RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470089.5

FBXO18-208, Transcript of F-box DNA helicase 1, human

TSL 5

Gene FBXO18, Length 979 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO18-208	ENST00000470089	RNF135	Q8IUD6	432 aa		31.79	■■■□□ 2.68
FBXO18-208	ENST00000470089	BEST2	Q8NFU1	509 aa		31.79	■■■□□ 2.68
FBXO18-208	ENST00000470089	SUSD3	Q96L08	255 aa		31.79	■■■□□ 2.68
FBXO18-208	ENST00000470089	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		31.79	■■■□□ 2.68
FBXO18-208	ENST00000470089	PLEKHA4	Q9H4M7	779 aa		31.79	■■■□□ 2.68
FBXO18-208	ENST00000470089	ASB7	Q9H672	318 aa		31.79	■■■□□ 2.68
FBXO18-208	ENST00000470089	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		31.79	■■■□□ 2.68
FBXO18-208	ENST00000470089	CCDC195	A0A1B0GUA6	201 aa		31.78	■■■□□ 2.68
FBXO18-208	ENST00000470089	PPEF2	O14830	753 aa		31.78	■■■□□ 2.68
FBXO18-208	ENST00000470089	GART	P22102	1010 aa		31.78	■■■□□ 2.68
FBXO18-208	ENST00000470089	HOXD13	P35453	343 aa		31.78	■■■□□ 2.68
FBXO18-208	ENST00000470089	NDUFA8	P51970	172 aa		31.78	■■■□□ 2.68
FBXO18-208	ENST00000470089	NUCB2	P80303	420 aa		31.78	■■■□□ 2.68
FBXO18-208	ENST00000470089	EHHADH	Q08426	723 aa		31.78	■■■□□ 2.68
FBXO18-208	ENST00000470089	VARS2	Q5ST30	1063 aa	Known RBP	31.78	■■■□□ 2.68
FBXO18-208	ENST00000470089	ARMCX5	Q6P1M9	558 aa		31.78	■■■□□ 2.68
FBXO18-208	ENST00000470089	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		31.78	■■■□□ 2.68
FBXO18-208	ENST00000470089	SYN3	O14994	580 aa		31.77	■■■□□ 2.68
FBXO18-208	ENST00000470089	EPM2AIP1	Q7L775	607 aa	Predicted RBP	31.77	■■■□□ 2.68
FBXO18-208	ENST00000470089	FSIP1	Q8NA03	581 aa		31.77	■■■□□ 2.68
FBXO18-208	ENST00000470089	CMAS	Q8NFW8	434 aa	Predicted RBP	31.77	■■■□□ 2.68
FBXO18-208	ENST00000470089	HDAC7	Q8WUI4	952 aa		31.77	■■■□□ 2.68
FBXO18-208	ENST00000470089	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		31.77	■■■□□ 2.68
FBXO18-208	ENST00000470089	DERA	Q9Y315	318 aa		31.77	■■■□□ 2.68
FBXO18-208	ENST00000470089	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	31.77	■■■□□ 2.68
FBXO18-208	ENST00000470089	PVALEF	A0A1B0GWK0	134 aa		31.76	■■■□□ 2.67
FBXO18-208	ENST00000470089	PI4K2B	G5E9Z4	385 aa		31.76	■■■□□ 2.67
FBXO18-208	ENST00000470089	EIF3D	O15371	548 aa	Known RBP eCLIP	31.76	■■■□□ 2.67
FBXO18-208	ENST00000470089	C1R	P00736	705 aa		31.76	■■■□□ 2.67
FBXO18-208	ENST00000470089	SYK	P43405	635 aa		31.76	■■■□□ 2.67
FBXO18-208	ENST00000470089	WNT7B	P56706	349 aa		31.76	■■■□□ 2.67
FBXO18-208	ENST00000470089	MUTYH	Q9UIF7	546 aa		31.76	■■■□□ 2.67
FBXO18-208	ENST00000470089	FBXW11	Q9UKB1	542 aa		31.76	■■■□□ 2.67
FBXO18-208	ENST00000470089	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		31.76	■■■□□ 2.67
FBXO18-208	ENST00000470089	RAB33A	Q14088	237 aa		31.75	■■■□□ 2.67
FBXO18-208	ENST00000470089	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		31.75	■■■□□ 2.67
FBXO18-208	ENST00000470089	NELFCD	Q8IXH7	590 aa		31.75	■■■□□ 2.67
FBXO18-208	ENST00000470089	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		31.75	■■■□□ 2.67
FBXO18-208	ENST00000470089	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		31.75	■■■□□ 2.67
FBXO18-208	ENST00000470089	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		31.75	■■■□□ 2.67
FBXO18-208	ENST00000470089	USP25	Q9UHP3	1055 aa		31.75	■■■□□ 2.67
FBXO18-208	ENST00000470089	PCDHB8	Q9UN66	801 aa		31.75	■■■□□ 2.67
FBXO18-208	ENST00000470089	C2CD2	Q9Y426	696 aa		31.75	■■■□□ 2.67
FBXO18-208	ENST00000470089	SCN1A	P35498	2009 aa		31.75	■■■□□ 2.67
FBXO18-208	ENST00000470089	FAM237A	A0A1B0GTK4	181 aa		31.74	■■■□□ 2.67
FBXO18-208	ENST00000470089	KLRC4	O43908	158 aa		31.74	■■■□□ 2.67
FBXO18-208	ENST00000470089	IL18RAP	O95256	599 aa		31.74	■■■□□ 2.67
FBXO18-208	ENST00000470089	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	31.74	■■■□□ 2.67
FBXO18-208	ENST00000470089	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	31.74	■■■□□ 2.67
FBXO18-208	ENST00000470089	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		31.74	■■■□□ 2.67
FBXO18-208	ENST00000470089	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		31.74	■■■□□ 2.67
FBXO18-208	ENST00000470089	SCFD1	Q8WVM8	642 aa		31.74	■■■□□ 2.67
FBXO18-208	ENST00000470089	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	31.74	■■■□□ 2.67
FBXO18-208	ENST00000470089	ZNF707	Q96C28	371 aa	Predicted RBP	31.74	■■■□□ 2.67
FBXO18-208	ENST00000470089	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	31.74	■■■□□ 2.67
FBXO18-208	ENST00000470089	NR2E1	Q9Y466	385 aa		31.74	■■■□□ 2.67
FBXO18-208	ENST00000470089	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	31.74	■■■□□ 2.67
FBXO18-208	ENST00000470089		A0A1W2PQ27	194 aa		31.73	■■■□□ 2.67
FBXO18-208	ENST00000470089		A0A1W2PQ64	194 aa		31.73	■■■□□ 2.67
FBXO18-208	ENST00000470089		A0A1W2PQD8	194 aa		31.73	■■■□□ 2.67
FBXO18-208	ENST00000470089	C2CD4D	B7Z1M9	353 aa		31.73	■■■□□ 2.67
FBXO18-208	ENST00000470089	DCX	O43602	365 aa		31.73	■■■□□ 2.67
FBXO18-208	ENST00000470089	EXTL3	O43909	919 aa		31.73	■■■□□ 2.67
FBXO18-208	ENST00000470089	ZMYND10	O75800	440 aa		31.73	■■■□□ 2.67
FBXO18-208	ENST00000470089	ARPP19	P56211	112 aa		31.73	■■■□□ 2.67
FBXO18-208	ENST00000470089	LIN9	Q5TKA1	542 aa		31.73	■■■□□ 2.67
FBXO18-208	ENST00000470089	APPL2	Q8NEU8	664 aa		31.73	■■■□□ 2.67
FBXO18-208	ENST00000470089	ZDHHC7	Q9NXF8	308 aa		31.73	■■■□□ 2.67
FBXO18-208	ENST00000470089	DPP3	Q9NY33	737 aa		31.73	■■■□□ 2.67
FBXO18-208	ENST00000470089		H7C4K7	107 aa		31.72	■■■□□ 2.67
FBXO18-208	ENST00000470089	C8A	P07357	584 aa		31.72	■■■□□ 2.67
FBXO18-208	ENST00000470089	MRPL58	Q14197	206 aa	Known RBP	31.72	■■■□□ 2.67
FBXO18-208	ENST00000470089	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		31.72	■■■□□ 2.67
FBXO18-208	ENST00000470089	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		31.72	■■■□□ 2.67
FBXO18-208	ENST00000470089	GPD1L	Q8N335	351 aa		31.72	■■■□□ 2.67
FBXO18-208	ENST00000470089	PIDD1	Q9HB75	910 aa		31.72	■■■□□ 2.67
FBXO18-208	ENST00000470089	FBXL5	Q9UKA1	691 aa		31.72	■■■□□ 2.67
FBXO18-208	ENST00000470089	DOCK6	Q96HP0	2047 aa		31.71	■■■□□ 2.67
FBXO18-208	ENST00000470089		M0QZQ0	153 aa		31.71	■■■□□ 2.67
FBXO18-208	ENST00000470089	TGFB1I1	O43294	461 aa		31.71	■■■□□ 2.67
FBXO18-208	ENST00000470089	TBC1D4	O60343	1298 aa		31.71	■■■□□ 2.67
FBXO18-208	ENST00000470089	ALAD	P13716	330 aa		31.71	■■■□□ 2.67
FBXO18-208	ENST00000470089	AARS	P49588	968 aa	Known RBP eCLIP	31.71	■■■□□ 2.67	4e-6	■■□□□ 11.6
FBXO18-208	ENST00000470089	ROR1	Q01973	937 aa		31.71	■■■□□ 2.67
FBXO18-208	ENST00000470089	CCDC149	Q6ZUS6	474 aa		31.71	■■■□□ 2.67
FBXO18-208	ENST00000470089	FAM84A	Q96KN4	292 aa		31.71	■■■□□ 2.67
FBXO18-208	ENST00000470089	PRKD2	Q9BZL6	878 aa		31.71	■■■□□ 2.67
FBXO18-208	ENST00000470089	EXOC1	Q9NV70	894 aa		31.71	■■■□□ 2.67
FBXO18-208	ENST00000470089	UBE4B	O95155	1302 aa		31.71	■■■□□ 2.67
FBXO18-208	ENST00000470089	ANO9	A1A5B4	782 aa		31.7	■■■□□ 2.67
FBXO18-208	ENST00000470089	FAM86C2P	A6NEL3	165 aa		31.7	■■■□□ 2.67
FBXO18-208	ENST00000470089	PIR	O00625	290 aa		31.7	■■■□□ 2.67
FBXO18-208	ENST00000470089	SPTLC1	O15269	473 aa		31.7	■■■□□ 2.67
FBXO18-208	ENST00000470089	PRR29	P0C7W0	189 aa		31.7	■■■□□ 2.67
FBXO18-208	ENST00000470089	LILRA4	P59901	499 aa		31.7	■■■□□ 2.67
FBXO18-208	ENST00000470089	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		31.7	■■■□□ 2.67
FBXO18-208	ENST00000470089	PPM1L	Q5SGD2	360 aa		31.7	■■■□□ 2.67
FBXO18-208	ENST00000470089	SLC8B1	Q6J4K2	584 aa		31.7	■■■□□ 2.67
FBXO18-208	ENST00000470089	ZNF280D	Q6N043	979 aa		31.7	■■■□□ 2.67
FBXO18-208	ENST00000470089	TDRD5	Q8NAT2	981 aa	Known RBP	31.7	■■■□□ 2.67

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