RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264645.11

CASC3-201, Transcript of CASC3, exon junction complex subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASC3, Length 4,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC3-201ENST00000264645 MAB21L3Q8N8X9 362 aa15.87■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 NRBF2Q96F24 287 aa15.87■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 KCNK16Q96T55 309 aa15.87■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 TMEM165Q9HC07 324 aa15.87■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 NMRK1Q9NWW6 199 aa15.87■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 AGAP1Q9UPQ3 857 aa15.87■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 FCHO1O14526 889 aa15.87■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 GNA15P30679 374 aa15.87■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 TRAPPC3LQ5T215 181 aa15.87■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 DAGLBQ8NCG7 672 aa15.87■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 TMEM35BQ8NCS4 154 aa15.87■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa15.87■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 IP6K2Q9UHH9 426 aa15.87■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 GINS2Q9Y248 185 aa15.87■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa15.87■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 FOXO6A8MYZ6 492 aa15.87■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 NEMP1O14524 444 aa15.87■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 SGPL1O95470 568 aa15.87■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 WEE2P0C1S8 567 aa15.87■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 SBK1Q52WX2 424 aa15.87■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 A6NJR5 290 aa15.86■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 PRPSAP2O60256 369 aa15.86■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 TLR2O60603 784 aa15.86■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 AKR1B1P15121 316 aa15.86■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 BGNP21810 368 aa15.86■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 IL1RL1Q01638 556 aa15.86■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 OCA2Q04671 838 aa15.86■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 SYDE2Q5VT97 1194 aa15.86■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 PCNX4Q63HM2 1172 aa15.86■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 RSPH3Q86UC2 560 aa15.86■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 SDCCAG3Q96C92 435 aa15.86■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 RMDN2Q96LZ7 410 aa15.86■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 SENP7Q9BQF6 1050 aa15.86■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 APPL1Q9UKG1 709 aa15.86■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 JCADQ9P266 1359 aa15.86■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 TRIM49D1C9J1S8 452 aa15.86■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 SNX16P57768 344 aa15.86■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 STX1BP61266 288 aa15.86■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 MCL1Q07820 350 aa15.86■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 RNF43Q68DV7 783 aa15.86■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 KLC3Q6P597 504 aa15.86■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 CLEC4GQ6UXB4 293 aa15.86■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 HAUS6Q7Z4H7 955 aa15.86■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 NDUFAF2Q8N183 169 aa15.86■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 TTYH3Q9C0H2 523 aa15.86■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 PGM3O95394 542 aa15.86■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 RASA1P20936 1047 aa15.86■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 ADRA1DP25100 572 aa15.86■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 TYK2P29597 1187 aa15.86■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 CASP2P42575 452 aa15.86■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 ALCAMQ13740 583 aa15.86■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 SPDYCQ5MJ68 293 aa15.86■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP15.86■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 PWWP2AQ96N64 755 aa15.86■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 CATSPER2Q96P56 530 aa15.86■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa15.86■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 RUSC1Q9BVN2 902 aa15.86■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 FAM96AQ9H5X1 160 aa15.86■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 MED24O75448 989 aa15.85■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 PRELPP51888 382 aa15.85■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 COPAP53621 1224 aa15.85■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 KCTD21Q4G0X4 260 aa15.85■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 PRELID2Q8N945 189 aa15.85■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa15.85■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 MROH1Q8NDA8 1641 aa15.85■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 SP100P23497 879 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 MARCKSL1P49006 195 aa15.85■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 AQP5P55064 265 aa15.85■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 CATSPER1Q8NEC5 780 aa15.85■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 TCP10LQ8TDR4 215 aa15.85■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 HDAC11Q96DB2 347 aa15.85■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 NGLY1Q96IV0 654 aa15.85■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 LXNQ9BS40 222 aa15.85■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 GALNT8Q9NY28 637 aa15.85■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 BTBD7Q9P203 1132 aa15.85■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 DENND3A2RUS2 1198 aa15.85■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP15.85■□□□□ 0.132e-9■■■□□ 17.9
CASC3-201ENST00000264645 APRTP07741 180 aa15.85■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 HGSNATQ68CP4 663 aa15.85■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 OR6B2Q6IFH4 312 aa15.85■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 PPP1R18Q6NYC8 613 aa15.85■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 TMPRSS6Q8IU80 811 aa15.85■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 RNF169Q8NCN4 708 aa15.85■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 RNF34Q969K3 372 aa15.85■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 LRRC4BQ9NT99 713 aa15.85■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 CCPG1Q9ULG6 757 aa15.85■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 DGKIO75912 1065 aa15.84■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 TNNC2P02585 160 aa15.84■□□□□ 0.13
CASC3-201ENST00000264645 YARSP54577 528 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.4 ms