ENST00000484841 M0QZQ0 153 aa21.89■■□□□ 1.09
ACTB-212ENST00000484841 SEC24AO95486 1093 aa21.89■■□□□ 1.09
ACTB-212ENST00000484841 GRIN1Q05586 938 aa21.89■■□□□ 1.09
ACTB-212ENST00000484841 TWF1Q12792 350 aa21.89■■□□□ 1.09
ACTB-212ENST00000484841 PLD1Q13393 1074 aa21.89■■□□□ 1.09
ACTB-212ENST00000484841 SLC5A9Q2M3M2 681 aa21.89■■□□□ 1.09
ACTB-212ENST00000484841 SLFN12LQ6IEE8 588 aa21.89■■□□□ 1.09
ACTB-212ENST00000484841 ASCL5Q7RTU5 278 aa21.89■■□□□ 1.09
ACTB-212ENST00000484841 KCNG4Q8TDN1 519 aa21.89■■□□□ 1.09
ACTB-212ENST00000484841 BCO2Q9BYV7 579 aa21.89■■□□□ 1.09
ACTB-212ENST00000484841 FOXQ1Q9C009 403 aa21.89■■□□□ 1.09
ACTB-212ENST00000484841 ZFP14Q9HCL3 533 aa21.89■■□□□ 1.09
ACTB-212ENST00000484841 A0A0B4J269 797 aa21.88■■□□□ 1.09
ACTB-212ENST00000484841 OR6C75A6NL08 312 aa21.88■■□□□ 1.09
ACTB-212ENST00000484841 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
ACTB-212ENST00000484841 MICAL2O94851 1124 aa21.88■■□□□ 1.09
ACTB-212ENST00000484841 MYL4P12829 197 aa21.88■■□□□ 1.09
ACTB-212ENST00000484841 CEBPBP17676 345 aa21.88■■□□□ 1.09
ACTB-212ENST00000484841 PAX3P23760 479 aa21.88■■□□□ 1.09
ACTB-212ENST00000484841 NMT1P30419 496 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
ACTB-212ENST00000484841 GTF2BQ00403 316 aa21.88■■□□□ 1.09
ACTB-212ENST00000484841 CUL4AQ13619 759 aa21.88■■□□□ 1.09
ACTB-212ENST00000484841 UBXN2BQ14CS0 331 aa21.88■■□□□ 1.09
ACTB-212ENST00000484841 ZBTB6Q15916 424 aa21.88■■□□□ 1.09
ACTB-212ENST00000484841 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
ACTB-212ENST00000484841 ADALQ6DHV7 355 aa21.88■■□□□ 1.09
ACTB-212ENST00000484841 ARMCX5Q6P1M9 558 aa21.88■■□□□ 1.09
ACTB-212ENST00000484841 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
ACTB-212ENST00000484841 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa21.88■■□□□ 1.09
ACTB-212ENST00000484841 ELSPBP1Q96BH3 223 aa21.88■■□□□ 1.09
ACTB-212ENST00000484841 ASAH2Q9NR71 780 aa21.88■■□□□ 1.09
ACTB-212ENST00000484841 STK17AQ9UEE5 414 aa21.88■■□□□ 1.09
ACTB-212ENST00000484841 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms