RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 H0Y626 953 aa8.66□□□□□ -1.02
PGGT1B-201ENST00000296642 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PGGT1B-201ENST00000296642 ADAM12O43184 909 aa8.66□□□□□ -1.02
PGGT1B-201ENST00000296642 RECQL4O94761 1208 aa8.66□□□□□ -1.02
PGGT1B-201ENST00000296642 ABLIM3O94929 683 aa8.66□□□□□ -1.02
PGGT1B-201ENST00000296642 TRIM16O95361 564 aa8.66□□□□□ -1.02
PGGT1B-201ENST00000296642 CAVIN2O95810 425 aa8.66□□□□□ -1.02
PGGT1B-201ENST00000296642 IFNAR1P17181 557 aa8.66□□□□□ -1.02
PGGT1B-201ENST00000296642 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PGGT1B-201ENST00000296642 CTHP32929 405 aa8.66□□□□□ -1.02
PGGT1B-201ENST00000296642 ARL2P36404 184 aa8.66□□□□□ -1.02
PGGT1B-201ENST00000296642 DPP6P42658 865 aa8.66□□□□□ -1.02
PGGT1B-201ENST00000296642 EPHB3P54753 998 aa8.66□□□□□ -1.02
PGGT1B-201ENST00000296642 CREB5Q02930 508 aa8.66□□□□□ -1.02
PGGT1B-201ENST00000296642 CAPSQ13938 189 aa8.66□□□□□ -1.02
PGGT1B-201ENST00000296642 PPP2R5AQ15172 486 aa8.66□□□□□ -1.02
PGGT1B-201ENST00000296642 AMHR2Q16671 573 aa8.66□□□□□ -1.02
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM187BQ17R55 369 aa8.66□□□□□ -1.02
PGGT1B-201ENST00000296642 TSGA10IPQ3SY00 556 aa8.66□□□□□ -1.02
PGGT1B-201ENST00000296642 PLA2G2CQ5R387 149 aa8.66□□□□□ -1.02
PGGT1B-201ENST00000296642 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa8.66□□□□□ -1.02
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF280DQ6N043 979 aa8.66□□□□□ -1.02
PGGT1B-201ENST00000296642 NEK8Q86SG6 692 aa8.66□□□□□ -1.02
PGGT1B-201ENST00000296642 GCNAQ96QF7 691 aa8.66□□□□□ -1.02
PGGT1B-201ENST00000296642 PAAF1Q9BRP4 392 aa8.66□□□□□ -1.02
PGGT1B-201ENST00000296642 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa8.66□□□□□ -1.02
PGGT1B-201ENST00000296642 OBP2AQ9NY56 170 aa8.66□□□□□ -1.02
PGGT1B-201ENST00000296642 SNTG2Q9NY99 539 aa8.66□□□□□ -1.02
PGGT1B-201ENST00000296642 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PGGT1B-201ENST00000296642 COL4A3Q01955 1670 aa8.65□□□□□ -1.02
PGGT1B-201ENST00000296642 F5P12259 2224 aa8.65□□□□□ -1.02
PGGT1B-201ENST00000296642 NID2Q14112 1375 aa8.65□□□□□ -1.02
PGGT1B-201ENST00000296642 CHD6Q8TD26 2715 aa8.65□□□□□ -1.02
PGGT1B-201ENST00000296642 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa8.65□□□□□ -1.02
PGGT1B-201ENST00000296642 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa8.65□□□□□ -1.02
PGGT1B-201ENST00000296642 C4orf47A7E2U8 309 aa8.65□□□□□ -1.02
PGGT1B-201ENST00000296642 EML1O00423 815 aa8.65□□□□□ -1.02
PGGT1B-201ENST00000296642 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
PGGT1B-201ENST00000296642 DEXIO95424 95 aa8.65□□□□□ -1.02
PGGT1B-201ENST00000296642 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP8.65□□□□□ -1.02
PGGT1B-201ENST00000296642 CPB1P15086 417 aa8.65□□□□□ -1.02
PGGT1B-201ENST00000296642 TKTP29401 623 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
PGGT1B-201ENST00000296642 VIPR2P41587 438 aa8.65□□□□□ -1.02
PGGT1B-201ENST00000296642 ALDH1A3P47895 512 aa8.65□□□□□ -1.02
PGGT1B-201ENST00000296642 CYP4A11Q02928 519 aa8.65□□□□□ -1.02
PGGT1B-201ENST00000296642 RING1Q06587 406 aa8.65□□□□□ -1.02
PGGT1B-201ENST00000296642 FCHO2Q0JRZ9 810 aa8.65□□□□□ -1.02
PGGT1B-201ENST00000296642 TWF1Q12792 350 aa8.65□□□□□ -1.02
PGGT1B-201ENST00000296642 LMAN2Q12907 356 aa8.65□□□□□ -1.02
PGGT1B-201ENST00000296642 GAS6Q14393 721 aa8.65□□□□□ -1.02
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC6Q16204 474 aa8.65□□□□□ -1.02
PGGT1B-201ENST00000296642 FBXO43Q4G163 708 aa8.65□□□□□ -1.02
PGGT1B-201ENST00000296642 CTXN3Q4LDR2 81 aa8.65□□□□□ -1.02
PGGT1B-201ENST00000296642 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa8.65□□□□□ -1.02
PGGT1B-201ENST00000296642 Q6ZUG5 572 aa8.65□□□□□ -1.02
PGGT1B-201ENST00000296642 ITIH5Q86UX2 942 aa8.65□□□□□ -1.02
PGGT1B-201ENST00000296642 KBTBD6Q86V97 674 aa8.65□□□□□ -1.02
PGGT1B-201ENST00000296642 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
PGGT1B-201ENST00000296642 DAGLBQ8NCG7 672 aa8.65□□□□□ -1.02
PGGT1B-201ENST00000296642 BRF1Q92994 677 aa8.65□□□□□ -1.02
PGGT1B-201ENST00000296642 TCEAL4Q96EI5 215 aa8.65□□□□□ -1.02
PGGT1B-201ENST00000296642 DYDC2Q96IM9 177 aa8.65□□□□□ -1.02
PGGT1B-201ENST00000296642 TCEANC2Q96MN5 208 aa8.65□□□□□ -1.02
PGGT1B-201ENST00000296642 NACC1Q96RE7 527 aa8.65□□□□□ -1.02
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM209Q96SK2 561 aa8.65□□□□□ -1.02
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
PGGT1B-201ENST00000296642 SCNM1Q9BWG6 230 aa8.65□□□□□ -1.02
PGGT1B-201ENST00000296642 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
PGGT1B-201ENST00000296642 KCNMB3Q9NPA1 279 aa8.65□□□□□ -1.02
PGGT1B-201ENST00000296642 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
PGGT1B-201ENST00000296642 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
PGGT1B-201ENST00000296642 VAV3Q9UKW4 847 aa8.65□□□□□ -1.02
PGGT1B-201ENST00000296642 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa8.65□□□□□ -1.02
PGGT1B-201ENST00000296642 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
PGGT1B-201ENST00000296642 DOCK6Q96HP0 2047 aa8.64□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa8.64□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 FRYLO94915 3013 aa8.64□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 SHISA7A6NL88 538 aa8.64□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 PTGESO14684 152 aa8.64□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 B4GALT5O43286 388 aa8.64□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 LYPLA2O95372 231 aa8.64□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 GLRA2P23416 452 aa8.64□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 PSMA5P28066 241 aa8.64□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 GBP1P32455 592 aa8.64□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 RPL9P32969 192 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 CLCNKBP51801 687 aa8.64□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 EPHA5P54756 1037 aa8.64□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 CCINQ13939 588 aa8.64□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 PON2Q15165 354 aa8.64□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 TEAD2Q15562 447 aa8.64□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 UPP1Q16831 310 aa8.64□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 INF2Q27J81 1249 aa8.64□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa8.64□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 Q6ZS52 159 aa8.64□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 DEPTORQ8TB45 409 aa8.64□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 BPIFB1Q8TDL5 484 aa8.64□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 ASAP3Q8TDY4 903 aa8.64□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 ACDQ96AP0 544 aa8.64□□□□□ -1.03
PGGT1B-201ENST00000296642 FZD8Q9H461 694 aa8.64□□□□□ -1.03
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