RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452765.6

SH3BP2-204, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-204ENST00000452765 KCNJ6P48051 423 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 AP3M2P53677 418 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 KYAT1Q16773 422 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 SHC3Q92529 594 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 NBNO60934 754 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 CCDC175P0C221 793 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 KRT5P13647 590 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 CD58P19256 250 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 RAP1GAPP47736 663 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 TLE2Q04725 743 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 ZNF699Q32M78 642 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 LRRC8DQ7L1W4 858 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 PALB2Q86YC2 1186 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 MIOSQ9NXC5 875 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 MYO6Q9UM54 1294 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 DUSP10Q9Y6W6 482 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 MLH1P40692 756 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 CDH8P55286 799 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 CCL23P55773 120 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 CUL2Q13617 745 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 DSC3Q14574 896 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 WDR72Q3MJ13 1102 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 TAF3Q5VWG9 929 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 FAM71AQ8IYT1 594 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 RABGGTAQ92696 567 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 GAD1Q99259 594 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 CNTN3Q9P232 1028 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa22.45■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 PTGESO14684 152 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP2-204ENST00000452765 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
SH3BP2-204ENST00000452765 FAAP100Q0VG06 881 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP2-204ENST00000452765 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
SH3BP2-204ENST00000452765 ZBTB6Q15916 424 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP2-204ENST00000452765 TCTN1Q2MV58 587 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP2-204ENST00000452765 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP2-204ENST00000452765 AGMOQ6ZNB7 445 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP2-204ENST00000452765 LACRTQ9GZZ8 138 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP2-204ENST00000452765 C2CD2Q9Y426 696 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP2-204ENST00000452765 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP22.45■■□□□ 1.18
SH3BP2-204ENST00000452765 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
SH3BP2-204ENST00000452765 FERP16591 822 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP2-204ENST00000452765 ACO1P21399 889 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
SH3BP2-204ENST00000452765 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
SH3BP2-204ENST00000452765 GJA8P48165 433 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP2-204ENST00000452765 GCNT1Q02742 428 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP2-204ENST00000452765 ZNF394Q53GI3 561 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP2-204ENST00000452765 GLYCTKQ8IVS8 523 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP2-204ENST00000452765 CCDC170Q8IYT3 715 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP2-204ENST00000452765 GSTCDQ8NEC7 633 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP2-204ENST00000452765 LINC01599Q8WXQ3 324 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP2-204ENST00000452765 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP2-204ENST00000452765 CHST12Q9NRB3 414 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP2-204ENST00000452765 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP2-204ENST00000452765 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
SH3BP2-204ENST00000452765 SELPP16109 830 aa22.44■■□□□ 1.18
SH3BP2-204ENST00000452765 PRKCIP41743 596 aa22.44■■□□□ 1.18
SH3BP2-204ENST00000452765 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
SH3BP2-204ENST00000452765 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
SH3BP2-204ENST00000452765 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
SH3BP2-204ENST00000452765 PACSIN1Q9BY11 444 aa22.44■■□□□ 1.18
SH3BP2-204ENST00000452765 IMPG2Q9BZV3 1241 aa22.44■■□□□ 1.18
SH3BP2-204ENST00000452765 TMCO5BA8MYB1 307 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP2-204ENST00000452765 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP22.43■■□□□ 1.181e-6■■■■■ 33.2
SH3BP2-204ENST00000452765 ITGA4P13612 1032 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP2-204ENST00000452765 RFX1P22670 979 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP2-204ENST00000452765 ORC1Q13415 861 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP2-204ENST00000452765 TMEM270Q6UE05 265 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP2-204ENST00000452765 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP2-204ENST00000452765 COL6A1P12109 1028 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP2-204ENST00000452765 CYP2C18P33260 490 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP2-204ENST00000452765 ASPAP45381 313 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP2-204ENST00000452765 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
SH3BP2-204ENST00000452765 HPDLQ96IR7 371 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP2-204ENST00000452765 SDCBP2Q9H190 292 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP2-204ENST00000452765 SMYD3Q9H7B4 428 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP2-204ENST00000452765 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
SH3BP2-204ENST00000452765 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa22.43■■□□□ 1.18
SH3BP2-204ENST00000452765 ARHGAP25P42331 645 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP2-204ENST00000452765 DBF4BQ8NFT6 615 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP2-204ENST00000452765 CAGE1Q8TC20 777 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP2-204ENST00000452765 KCND1Q9NSA2 647 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP2-204ENST00000452765 TAS2R14Q9NYV8 317 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP2-204ENST00000452765 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP2-204ENST00000452765 ZSCAN12O43309 604 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP2-204ENST00000452765 XKR4Q5GH76 650 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP2-204ENST00000452765 CD302Q8IX05 232 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP2-204ENST00000452765 SYT11Q9BT88 431 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP2-204ENST00000452765 WNT8AQ9H1J5 351 aa22.42■■□□□ 1.18
SH3BP2-204ENST00000452765 A0A0U1RQF3 1178 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP2-204ENST00000452765 ARL5CA6NH57 179 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP2-204ENST00000452765 CAND2O75155 1236 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP2-204ENST00000452765 CFHP08603 1231 aa22.41■■□□□ 1.18
SH3BP2-204ENST00000452765 CHRNB2P17787 502 aa22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.8 ms