RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 PADI3Q9ULW8 664 aa28.24■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 PLA2G4BP0C869 781 aa28.23■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 CYP11B2P19099 503 aa28.23■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 ARL2P36404 184 aa28.23■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 MDH1P40925 334 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC12A3P55017 1021 aa28.23■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 RPS6KA1Q15418 735 aa28.23■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM102BQ5T8I3 360 aa28.23■■■□□ 2.11
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CAPNS1-201ENST00000246533 BSNDQ8WZ55 320 aa28.23■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 IFT122Q9HBG6 1241 aa28.23■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 GRXCR1A8MXD5 290 aa28.22■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 GLRA2P23416 452 aa28.22■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 SKIDA1Q1XH10 827 aa28.22■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa28.22■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM228AQ86W67 206 aa28.22■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 HERVK_113Q902F9 699 aa28.22■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 SCLT1Q96NL6 688 aa28.22■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 MINDY3Q9H8M7 445 aa28.22■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 CHD9Q3L8U1 2897 aa28.22■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 ZBBXA8MT70 800 aa28.22■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC188H7C350 402 aa28.22■■■□□ 2.11
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CAPNS1-201ENST00000246533 FAM153BP0C7A2 387 aa28.22■■■□□ 2.11
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CAPNS1-201ENST00000246533 BIRC3Q13489 604 aa28.22■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 MTMR3Q13615 1198 aa28.22■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM153CQ494X1 144 aa28.22■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 ARSHQ5FYA8 562 aa28.22■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 RASIP1Q5U651 963 aa28.22■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 C1orf186Q6ZWK4 172 aa28.22■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM153AQ9UHL3 310 aa28.22■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 CHD7Q9P2D1 2997 aa28.21■■■□□ 2.11
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CAPNS1-201ENST00000246533 RAPGEF1Q13905 1077 aa28.21■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 CNKSR3Q6P9H4 555 aa28.21■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP28.21■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 DAW1Q8N136 415 aa28.21■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 GANQ9H2C0 597 aa28.21■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 TMBIM4Q9HC24 238 aa28.21■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 SFI1A8K8P3 1242 aa28.2■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 FTCDO95954 541 aa28.2■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 PFKMP08237 780 aa28.2■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 CAPSQ13938 189 aa28.2■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 NAA35Q5VZE5 725 aa28.2■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 RNF149Q8NC42 400 aa28.2■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa28.2■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 MICAL3Q7RTP6 2002 aa28.2■■■□□ 2.1
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A087X0T9 212 aa28.2■■■□□ 2.1
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM107AO95990 144 aa28.2■■■□□ 2.1
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM228BP0C875 321 aa28.2■■■□□ 2.1
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CAPNS1-201ENST00000246533 PTPRSQ13332 1948 aa28.19■■■□□ 2.1
CAPNS1-201ENST00000246533 CETN3O15182 167 aa28.19■■■□□ 2.1
CAPNS1-201ENST00000246533 KCTD16Q68DU8 428 aa28.19■■■□□ 2.1
CAPNS1-201ENST00000246533 EXOC8Q8IYI6 725 aa28.19■■■□□ 2.1
CAPNS1-201ENST00000246533 SH2D3CQ8N5H7 860 aa28.19■■■□□ 2.1
CAPNS1-201ENST00000246533 LINC01599Q8WXQ3 324 aa28.19■■■□□ 2.1
CAPNS1-201ENST00000246533 SEPT8Q92599 483 aa28.19■■■□□ 2.1
CAPNS1-201ENST00000246533 FBXL5Q9UKA1 691 aa28.19■■■□□ 2.1
CAPNS1-201ENST00000246533 INTUQ9ULD6 942 aa28.19■■■□□ 2.1
CAPNS1-201ENST00000246533 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
CAPNS1-201ENST00000246533 RAD51CO43502 376 aa28.18■■■□□ 2.1
CAPNS1-201ENST00000246533 MGEA5O60502 916 aa28.18■■■□□ 2.1
CAPNS1-201ENST00000246533 KIF4AO95239 1232 aa28.18■■■□□ 2.1
CAPNS1-201ENST00000246533 MYZAPP0CAP1 466 aa28.18■■■□□ 2.1
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CAPNS1-201ENST00000246533 ATP1A2P50993 1020 aa28.18■■■□□ 2.1
CAPNS1-201ENST00000246533 MAPK7Q13164 816 aa28.18■■■□□ 2.1
CAPNS1-201ENST00000246533 FRMD5Q7Z6J6 570 aa28.18■■■□□ 2.1
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
CAPNS1-201ENST00000246533 KCTD10Q9H3F6 313 aa28.18■■■□□ 2.1
CAPNS1-201ENST00000246533 ERVK-5Q9HDB9 667 aa28.18■■■□□ 2.1
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CAPNS1-201ENST00000246533 GAS2O43903 313 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
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CAPNS1-201ENST00000246533 PLAAQ9Y263 795 aa28.18■■■□□ 2.1
CAPNS1-201ENST00000246533 FRMD3A2A2Y4 597 aa28.17■■■□□ 2.1
CAPNS1-201ENST00000246533 HIP1RO75146 1068 aa28.17■■■□□ 2.1
CAPNS1-201ENST00000246533 GUCY2FP51841 1108 aa28.17■■■□□ 2.1
CAPNS1-201ENST00000246533 IKBKEQ14164 716 aa28.17■■■□□ 2.1
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC91Q7Z6B0 441 aa28.17■■■□□ 2.1
CAPNS1-201ENST00000246533 NLRP14Q86W24 1093 aa28.17■■■□□ 2.1
CAPNS1-201ENST00000246533 CABS1Q96KC9 395 aa28.17■■■□□ 2.1
CAPNS1-201ENST00000246533 KIFC3Q9BVG8 833 aa28.17■■■□□ 2.1
CAPNS1-201ENST00000246533 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa28.17■■■□□ 2.1
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