RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000020926.7

SYT13-201, Transcript of synaptotagmin 13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYT13, Length 5,144 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT13-201ENST00000020926 HPCAL4Q9UM19 191 aa16.06■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 SLC8A2Q9UPR5 921 aa16.06■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 DCTN3O75935 186 aa16.05■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 SGPL1O95470 568 aa16.05■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 ITGA4P13612 1032 aa16.05■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 EPHX2P34913 555 aa16.05■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 STAT4Q14765 748 aa16.05■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 OTOP1Q7RTM1 612 aa16.05■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 FEZF2Q8TBJ5 459 aa16.05■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 L2HGDHQ9H9P8 463 aa16.05■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa16.05■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa16.05■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 KNDC1Q76NI1 1749 aa16.05■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 SLITRK3O94933 977 aa16.05■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 CPT1AP50416 773 aa16.05■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 TPI1P60174 286 aa16.05■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 CDR2Q01850 454 aa16.05■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 LRRC14Q15048 493 aa16.05■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 ZNF484Q5JVG2 852 aa16.05■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 LRGUKQ96M69 825 aa16.05■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 SLC38A7Q9NVC3 462 aa16.05■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 GRIK1P39086 918 aa16.05■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 SV2CQ496J9 727 aa16.05■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 ANKMY2Q8IV38 441 aa16.05■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 UBA3Q8TBC4 463 aa16.05■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 EXT2Q93063 718 aa16.05■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 MKL1Q969V6 931 aa16.05■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 SPATC1LQ9H0A9 340 aa16.05■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 DDNO94850 711 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 TAC1P20366 129 aa16.04■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 E2F4Q16254 413 aa16.04■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 DNERQ8NFT8 737 aa16.04■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 SLC5A5Q92911 643 aa16.04■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP16.04■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 SP110Q9HB58 689 aa16.04■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa16.04■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 MX2P20592 715 aa16.04■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 CARSP49589 748 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 LACRTQ9GZZ8 138 aa16.04■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 CARD9Q9H257 536 aa16.04■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 RARRES1P49788 294 aa16.04■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 HSD17B4P51659 736 aa16.04■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 TMC2Q8TDI7 906 aa16.04■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 EHD2Q9NZN4 543 aa16.04■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa16.04■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 ATRNO75882 1429 aa16.04■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 HERVK_113P62684 666 aa16.04■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 MYBPC2Q14324 1141 aa16.04■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 NLRP14Q86W24 1093 aa16.04■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 MAGEB5Q9BZ81 275 aa16.04■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 TRIM67Q6ZTA4 783 aa16.03■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 ZNF507Q8TCN5 953 aa16.03■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 MTMR9Q96QG7 549 aa16.03■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 FAM118BQ9BPY3 351 aa16.03■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 PACSIN1Q9BY11 444 aa16.03■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 MTMR12Q9C0I1 747 aa16.03■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 ANKRD65E5RJM6 399 aa16.03■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 KCNJ1P48048 391 aa16.03■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 SPON2Q9BUD6 331 aa16.03■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP16.03■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 RALAP11233 206 aa16.03■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 CYP4A22Q5TCH4 519 aa16.03■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 MPZL3Q6UWV2 235 aa16.03■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 METTL7BQ6UX53 244 aa16.03■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa16.03■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 PLEKHH3Q7Z736 793 aa16.03■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP16.03■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 NDUFAF2Q8N183 169 aa16.03■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 CEP120Q8N960 986 aa16.03■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 ERP44Q9BS26 406 aa16.03■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa16.03■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa16.03■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 KPNA7A9QM74 516 aa16.03■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 DFFAO00273 331 aa16.03■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa16.03■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa16.03■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 NIPA1Q7RTP0 329 aa16.03■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 TAS1R2Q8TE23 839 aa16.03■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 F8VZ95 297 aa16.02■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 SPAG7O75391 227 aa16.02■□□□□ 0.16
SYT13-201ENST00000020926 CYP11B1P15538 503 aa16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms