RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294599.8

MEGF6-201, Transcript of multiple EGF like domains 6, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene MEGF6, Length 4,501 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEGF6-201ENST00000294599 YIPF3Q9GZM5 350 aa17.28■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 CD248Q9HCU0 757 aa17.28■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 GOLGA8RI6L899 631 aa17.28■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 RALAP11233 206 aa17.28■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 FAM161BQ96MY7 647 aa17.28■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 SEMA4AQ9H3S1 761 aa17.28■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 NEU2Q9Y3R4 380 aa17.28■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 SLC12A3P55017 1021 aa17.27■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 NOP14P78316 857 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 CYB5D1Q6P9G0 228 aa17.27■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 TMC3Q7Z5M5 1100 aa17.27■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 RHPN2Q8IUC4 686 aa17.27■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 SENP1Q9P0U3 644 aa17.27■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 KIF1AQ12756 1690 aa17.27■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 FAM47DPA6NHR8 397 aa17.27■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 NR3C2P08235 984 aa17.27■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 RARGP13631 454 aa17.27■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 KRT10P13645 584 aa17.27■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 ARL13BQ3SXY8 428 aa17.27■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 TRIML2Q8N7C3 387 aa17.27■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 FGD4Q96M96 766 aa17.27■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 DRC3Q9H069 523 aa17.27■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.36
MEGF6-201ENST00000294599 NID2Q14112 1375 aa17.27■□□□□ 0.35
MEGF6-201ENST00000294599 LPXNO60711 386 aa17.27■□□□□ 0.35
MEGF6-201ENST00000294599 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.35
MEGF6-201ENST00000294599 C3orf20Q8ND61 904 aa17.27■□□□□ 0.35
MEGF6-201ENST00000294599 CXorf38Q8TB03 319 aa17.27■□□□□ 0.35
MEGF6-201ENST00000294599 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP17.27■□□□□ 0.35
MEGF6-201ENST00000294599 CYP26B1Q9NR63 512 aa17.27■□□□□ 0.35
MEGF6-201ENST00000294599 EML1O00423 815 aa17.26■□□□□ 0.35
MEGF6-201ENST00000294599 MAGEA4P43358 317 aa17.26■□□□□ 0.35
MEGF6-201ENST00000294599 MTM1Q13496 603 aa17.26■□□□□ 0.35
MEGF6-201ENST00000294599 NUDCD3Q8IVD9 361 aa17.26■□□□□ 0.35
MEGF6-201ENST00000294599 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
MEGF6-201ENST00000294599 ANLNQ9NQW6 1124 aa17.26■□□□□ 0.35
MEGF6-201ENST00000294599 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP17.26■□□□□ 0.35
MEGF6-201ENST00000294599 APOEP02649 317 aa17.26■□□□□ 0.35
MEGF6-201ENST00000294599 RAD23BP54727 409 aa17.26■□□□□ 0.35
MEGF6-201ENST00000294599 PHEXP78562 749 aa17.26■□□□□ 0.35
MEGF6-201ENST00000294599 DUOXA2Q1HG44 320 aa17.26■□□□□ 0.35
MEGF6-201ENST00000294599 ACAD10Q6JQN1 1059 aa17.26■□□□□ 0.35
MEGF6-201ENST00000294599 FAM167AQ96KS9 214 aa17.26■□□□□ 0.35
MEGF6-201ENST00000294599 TMEM39BQ9GZU3 492 aa17.26■□□□□ 0.35
MEGF6-201ENST00000294599 CES2O00748 559 aa17.26■□□□□ 0.35
MEGF6-201ENST00000294599 MTMR2Q13614 643 aa17.26■□□□□ 0.35
MEGF6-201ENST00000294599 RSPH3Q86UC2 560 aa17.26■□□□□ 0.35
MEGF6-201ENST00000294599 ABI1Q8IZP0 508 aa17.26■□□□□ 0.35
MEGF6-201ENST00000294599 RNF139Q8WU17 664 aa17.26■□□□□ 0.35
MEGF6-201ENST00000294599 SENP7Q9BQF6 1050 aa17.26■□□□□ 0.35
MEGF6-201ENST00000294599 AP5M1Q9H0R1 490 aa17.26■□□□□ 0.35
MEGF6-201ENST00000294599 SLC24A3Q9HC58 644 aa17.26■□□□□ 0.35
MEGF6-201ENST00000294599 TMEM51Q9NW97 253 aa17.26■□□□□ 0.35
MEGF6-201ENST00000294599 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
MEGF6-201ENST00000294599 TBX20Q9UMR3 447 aa17.26■□□□□ 0.35
MEGF6-201ENST00000294599 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa17.26■□□□□ 0.35
MEGF6-201ENST00000294599 ZBTB39O15060 712 aa17.26■□□□□ 0.35
MEGF6-201ENST00000294599 S100BP04271 92 aaPredicted RBP17.26■□□□□ 0.35
MEGF6-201ENST00000294599 GZMAP12544 262 aa17.26■□□□□ 0.35
MEGF6-201ENST00000294599 CYP11B1P15538 503 aa17.26■□□□□ 0.35
MEGF6-201ENST00000294599 GPC3P51654 580 aa17.26■□□□□ 0.35
MEGF6-201ENST00000294599 NCOA4Q13772 614 aa17.26■□□□□ 0.35
MEGF6-201ENST00000294599 XKR3Q5GH77 459 aa17.26■□□□□ 0.35
MEGF6-201ENST00000294599 RCOR2Q8IZ40 523 aa17.26■□□□□ 0.35
MEGF6-201ENST00000294599 DIAPH2O60879 1101 aa17.25■□□□□ 0.35
MEGF6-201ENST00000294599 PMLP29590 882 aa17.25■□□□□ 0.35
MEGF6-201ENST00000294599 RPS6P62753 249 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
MEGF6-201ENST00000294599 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
MEGF6-201ENST00000294599 LCA5Q86VQ0 697 aa17.25■□□□□ 0.35
MEGF6-201ENST00000294599 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa17.25■□□□□ 0.35
MEGF6-201ENST00000294599 M0QYV0 167 aa17.25■□□□□ 0.35
MEGF6-201ENST00000294599 OSBPP22059 807 aa17.25■□□□□ 0.35
MEGF6-201ENST00000294599 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
MEGF6-201ENST00000294599 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP17.25■□□□□ 0.35
MEGF6-201ENST00000294599 EXT2Q93063 718 aa17.25■□□□□ 0.35
MEGF6-201ENST00000294599 ERP27Q96DN0 273 aa17.25■□□□□ 0.35
MEGF6-201ENST00000294599 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
MEGF6-201ENST00000294599 GANQ9H2C0 597 aa17.25■□□□□ 0.35
MEGF6-201ENST00000294599 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
MEGF6-201ENST00000294599 RPS6KA5O75582 802 aa17.25■□□□□ 0.35
MEGF6-201ENST00000294599 SLITRK3O94933 977 aa17.25■□□□□ 0.35
MEGF6-201ENST00000294599 SCTRP47872 440 aa17.25■□□□□ 0.35
MEGF6-201ENST00000294599 CDH6P55285 790 aa17.25■□□□□ 0.35
MEGF6-201ENST00000294599 KLC3Q6P597 504 aa17.25■□□□□ 0.35
MEGF6-201ENST00000294599 LPAR1Q92633 364 aa17.25■□□□□ 0.35
MEGF6-201ENST00000294599 FAM129AQ9BZQ8 928 aa17.25■□□□□ 0.35
MEGF6-201ENST00000294599 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP17.25■□□□□ 0.35
MEGF6-201ENST00000294599 ACAD9Q9H845 621 aa17.25■□□□□ 0.35
MEGF6-201ENST00000294599 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
MEGF6-201ENST00000294599 FSCBQ5H9T9 825 aa17.24■□□□□ 0.35
MEGF6-201ENST00000294599 SERPINB12Q96P63 405 aa17.24■□□□□ 0.35
MEGF6-201ENST00000294599 MCEEQ96PE7 176 aa17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms