RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403441.1

PRAME-204, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 567 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-204ENST00000403441 HIP1RO75146 1068 aa13.49□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 MICAL2O94851 1124 aa13.49□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 KCNE1P15382 129 aa13.49□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 SDHBP21912 280 aa13.49□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 PPP2R5DQ14738 602 aa13.49□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 ECM1Q16610 540 aa13.49□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 CTXN3Q4LDR2 81 aa13.49□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 XKR4Q5GH76 650 aa13.49□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 CYP4A22Q5TCH4 519 aa13.49□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 TPGS2Q68CL5 300 aa13.49□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 TANGO2Q6ICL3 276 aa13.49□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 IQCEQ6IPM2 695 aa13.49□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 MPZL3Q6UWV2 235 aa13.49□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 ALKAL1Q6UXT8 129 aa13.49□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa13.49□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 EPC1Q9H2F5 836 aa13.49□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 TMEM134Q9H6X4 195 aa13.49□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 BRD9Q9H8M2 597 aa13.49□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 PTPRHQ9HD43 1115 aa13.49□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 DLL3Q9NYJ7 618 aa13.49□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 CNTN3Q9P232 1028 aa13.49□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa13.49□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 DNAH14Q0VDD8 3507 aa13.49□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 HARSP12081 509 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 SYT1P21579 422 aa13.48□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 FCARP24071 287 aa13.48□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 MCM4P33991 863 aa13.48□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 STRN3Q13033 797 aa13.48□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 GRM2Q14416 872 aa13.48□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 FAM78AQ5JUQ0 283 aa13.48□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 PRSS36Q5K4E3 855 aa13.48□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 KRT79Q5XKE5 535 aa13.48□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 MCTP1Q6DN14 999 aa13.48□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 ZNF280DQ6N043 979 aa13.48□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 LEMD2Q8NC56 503 aa13.48□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 ZBTB44Q8NCP5 570 aa13.48□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 APPL2Q8NEU8 664 aa13.48□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 IRF7Q92985 503 aa13.48□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 IER2Q9BTL4 223 aa13.48□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 C17orf75Q9HAS0 396 aa13.48□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa13.48□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 FBXL5Q9UKA1 691 aa13.48□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 MAFFQ9ULX9 164 aa13.48□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 TRIP11Q15643 1979 aa13.48□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 TBC1D4O60343 1298 aa13.47□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 LILRB5O75023 590 aa13.47□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 SEC24AO95486 1093 aa13.47□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 CPB1P15086 417 aa13.47□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 NRLP54845 237 aa13.47□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 LMNB2Q03252 620 aa13.47□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 MTAPQ13126 283 aa13.47□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 RESTQ13127 1097 aa13.47□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP13.47□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 HYIQ5T013 277 aa13.47□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 DAW1Q8N136 415 aa13.47□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 NELL1Q92832 810 aa13.47□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 SMARCD2Q92925 531 aa13.47□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 TCEAL4Q96EI5 215 aa13.47□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 SUSD3Q96L08 255 aa13.47□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 ASB16Q96NS5 453 aa13.47□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 TIPINQ9BVW5 301 aa13.47□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 ASAH2Q9NR71 780 aa13.47□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 CITO14578 2027 aa13.46□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 E9PMD0 336 aa13.46□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 SLC16A4O15374 487 aa13.46□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 TOM1L1O75674 476 aa13.46□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 PSMC3P17980 439 aa13.46□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 PROZP22891 400 aa13.46□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 TWF1Q12792 350 aa13.46□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 TSSK4Q6SA08 328 aa13.46□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 TAS1R3Q7RTX0 852 aa13.46□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 KCTD17Q8N5Z5 321 aa13.46□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa13.46□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 RUSC1Q9BVN2 902 aa13.46□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 CHRDQ9H2X0 955 aa13.46□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa13.46□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 TRPV5Q9NQA5 729 aa13.46□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 KCNG1Q9UIX4 513 aa13.46□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 GMEB2Q9UKD1 530 aa13.46□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 RAB23Q9ULC3 237 aa13.46□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 PCDHB8Q9UN66 801 aa13.46□□□□□ -0.25
PRAME-204ENST00000403441 MTMR6Q9Y217 621 aa13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms